發(fā)布時(shí)間：2021-06-08 18:37

　　測(cè)序和基因組學(xué)產(chǎn)生的海量數(shù)據(jù)促成了生物信息學(xué)這門(mén)交叉學(xué)科的誕生,它的最終目的就是利用這些數(shù)據(jù)分析和解釋各種生理活動(dòng),而基因表達(dá)和調(diào)控的研究是這門(mén)學(xué)科的重要內(nèi)容。生物體中的新陳代謝和信號(hào)通路,疾病在基因?qū)哟蔚闹虏C(jī)理和對(duì)藥物治療的反饋等都和基因表達(dá)與調(diào)控密切相關(guān)。所以,對(duì)基因表達(dá)與調(diào)控的研究將會(huì)極大地幫助其他方面的研究。本文的主要內(nèi)容如下:為了全面的評(píng)估人類基因表達(dá),我們搜集和篩選了600個(gè)人類微陣列數(shù)據(jù)集,并從4個(gè)維度對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行提取和分類:1)在細(xì)胞、組織或者和器官層次的表達(dá)數(shù)據(jù);2)在胎兒、青年和老年生長(zhǎng)階段的表達(dá)數(shù)據(jù);3)在疾病和健康狀態(tài)下的表達(dá)數(shù)據(jù);4)在不同化學(xué)處理下的時(shí)間序列表達(dá)數(shù)據(jù)。對(duì)于提取的數(shù)據(jù),我們應(yīng)用了2個(gè)統(tǒng)計(jì)方法來(lái)評(píng)估基因的表達(dá),用戶可以在這兩個(gè)方法上設(shè)置不同的閾值,來(lái)得到特異性表達(dá)的基因和看家基因。在生物體中,一般都是由一組基因來(lái)執(zhí)行某種功能。根據(jù)一組基因在不同條件下表達(dá)水平,可以發(fā)掘基因的表達(dá)模式或者所處條件的相似性。針對(duì)我們收集的表達(dá)數(shù)據(jù),我們提供了一組常見(jiàn)的雙向聚類算法,用戶可以根據(jù)自己的需求,選擇不同的數(shù)據(jù)集,算法和參數(shù)來(lái)展開(kāi)研究。最后,我們還開(kāi)發(fā)了一個(gè)基... 

【文章來(lái)源】：天津大學(xué)天津市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：59 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
第一章 緒論
    1.1 研究背景與意義
    1.2 國(guó)內(nèi)外研究現(xiàn)狀
    1.3 本文的主要工作
    1.4 本文的章節(jié)安排
第二章 基因表達(dá)相關(guān)概念和技術(shù)
    2.1 基因表達(dá)和調(diào)控
    2.2 基因表達(dá)的組織層次
    2.3 微陣列技術(shù)
        2.3.1 微陣列技術(shù)概念
        2.3.2 常用微陣列數(shù)據(jù)庫(kù)
        2.3.3 微陣列數(shù)據(jù)格式
    2.4 高通量數(shù)據(jù)質(zhì)量控制
第三章 基因表達(dá)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
    3.1 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)
        3.1.1 數(shù)據(jù)基本信息
        3.1.2 數(shù)據(jù)預(yù)處理
    3.2 統(tǒng)計(jì)分析方法
        3.2.1 余弦法
        3.2.2 信息熵
    3.3 基因表達(dá)分析
        3.3.1 人體器官基因表達(dá)
        3.3.2 人腦內(nèi)各組織基因表達(dá)
        3.3.3 人體腺體基因表達(dá)
        3.3.4 不同生長(zhǎng)階段組織中基因表達(dá)
        3.3.5 兩個(gè)方法參數(shù)對(duì)比
第四章 基因表達(dá)數(shù)據(jù)雙向聚類
    4.1 相關(guān)算法介紹
        4.1.1 均值平方殘差最小化
        4.1.2 貝葉斯雙向聚類
        4.1.3 因子分析雙向聚類
    4.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析與評(píng)估
        4.2.1 結(jié)果評(píng)估方法
        4.2.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析
第五章 平臺(tái)設(shè)計(jì)與實(shí)現(xiàn)
    5.1 平臺(tái)概述
    5.2 平臺(tái)設(shè)計(jì)
        5.2.1 平臺(tái)結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)
        5.2.2 平臺(tái)數(shù)據(jù)庫(kù)設(shè)計(jì)
        5.2.3 平臺(tái)功能設(shè)計(jì)
    5.3 平臺(tái)實(shí)現(xiàn)
        5.3.1 平臺(tái)實(shí)現(xiàn)技術(shù)
        5.3.2 平臺(tái)運(yùn)行環(huán)境
        5.3.3 案例分析
第六章 總結(jié)與展望
    6.1 論文總結(jié)
    6.2 工作展望
參考文獻(xiàn)
發(fā)表論文和參加科研情況說(shuō)明
致謝



本文編號(hào)：3218983