癌癥等復雜疾病一直都是嚴重危害人類身體健康的重要因素。隨著人類后基因組時代的開啟和發(fā)展,大量高通量測序技術被不斷研發(fā)出來,使得生物醫(yī)學的研究逐漸擺脫了傳統研究方法的制約。在此基礎上,依賴于大數據的研究方法也被提出,加快了生物醫(yī)學領域對癌癥等各種復雜疾病的研究進程,其研究方式逐漸從單基因分析向尋找在細胞過程中失調的基因或生物通路轉變。生物通路在人類生命活動中發(fā)揮了重要的作用,其微小的變化在一定程度上可能引起某種癌癥的發(fā)生。生物通路分析已經成為目前癌癥研究的重要方向,目前常用的癌癥通路識別技術主要分為兩大類:基于基因富集分析和基于網絡的通路識別方法,這兩類方法分別根據通路的基因功能和網絡結構來尋找癌癥和通路之間的關聯關系。生物通路擴展也是一類重要的癌癥通路分析方法,主要通過在人類基因網絡中研究與通路密切相關的基因來尋找新興的可能的致病基因,這對于探究癌癥發(fā)生機制、尋找藥物靶點和癌癥早期預測具有非常重要的意義。在此基礎上,本課題提出了一種基于網絡擴展技術的癌癥通路相關成分預測方法,首先構建了乳腺癌數據下的基因共表達網絡作為算法的全局網絡,并從全局和局部兩個角度分析其拓撲性,然后將篩選出的與當... 

【文章來源】：哈爾濱工業(yè)大學黑龍江省 211工程院校 985工程院校

【文章頁數】：67 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第1章 緒論
    1.1 課題背景及研究的目的和意義
    1.2 國內外研究現狀
        1.2.1 癌癥通路相關成分預測的研究現狀
        1.2.2 生物通路可視化方法的研究現狀
    1.3 本文主要研究內容和組織結構
第2章 癌癥相關通路篩選
    2.1 引言
    2.2 癌癥通路相關數據和蛋白網絡
        2.2.1 癌癥數據集
        2.2.2 通路數據集
        2.2.3 蛋白網絡
        2.2.4 數據選取
    2.3 基于GSEA的癌癥相關通路篩選
        2.3.1 GSEA
        2.3.2 癌癥相關通路篩選及結果
    2.4 本章小結
第3章 癌癥通路相關成分預測
    3.1 引言
    3.2 基于網絡擴展技術的癌癥通路相關成分預測
        3.2.1 加權網絡構建和分析
        3.2.2 種子網絡抽取
        3.2.3 基于網絡擴展技術的癌癥通路相關成分預測
    3.3 實驗結果和分析
        3.3.1 加權網絡構建及結果分析
        3.3.2 癌癥通路相關成分預測結果分析
    3.4 本章小結
第4章 生物通路可視化系統
    4.1 引言
    4.2 系統設計與實現
        4.2.1 系統功能設計
        4.2.2 系統實現說明
    4.3 關鍵技術說明
    4.4 數據庫設計
    4.5 詳細功能描述
        4.5.1 檢索模塊
        4.5.2 信息展示模塊
        4.5.3 通路網絡可視化模塊
    4.6 本章小結
結論
參考文獻
致謝


【參考文獻】：
期刊論文
[1]2015年中國惡性腫瘤流行情況分析[J]. 鄭榮壽,孫可欣,張思維,曾紅梅,鄒小農,陳茹,顧秀瑛,魏文強,赫捷.  中華腫瘤雜志. 2019 (01)
[2]結直腸腺癌KRAS基因突變的檢測及其臨床意義[J]. 徐晨,劉亞嵐,黃潔,何德明,侯英勇,紀元,侯君,盧韶華,許建芳,胡沁,石園,趙麗君,譚云山.  中華病理學雜志. 2012 (10)
[3]基因表達譜富集分析方法研究進展[J]. 曹文君,李運明,陳長生.  生物技術通訊. 2008(06)

碩士論文
[1]基于高通量組學數據的癌癥驅動基因和信號通路識別[D]. 楊武.安徽大學 2016
[2]前列腺癌去勢抵抗轉化相關miRNA及其調控網絡的整合分析[D]. 王蘇貴.蘇州大學 2013



本文編號：3159846