人乳頭瘤病毒（Human papillomavirus,HPV）是一種致癌DNA病毒,是導致尖銳濕疣和子宮頸癌的主要病因。研究表明病毒內的一些基因變異與宮頸癌的持續(xù)感染密切相關,基于臨床突變分析HPV蛋白質的重點功能區(qū)域已成為HPV相關疾病的主要研究方向之一。目前,已發(fā)表的HPV數(shù)據(jù)庫收集整理了 HPV相關的數(shù)據(jù),但還未有HPV突變數(shù)據(jù)庫的報道。本文以HPV的突變、功能結構域、表位為對象,結合臨床疾病信息,構建了 HPV突變數(shù)據(jù)庫以及其分析平臺。具體工作如下:1.綜述了人乳頭瘤病毒和相關疾病的背景知識。簡要介紹人乳頭瘤病毒的分類、結構、功能、突變和表位,相關疾病的感染和預防等;綜述了人乳頭瘤病毒的分型預測模型、國內外HPV相關數(shù)據(jù)庫的研究現(xiàn)狀,為本文后續(xù)的研究工作提供了理論依據(jù)。2.設計了 HPV突變數(shù)據(jù)庫與分析平臺的解決方案。在平臺設計和數(shù)據(jù)庫設計原則的基礎上,對HPV突變數(shù)據(jù)庫與分析平臺進行總體架構設計、數(shù)據(jù)庫存儲方式設計以及平臺界面設計。針對數(shù)據(jù)庫與分析平臺的特殊問題,本文提出了合適的開發(fā)環(huán)境及相應的技術方法。3.構建了宮頸癌HPV突變數(shù)據(jù)庫。收集并整理了 HPV的相關數(shù)據(jù),包括... 

【文章來源】：浙江理工大學浙江省

【文章頁數(shù)】：64 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖３．１．系統(tǒng)功能設計方案??Ｆｉｇｕｒｅ?３．１?Ｓｙｓｔｅｍ?ｆｕｎｃｔｉｏｎ?ｄｅｓｉｇｎ??設計宮頸癌ＨＰＶ突變數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)功能的前提是分析數(shù)據(jù)庫內各類數(shù)據(jù)和內容之間的??

Ｆｉｇｕｒｅ?３．３?Ｓｔｏｒａｇｅ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｄｉａｇｒａｍ?ｏｆ?ｃｅｒｖｉｃａｌ?ｃａｎｃｅｒ?ＨＰＶ?ｍｕｔａｔｉｏｎ?ｄａｔａｂａｓｅ??２４??

例對宮頸癌ＨＰＶ突變分析平合的使用進行說明。??４．１平臺框架設計??宮頸癌ＨＰＶ突變分析平臺的框架設計如圖４．１所示。圖中列出的三類主要數(shù)據(jù)構成??ＨＰＶ突變分析平臺的數(shù)據(jù)基礎，五個功能模塊為ＨＰＶ分析平臺所提供，它們分別是：（ｉ）??突變含量可視化模塊，利用顏色分明的交互式餅圖向用戶展示突變在數(shù)據(jù)庫內所有蛋白質??中的含量、突變在數(shù)據(jù)庫內所有功能域的含量、突變在數(shù)據(jù)庫內Ｔ細胞表位和ＨＬＡ配體??內所占的比例；（Ｈ）突變與功能域關聯(lián)分析視圖模塊，提供了用戶所查詢的蛋白質的基本??信息、蛋白質中己公布的突變信息、蛋白質內的功能域信息、蛋白質序列、二級結構域，??以及它們和突變關聯(lián)的可視化展示；（Ｈｉ）突變與表位關聯(lián)分析視圖模塊，與上個模塊相似，??除了列舉所選蛋白的基本信息、突變信息、序列信息以外，還增加了蛋白質內己鑒定的Ｔ??細胞表位或ＨＬＡ配體信息，以及和突變關聯(lián)的可視化展示；（ｉｖ）序列相似性搜索模塊，??向用戶提供了數(shù)據(jù)庫內的序列相似性搜索功能；（ｖ）ＨＰＶ分型預測模塊

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：2976700