本文關(guān)鍵詞：馬氏珠母貝生長(zhǎng)與生物礦化相關(guān)基因的SNP標(biāo)記開發(fā)，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

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試談馬氏珠母貝生長(zhǎng)與生物礦化相關(guān)基因的SNP標(biāo)記開發(fā)-標(biāo)準(zhǔn)論文格式范例

摘要：馬氏珠母貝(Pinetada martensii Dunker)是我國(guó)主要的海水珍珠生產(chǎn)貝類。提升育珠貝的生長(zhǎng)性狀(如殼高,殼寬和殼厚、殼重和總重)和珍珠質(zhì)分泌性狀(如珍珠層厚度、珍珠質(zhì)量等)是馬氏珠母貝遺傳改良的首要目標(biāo)。而篩選與生長(zhǎng)以及珍珠質(zhì)分泌性狀顯著關(guān)聯(lián)的分子標(biāo)記,用于輔助選擇,是馬氏珠母貝生長(zhǎng)和育珠性狀進(jìn)行有效選擇的高效而可靠的手段與途徑。在探討對(duì)策上,利用畜禽等農(nóng)業(yè)動(dòng)物育種中功能強(qiáng)大的篩選淺析候選基因的“整合信息學(xué)對(duì)策”原理,系統(tǒng)淺析我們建立和獲得的馬氏珠母貝ESTs序列。篩選與生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)的、潛在的候選QTL Gene以及己知生物礦化基因,利用擴(kuò)增重測(cè)序技術(shù),檢測(cè)其上的單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點(diǎn),開發(fā)SNP標(biāo)記;并在馬氏珠母貝野生群體和家系中檢測(cè)其遺傳特性和遺傳方式,進(jìn)而在分離群體中檢測(cè)與生長(zhǎng)和珍珠質(zhì)分泌性狀相關(guān)的SNP標(biāo)記,達(dá)到輔助選育的目的。此外由于其在基因組中分布的豐富性和同一位點(diǎn)雙等位基因的優(yōu)點(diǎn)可使遺傳作圖更加精細(xì)�；赟NP的連鎖圖譜不僅增加了標(biāo)記密度,提供與豐富基因聯(lián)系的物理圖譜,以而有利于遺傳圖譜和物理圖譜的整合;而且為數(shù)量性狀基因座和定位候選基因鑒定提供了精細(xì)圖。本探討對(duì)馬氏珠母貝的EST數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行生物信息學(xué)淺析,獲得與生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)的、潛在的候選QTL Gene或片段,以及已知生物礦化基因序列；據(jù)此設(shè)計(jì)引物174對(duì)。在馬氏珠母貝6個(gè)不同地理群體的12個(gè)個(gè)體中進(jìn)行擴(kuò)增和擴(kuò)增產(chǎn)物重測(cè)序,apgn淺析測(cè)得的序列,在總計(jì)33Kb的馬氏珠母貝測(cè)序基因組中,通過(guò)淺析推斷出354個(gè)SNP位點(diǎn),平均每94bp發(fā)現(xiàn)一個(gè)SNP位點(diǎn)。在所有位點(diǎn)中選擇40個(gè)SNP位點(diǎn),針對(duì)每個(gè)SNP位點(diǎn)設(shè)計(jì)前后端引物,其中27對(duì)引物擴(kuò)增后在聚丙烯酰胺凝膠上呈現(xiàn)單一條帶。為這27個(gè)SNP位點(diǎn)設(shè)計(jì)目標(biāo)SNP位點(diǎn)居中,長(zhǎng)度為20-35bp的探針。PCR反應(yīng)后,用非標(biāo)記探針高分辨率溶解曲線(HRM)的策略檢測(cè)SNP的基因型。在三個(gè)馬氏珠母貝野生群體(popl：2003年采自三亞亞龍灣,pop2：2009年采自三亞安游,pop3：2010年采自三亞南山,每個(gè)群體n=48)和一個(gè)家系(n=48)中,17個(gè)SNP標(biāo)記獲得穩(wěn)定的基因型數(shù)據(jù)。其中一個(gè)標(biāo)記為單態(tài),其余16個(gè)標(biāo)記呈多態(tài)。16個(gè)多態(tài)位點(diǎn)中,位點(diǎn)act在三個(gè)野生群體中都顯著偏離HWE,位點(diǎn)pris-2在第一和第二個(gè)群體中顯著偏

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試談馬氏珠母貝生長(zhǎng)與生物礦化相關(guān)基因的SNP標(biāo)記開發(fā)-標(biāo)準(zhǔn)論文格式范例(2)

離HWE,位點(diǎn)mec-7a在第二、三個(gè)群體顯著偏離HWE,位點(diǎn)hsp-1在第一個(gè)群體中顯著偏離HWE(P0.05并經(jīng)Bonferroni多重比較校正)。其中位點(diǎn)act和mec-7a在偏離的群體中均呈現(xiàn)顯著地雜合子過(guò)剩(P0.01)。而位點(diǎn)act和pris-2在偏離的群體中均呈現(xiàn)顯著的雜合子缺失(P0.01)。這些位點(diǎn)可能主要受到選擇壓力。16個(gè)位點(diǎn)在3個(gè)野生群體的絕大部分個(gè)體中都能正常擴(kuò)增,且三個(gè)群體的整體平均Fst僅為0.0048。說(shuō)明16個(gè)位點(diǎn)上三個(gè)群體間的遺傳差別不顯著。16個(gè)多態(tài)位點(diǎn)中除兩個(gè)位點(diǎn)(mec-7b和ben-1)外,在馬氏珠母貝家系中均有分離。14個(gè)分離中,ddx-23和hsp-1兩個(gè)位點(diǎn)顯著偏離孟德爾遺傳分離比(P0.05)。顯示這兩個(gè)位點(diǎn)受到選擇壓力。鑒于所有的SNP位點(diǎn)來(lái)源于與生長(zhǎng)發(fā)育基因相關(guān)的ESTs序列和貝類生物礦化以及珍珠質(zhì)蛋白基因,對(duì)這些位點(diǎn)進(jìn)一步的與相關(guān)性狀的關(guān)聯(lián)淺析以及在遺傳連鎖圖譜上的定位和QTL淺析都將揭示它們所在基因功能及其作用方式。為馬氏珠母貝分子標(biāo)記輔助育種以及功能基因的相關(guān)探討奠定基礎(chǔ)。 關(guān)鍵詞：馬氏珠母貝