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毛乳頭細(xì)胞凝聚性生長差異表達(dá)基因的篩選及HSPC016全長克隆的生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2021-02-03 07:56
  目的 篩選與毛乳頭細(xì)胞 (DPC)凝聚性生長相關(guān)的基因表達(dá) ,全長克隆凝聚性生長相關(guān)基因HSPC0 16并進(jìn)行生物信息學(xué)分析。方法 應(yīng)用抑制性消減雜交技術(shù) ,構(gòu)建DPC凝聚性生長與非凝聚性生長的cDNA消減文庫 ,克隆鑒定凝聚性生長特異表達(dá)基因。應(yīng)用RACE技術(shù) ,克隆DPC凝聚性狀態(tài)下HSPC0 16全長表達(dá)序列 ,使用生物信息學(xué)手段分析其染色體定位、蛋白序列、結(jié)構(gòu)域及功能。結(jié)果 成功構(gòu)建了DPC凝聚性生長差異表達(dá)cDNA文庫 ,篩選出DPC與細(xì)胞同源凝集、生長調(diào)控、分化發(fā)育及信號轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)的基因 ,其中包括HSPC0 16。HSPC0 16全長cDNA為 4 0 0bp ,染色體定位于 3q2 1 31;HSPC0 16蛋白為 6 4aa,結(jié)構(gòu)域?qū)儆赑D0 5 3992家族 ,與T2FA基因功能域同源。結(jié)論DPC凝聚性生長的差異表達(dá)cDNA文庫為進(jìn)一步篩選并克隆DPC凝聚性生長相關(guān)基因奠定了基礎(chǔ) ,也為宏觀分析多基因協(xié)同參與DPC生長調(diào)控和功能發(fā)揮提供了依據(jù)。HSPC0 16的生物信息學(xué)分析顯示此基因與DPC基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)有關(guān) 

【文章來源】:中華醫(yī)學(xué)雜志. 2004,(18)北大核心

【文章頁數(shù)】:5 頁

【文章目錄】:
材料與方法
    一、材料
    二、方法
        1.cDNA消減文庫構(gòu)建及差異表達(dá)基因篩選:
        2.差顯基因HSPC016的全長cDNA克隆:
結(jié)果
    1.DPC培養(yǎng)及總RNA提取:
    2.DPC消減cDNA文庫構(gòu)建、篩選、斑點(diǎn)雜交及測序結(jié)果:
    3.HSPC016基因全長cDNA克隆及生物信息學(xué)分析:
討論


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]二步酶消化法分離人頭皮毛乳頭細(xì)胞[J]. 鐘白玉,楊衛(wèi)兵,楊希川,郝飛,伍津津.  中華皮膚科雜志. 2003(07)
[2]人毛乳頭細(xì)胞凝集性生長差異表達(dá)基因cDNA文庫的構(gòu)建[J]. 宋志強(qiáng),郝飛,楊希川,楊衛(wèi)兵,程波,麥躍,葉慶佾.  第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2003(11)



本文編號:3016163

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