背景:數(shù)據(jù)已經(jīng)成為生物醫(yī)學(xué)發(fā)展的重要驅(qū)動(dòng)力,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)到知識(shí)轉(zhuǎn)化的一個(gè)關(guān)鍵環(huán)節(jié)在于增強(qiáng)數(shù)據(jù)的機(jī)器可理解性。通用數(shù)據(jù)元素(common data element,CDE)的使用是提高機(jī)器對(duì)元數(shù)據(jù)理解的重要手段。隨著生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域可共享的數(shù)據(jù)越來(lái)越多,納入到通用數(shù)據(jù)元素庫(kù)中的數(shù)據(jù)元素也在迅速增長(zhǎng),探討如何提升通用數(shù)據(jù)元素的質(zhì)量對(duì)于促進(jìn)數(shù)據(jù)的整合和共享具有重要的意義。方法:一方面,本研究根據(jù)ISO/IEC 11179標(biāo)準(zhǔn)建立了具有語(yǔ)義支持的CDE表示模型,并在模型的基礎(chǔ)上,構(gòu)建了可共享的、可重用的和具有語(yǔ)義支持的通用數(shù)據(jù)元素庫(kù)。在本部分研究中,首先根據(jù)《國(guó)民體質(zhì)與健康數(shù)據(jù)庫(kù)》初步確定了庫(kù)中的數(shù)據(jù)條,通過(guò)復(fù)用caDSR中的CDE以及新建方式形成CDE數(shù)據(jù)集;然后基于模型實(shí)現(xiàn)了CDE的OWL表示,并且借助于語(yǔ)義網(wǎng)工具實(shí)現(xiàn)了 CDE的質(zhì)量檢查;最后利用圖數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)存儲(chǔ)文件,并提供SPARQL復(fù)雜查詢功能。另一方面,本研究進(jìn)行了生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域元數(shù)據(jù)之間異質(zhì)性的研究,建立了元數(shù)據(jù)之間可兼容性自動(dòng)化的預(yù)測(cè)模型。在本部分研究中,首先從國(guó)際上使用廣泛的公共數(shù)據(jù)庫(kù)NCI caDSR中,選取了與臨床試驗(yàn)關(guān)聯(lián)度較高的流行...

【文章頁(yè)數(shù)】：62 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖２－１通用數(shù)據(jù)元素庫(kù)構(gòu)建方法??Ｆｉｇ．?２－１?Ｍｅｔｈｏｄ?ｏｆ?ＣＤＥ?ｄａｔａｂａｓｅ?ｃｏｎｓｔｒｕｃｔｉｏｎ??

加強(qiáng)了國(guó)內(nèi)項(xiàng)０的數(shù)據(jù)與國(guó)際上其他數(shù)據(jù)庫(kù)之間互操作的能力。??２．２材料和方法??通用數(shù)據(jù)元素庫(kù)的構(gòu)建方法如圖２－１所示。首先在ＩＳ０／ＩＥＣ?１１１７９的基礎(chǔ)上，??構(gòu)建了?ＣＤＥ的具有語(yǔ)義支持的通用表示模型；在模型的基礎(chǔ)上，以《國(guó)民體質(zhì)與??健康數(shù)據(jù)庫(kù)》中的調(diào)查數(shù)據(jù)項(xiàng)為參考，利....

圖２－２語(yǔ)義模型??Ｆｉｇ．?２－２?Ｓｅｍａｎｔｉｃ?Ｍｏｄｅｌ??

?是復(fù)用的ＣＤＩＳＣ?ＭＭＳ中的。所有的類和關(guān)系都有唯一的ＩＲＩ，以滿足ＦＡＩＲ準(zhǔn)則中??的可查詢要素。最后的語(yǔ)義模型可視化圖如

圖2-3OWL結(jié)果文件在Pro峪ge中的截圖展示

使用Ｐｒｏｔ６ｇ６?５．０中的ＨｅｒｍｉＴ推理機(jī)對(duì)ＯＷＬ結(jié)果文件進(jìn)行推理，結(jié)果如圖２－４??所示。左邊圖（Ａ）為本體推理前的結(jié)構(gòu)，右邊圖（Ｂ）為推理后的等級(jí)結(jié)構(gòu)，由圖??２－４可以看出，推理前后的結(jié)構(gòu)一致，說(shuō)明本體內(nèi)部一致性良好。??．▼?？ｏｗｌ：Ｔｈｉｎ。?＾￣＃＂ｏｗＴ：Ｔ....

圖2一5底層數(shù)據(jù)庫(kù)已加載的RDF資源瀏覽界面

２．３．６?ＳＰＡＲＱＬ查詢實(shí)例??以下是一個(gè)具體的查詢實(shí)例，選擇ＳＰＡＲＱＬ節(jié)點(diǎn)??“ｈｔｔｐ：／／ｐｕｒｌ．ｂｍｉｃｃ．ｃｎ／ｏｎｔｏｌｏｇｙ／ＣＤＥＯｖ２”，查詢圖中所有描述對(duì)象是“飲酒??（Ａｌｃｏｈｏｌ）?”的數(shù)據(jù)元素。以下是具體的ＳＰＡＲＱＬ查詢語(yǔ)句：??ＰＲＥＦＩＸ....

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