基于數(shù)據(jù)挖掘分析c-MET在胰腺癌中的表達(dá)及意義
發(fā)布時(shí)間:2021-02-05 18:46
目的:基于生物信息大數(shù)據(jù)挖掘分析c-MET(c-mesenchymal-epithelial transition)在胰腺癌中的表達(dá)及臨床意義。方法:檢索Oncomine生物信息基因數(shù)據(jù)庫(kù),分析c-MET在胰腺癌中與其他基因共表達(dá)的情況;通過(guò)cBioportal,生物信息基因數(shù)據(jù)庫(kù)分析c-MET的突變頻率、突變位點(diǎn);檢索GEPIA數(shù)據(jù)庫(kù)在不同數(shù)據(jù)庫(kù)中胰腺癌與正常組織中c-MET的表達(dá)情況,分析其與胰腺癌病理分期的關(guān)系,并采用Kaplan-Meier分析c-MET表達(dá)與患者生存期的關(guān)系。免疫組織化學(xué)(IHC)檢測(cè)分析50對(duì)臨床胰腺癌患者癌組織與癌旁組織中c-MET蛋白表達(dá)情況。結(jié)果:實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示前20個(gè)與c-MET共表達(dá)的基因,其最高關(guān)聯(lián)值達(dá)到:0.900;通過(guò)對(duì)5個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中的1034個(gè)樣本進(jìn)行分析后,其突變頻率分別為:2.75%(UTSW),1.08%(TCGA),0.54%(TCGA PanCan),0.22%(QCMG);在胰腺癌樣本中,有9個(gè)非同義突變,其中有5個(gè)位于PKinase domain,分別位于L964M,D1002G,P1060S;GEPIA數(shù)據(jù)庫(kù)的結(jié)果顯示,c-ME...
【文章來(lái)源】:南昌大學(xué)江西省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:40 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
-MET共表達(dá)基因的熱點(diǎn)圖
-MET在不同數(shù)據(jù)庫(kù)的突變頻率
圖 4 c-MET 在不同腫瘤中的表達(dá)情況注:COAD: 結(jié)腸癌、DLBC: 淋巴樣腫瘤彌漫性大 B 細(xì)胞淋巴瘤、LUAD:肺腺癌、OV:卵巢漿液性囊腺瘤、PAAD:胰腺癌、STAD:胃腺癌在前面的檢索分析中發(fā)現(xiàn),c-MET 在包括胰腺癌在內(nèi)的多種類型惡性腫瘤組織中的表達(dá)顯著高于對(duì)應(yīng)的癌旁組織。為進(jìn)一步分析 c-MET 與胰腺癌發(fā)生發(fā)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]HGF/c-MET信號(hào)通路抑制劑在抗胰腺癌中的研究進(jìn)展[J]. 喬銀標(biāo),楊波. 國(guó)際腫瘤學(xué)雜志. 2017 (04)
[2]基于ONCOMINE數(shù)據(jù)庫(kù)分析I型5α還原酶在前列腺癌中的表達(dá)及意義[J]. 許斌,劉寧,陳恕求,姜華,張力杰,張曉文,楊瑜,沙國(guó)柱,柳靖,朱偉東,陳明. 中華男科學(xué)雜志. 2016(09)
[3]胰腺星狀細(xì)胞通過(guò)HGF/c-Met信號(hào)通路調(diào)控胰腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移[J]. 崔英,沈曼茹,顏美珠,黃繼英,唐鄂,安敏,喻青,徐林芳,李曉翠,史先芳,高振軍. 中華胰腺病雜志. 2016 (04)
[4]Bisphosphonates as potential adjuvants for patients with cancers of the digestive system[J]. Celina Ang,Erin Doyle,Andrea Branch. World Journal of Gastroenterology. 2016(03)
[5]基于Oncomine芯片數(shù)據(jù)庫(kù)薈萃分析碳酸酐酶IX在腎細(xì)胞癌中的表達(dá)及意義[J]. 王進(jìn)峰,盧曉明,王禮平,尹九湖,劉亞?wèn)|. 現(xiàn)代泌尿生殖腫瘤雜志. 2015(04)
[6]c-Met signaling in the development of tumorigenesis and chemoresistance: Potential applications in pancreatic cancer[J]. Daniel Delitto,Eva Vertes-George,Steven J Hughes,Kevin E Behrns,Jose G Trevino. World Journal of Gastroenterology. 2014(26)
[7]生物信息學(xué)的現(xiàn)狀與展望[J]. 張春霆. 世界科技研究與發(fā)展. 2000(06)
本文編號(hào):3019401
【文章來(lái)源】:南昌大學(xué)江西省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:40 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
-MET共表達(dá)基因的熱點(diǎn)圖
-MET在不同數(shù)據(jù)庫(kù)的突變頻率
圖 4 c-MET 在不同腫瘤中的表達(dá)情況注:COAD: 結(jié)腸癌、DLBC: 淋巴樣腫瘤彌漫性大 B 細(xì)胞淋巴瘤、LUAD:肺腺癌、OV:卵巢漿液性囊腺瘤、PAAD:胰腺癌、STAD:胃腺癌在前面的檢索分析中發(fā)現(xiàn),c-MET 在包括胰腺癌在內(nèi)的多種類型惡性腫瘤組織中的表達(dá)顯著高于對(duì)應(yīng)的癌旁組織。為進(jìn)一步分析 c-MET 與胰腺癌發(fā)生發(fā)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]HGF/c-MET信號(hào)通路抑制劑在抗胰腺癌中的研究進(jìn)展[J]. 喬銀標(biāo),楊波. 國(guó)際腫瘤學(xué)雜志. 2017 (04)
[2]基于ONCOMINE數(shù)據(jù)庫(kù)分析I型5α還原酶在前列腺癌中的表達(dá)及意義[J]. 許斌,劉寧,陳恕求,姜華,張力杰,張曉文,楊瑜,沙國(guó)柱,柳靖,朱偉東,陳明. 中華男科學(xué)雜志. 2016(09)
[3]胰腺星狀細(xì)胞通過(guò)HGF/c-Met信號(hào)通路調(diào)控胰腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移[J]. 崔英,沈曼茹,顏美珠,黃繼英,唐鄂,安敏,喻青,徐林芳,李曉翠,史先芳,高振軍. 中華胰腺病雜志. 2016 (04)
[4]Bisphosphonates as potential adjuvants for patients with cancers of the digestive system[J]. Celina Ang,Erin Doyle,Andrea Branch. World Journal of Gastroenterology. 2016(03)
[5]基于Oncomine芯片數(shù)據(jù)庫(kù)薈萃分析碳酸酐酶IX在腎細(xì)胞癌中的表達(dá)及意義[J]. 王進(jìn)峰,盧曉明,王禮平,尹九湖,劉亞?wèn)|. 現(xiàn)代泌尿生殖腫瘤雜志. 2015(04)
[6]c-Met signaling in the development of tumorigenesis and chemoresistance: Potential applications in pancreatic cancer[J]. Daniel Delitto,Eva Vertes-George,Steven J Hughes,Kevin E Behrns,Jose G Trevino. World Journal of Gastroenterology. 2014(26)
[7]生物信息學(xué)的現(xiàn)狀與展望[J]. 張春霆. 世界科技研究與發(fā)展. 2000(06)
本文編號(hào):3019401
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