[目的]運用第二代測序技術(shù)聯(lián)合TCGA-BLCA數(shù)據(jù)庫,從轉(zhuǎn)錄組層面篩選出膀胱癌預(yù)后相關(guān)的分子標(biāo)記物,并探討其調(diào)控膀胱癌進(jìn)展的可能分子機制。[方法]收集2018年6月到2018年12月期間昆明醫(yī)科大學(xué)第二附屬醫(yī)院泌尿外科行膀胱癌根治性切除術(shù)患者癌組織及癌旁組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,測序結(jié)果聯(lián)合TCGA-BLCA數(shù)據(jù)庫,篩選關(guān)鍵預(yù)后基因,探討這些基因在膀胱癌發(fā)生發(fā)展過程中的分子機制及臨床意義。[結(jié)果]1.篩選出17個關(guān)鍵預(yù)后基因:ACOX2,ACTA2,ADRA2A,ATP1A2,BUB1B,CCL19,CXCL2,FOXM1,ITGA8,MAD2L1,MAP3K20,MCM4,NPR1,ORC1,PLK4,RASGRP2,TGFB3,這些基因主要參與內(nèi)分泌系統(tǒng),信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和細(xì)胞生長/死亡所涉及的通路。2.關(guān)鍵預(yù)后基因FOXM1顯著影響膀胱癌患者總生存和無進(jìn)展生存,差異有統(tǒng)計學(xué)意義（P<0.05）。3.FOXM1的臨床病理特征:FOXM1與臨床變量線性回歸和Logistic回歸均顯示:年齡和分期與FOXM1之間有顯著的關(guān)系（P<0.05）,性別、BMI、吸煙史、每年吸煙包數(shù)、淋巴結(jié)數(shù)... 

【文章來源】：昆明醫(yī)科大學(xué)云南省

【文章頁數(shù)】：61 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖２為膀胱癌組織和癌旁組織總體的差舁表達(dá)分析基因聚類圖，聚類分析??（Ｃｌｕｓｔｅｒ?Ａｎａｌｙｓｉｓ?）是一種研究樣品間分類問題的統(tǒng)計分析方法，可以實現(xiàn)??，

組織表達(dá)量下調(diào)基因，紅色表示為癌組織較癌旁組織表??達(dá)量上調(diào)基因。我們篩選出２０８３個顯著差異表達(dá)基因信號分子，其中１１４４個基??因為癌組織較癌旁組織顯著高表達(dá)，９３９個基因為癌組織較癌旁組織顯著低表??達(dá)。??＾Ｔｍ?ｈ?叫?°°ｗｎ９３？?？?ｉ＾￣Ｕｐ：１１４４??■ａ?ｍ?ｍ?，?ｆｌｉｓｕ０？?ｉ?ｉ?？．：????ａ〇？?？?？?？?ｉ?ｉ?，??醒ＭＭ」＝ｒ?Ｉ??＾?？…負(fù)?ｆ：???ｌｏｇ２（ｆｏｌｄ－ｃｈａｎｇｅ）??圖２．總體的左異農(nóng)達(dá)分析某Ｗ聚類圖?圖３．總體的益異農(nóng)達(dá)分析苺Ｗ火山圖??圖４為不Ｎ病理分期（Ｔ１和Ｔ２?＋?Ｔ３）患者癌組織較癌旁組織基因差異表達(dá)??火山圖，篩選標(biāo)準(zhǔn)如上述，圖４ａ為Ｔ１期患者中共篩選出１７６１個顯著差異表達(dá)??基因，其中１０００個基因為癌組織較癌旁組織顯著高表達(dá)，７６１個基因為癌組織??較癌旁組織顯著低表達(dá)；圖４ｂ為Ｔ２＋Ｔ３期患者中共篩選出１６９８個顯著差異表達(dá)??基因，其中１０７４個基因為癌組織較癌旁組織顯著高表達(dá)，６２４個基因為癌組織??較癌旁組織顯著低表達(dá)。??ｃｏ?■?Ｄｏｗｎ?７６１?Ｊ?Ｊ?Ｕｐ?１０００?４０?■?Ｄｏｗｎ?６２４?｜?Ｊ?Ｕｐ?１０７４??＊ｎ?－?Ｊ?＇?Ｉｒｔ?－??Ｓ：：Ｍ…Ｉ．…．．…＊：：：復(fù)麗—??ｒ－?－?Ｉ?Ｉ?ｆ?－?＊?＊??Ｏ?－?ＩＩ?Ｏ?－?Ｉ?Ｉ??＾?３?－２?１?０?＇?２?Ａ?６?＾?＾?－２?＇?６?＇?ｉ?４?Ｖ??ｌｏｇ２（ｆｏｌｄ－ｃｈａｎｇｅ）?ｌｏｇ２（Ｔｏｌｄ－ｃｈａｎｇｏ）??圖４ａ：?Ｔ】期？ｆ；？蝸異Ｗ

２０８３個顯著差異表達(dá)基因信號分子，其中１１４４個基??因為癌組織較癌旁組織顯著高表達(dá)，９３９個基因為癌組織較癌旁組織顯著低表??達(dá)。??＾Ｔｍ?ｈ?叫?°°ｗｎ９３？?？?ｉ＾￣Ｕｐ：１１４４??■ａ?ｍ?ｍ?，?ｆｌｉｓｕ０？?ｉ?ｉ?？．：????ａ〇？?？?？?？?ｉ?ｉ?，??醒ＭＭ」＝ｒ?Ｉ??＾?？…負(fù)?ｆ：???ｌｏｇ２（ｆｏｌｄ－ｃｈａｎｇｅ）??圖２．總體的左異農(nóng)達(dá)分析某Ｗ聚類圖?圖３．總體的益異農(nóng)達(dá)分析苺Ｗ火山圖??圖４為不Ｎ病理分期（Ｔ１和Ｔ２?＋?Ｔ３）患者癌組織較癌旁組織基因差異表達(dá)??火山圖，篩選標(biāo)準(zhǔn)如上述，圖４ａ為Ｔ１期患者中共篩選出１７６１個顯著差異表達(dá)??基因，其中１０００個基因為癌組織較癌旁組織顯著高表達(dá)，７６１個基因為癌組織??較癌旁組織顯著低表達(dá)；圖４ｂ為Ｔ２＋Ｔ３期患者中共篩選出１６９８個顯著差異表達(dá)??基因，其中１０７４個基因為癌組織較癌旁組織顯著高表達(dá)，６２４個基因為癌組織??較癌旁組織顯著低表達(dá)。??ｃｏ?■?Ｄｏｗｎ?７６１?Ｊ?Ｊ?Ｕｐ?１０００?４０?■?Ｄｏｗｎ?６２４?｜?Ｊ?Ｕｐ?１０７４??＊ｎ?－?Ｊ?＇?Ｉｒｔ?－??Ｓ：：Ｍ…Ｉ．…．．…＊：：：復(fù)麗—??ｒ－?－?Ｉ?Ｉ?ｆ?－?＊?＊??Ｏ?－?ＩＩ?Ｏ?－?Ｉ?Ｉ??＾?３?－２?１?０?＇?２?Ａ?６?＾?＾?－２?＇?６?＇?ｉ?４?Ｖ??ｌｏｇ２（ｆｏｌｄ－ｃｈａｎｇｅ）?ｌｏｇ２（Ｔｏｌｄ－ｃｈａｎｇｏ）??圖４ａ：?Ｔ】期？ｆ；？蝸異Ｗ達(dá)火山圖?（￥）４ｂ：?Ｔ２＋Ｔ３丨Ｗ／ｉＶ打妹卜Ｕ‘異人達(dá)火山閣??１９

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[10]CCNB1在卵巢癌中的表達(dá)及意義[J]. 李莉,熊國平,顏琳,張慶華.  現(xiàn)代婦產(chǎn)科進(jìn)展. 2016(11)

博士論文
[1]泌尿系統(tǒng)相關(guān)腫瘤基因組學(xué)研究[D]. 朱家樓.武漢大學(xué) 2017



本文編號：3139007