發(fā)布時間：2021-03-09 09:28

　　衰老會導(dǎo)致人體系統(tǒng)、器官和組織功能衰減,引發(fā)與衰老相關(guān)的各種重大疾病——包括癌癥、阿茲海默癥、心力衰竭、帕金森氏癥、II型糖尿病、多種心血管疾病、冠心病和骨質(zhì)疏松癥等——的發(fā)生和發(fā)展。小鼠作為一種模式生物,雖然已廣泛用于研究人類疾病,但是在分子水平上,小鼠衰老和人體衰老之間的聯(lián)系仍然需要進一步研究。本文通過比較與年齡相關(guān)的基因表達譜以評估人與小鼠老化的一致性,進而,作者們希望這項研究將有助于研究人員判斷采用小鼠作為模式生物代替人做一些衰老及衰老相關(guān)的疾病和藥物方面的研究是否合理。本文主要在基因表達層面對人和小鼠的衰老基因進行比較研究,主要成果如下:（1）基因表達大數(shù)據(jù)查閱及收集,人和小鼠組織匹配。本文主要采用了 GTEX和GEO兩個基因表達數(shù)據(jù)庫,其中GTEX是最新的與年齡相關(guān)的RNA-Seq數(shù)據(jù)庫,GEO是由NCBI提供的數(shù)據(jù)庫。通過比較收集的數(shù)據(jù),本文匹配了 18對人和小鼠組織。（2）差異基因表達分析。一方面,應(yīng)用DESeq2算法,對從GTEX數(shù)據(jù)庫收集的15個人體組織RNA-Seq基因表達數(shù)據(jù)進行差異分析。另一方面,應(yīng)用CD算法,對從GEO數(shù)據(jù)庫收集的18個小鼠組織和3個人體組織... 

【文章來源】：大連海事大學(xué)遼寧省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：58 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１．?１我國老齡化趨勢??Ｆｉｇ．?１．１?Ａｇｉｎｇ?ｔｒｅｎｄ?ｏｆ?Ｃｈｉｎｅｓｅ??

?人與小鼠衰老相關(guān)基因在不同組織上的比較???２）應(yīng)用Ｆｉｓｈｅｒ精確檢驗，對人和小鼠組織間衰老基因的一致性進行統(tǒng)計學(xué)??檢驗；??３）應(yīng)用ＤＡＶＩＤ（Ｖ６．７）和ＣｌｕｅＧＯ（Ｖ２．５．１）工具，對人和小鼠的衰老基因進行??基因功能富集分析。??第５章，組織間衰老基因的橫向比較。首先，分別篩選人和小鼠組織間一致??的衰老基因。然后，應(yīng)用Ｆｉｓｈｅｒ精確檢驗，對組織間衰老基因的一致性進行統(tǒng)計??學(xué)檢驗。最后，分別橫向比較人和小鼠的４個與腦相關(guān)組織的衰老基因。??第６章，總結(jié)與展望。對本文簡要總結(jié)，并討論進一步的研究工作。??數(shù)據(jù)收集和組織匹配??人?老鼠??ＧＴＥＸ?ＧＥＯ??Ｌ－Ｔ＾?Ｊ?７??－?１５組織?３組織??差異表達分析?＾??年輕?年老??Ｔ???樣本?樣本?Ａｇｉｎｇ?Ｐｅｒｔｕｒｂａｔｉｏｎｓ??￣Ｖ?ＤＥ＾ｅｑ２?ｊ￣?＊?ｆｒｏｍ?ＧＥＯ?ｄｏｗｎ?／ｕｐ??ｍ筆差ｓ］ｊ??�。翰町惐磉_基因????人的差異基因?少鼠的差異基因??衰老基因比較分析??ＨＯＭ＿ＭｏｕｓｅＨｕｍ?’??ａｎＳｅｑｕｅｎｃｅ．ｒｐｔ??！?人的衰老基因?（小鼠的衰老基因????ｖ，??????！?ｊ??｜Ｂ＾Ｈ｜??圖１．２工作流程圖??Ｆｉｇ．?１．２?Ｗｏｒｋｆｌｏｗ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｐｒｏｊｅｃｔ??－６?－??

圖３．１計Ｆｉｇ．?３．】Ｔｒａｎｓｆｏｒｍａｔｉｏｎｓ?ｏｆ?ｒｅａｄｓ?ｃｏｕｎｔ?ｄａｔａ??－１７?－??


本文編號：3072648