計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)對(duì)FXa抑制劑和苯并噻唑衍生物的研究
發(fā)布時(shí)間:2017-03-30 00:19
本文關(guān)鍵詞:計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)對(duì)FXa抑制劑和苯并噻唑衍生物的研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:凝血因子Xa(FXa)是新的抗凝治療一個(gè)特別有希望的靶標(biāo)。第一種口服Xa因子抑制劑已在歐盟和加拿大于2008年被批準(zhǔn)上市。在本文中,38個(gè)[6,6,5]三環(huán)稠合的惡唑烷酮類分子采用3D-QSAR(三維定量構(gòu)效關(guān)系)、分子對(duì)接、分子動(dòng)力學(xué)和Topomer CoMFA來建立三維構(gòu)效關(guān)系模型。CoMFA(比較分子場(chǎng)分析)模型的q2=0.511和tr=0.984,COMSIA(比較分子相似性分析)模型的q2=0.700和r2=0.993,Topomer CoMFA模型的q2=0.377和r2=0.886。結(jié)果表明立體場(chǎng)、疏水場(chǎng)、氫鍵受體場(chǎng)和靜電場(chǎng)在模型中發(fā)揮關(guān)鍵作用。分子對(duì)接和分子動(dòng)力學(xué)探索了配體和受體蛋白之間相互作用的機(jī)制。苯并噻唑是一個(gè)重要的藥效結(jié)構(gòu),在醫(yī)藥領(lǐng)域有著廣泛的應(yīng)用。苯并噻唑2-取代化合物對(duì)人肝癌細(xì)胞HepG2有著一定的抗增殖活性。在本文中,對(duì)31個(gè)苯并噻唑衍生物采用了3D-QSAR和Topomer CoMFA來建立三維構(gòu)效關(guān)系模型。CoMFA模型的q2=0.653和r2=0.921,COMSIA模型的q2=0.708和r2=0.917,Topomer CoMFA模型的q2=0.386和r2=0.649。計(jì)算結(jié)果表明: (1)較大的R1基團(tuán)和較小的R2基團(tuán)有利于活性;(2)R2基團(tuán)可以通過在4-和6-取代位引入疏水性基團(tuán)來提高活性。這些結(jié)果都表明了3D-QSAR模型是可靠的,可以用來預(yù)測(cè)新化合物的活性。
【關(guān)鍵詞】:計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì) 三維定量構(gòu)效關(guān)系 FXa抑制劑 苯并噻唑衍生物 HepG2
【學(xué)位授予單位】:上海應(yīng)用技術(shù)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:TQ460.1;TP391.7
【目錄】:
- 摘要5-6
- Abstract6-9
- 第1章 文獻(xiàn)綜述9-16
- 1.1 血栓9
- 1.2 抗血栓藥物9-12
- 1.2.1 溶血栓藥物9
- 1.2.2 抗血小板藥物9-11
- 1.2.2.1 ADP受體拮抗劑9-10
- 1.2.2.2 GPⅡb/Ⅲa受體拮抗劑10
- 1.2.2.3 花生四稀酸代謝途徑的抑制劑10
- 1.2.2.4 增加血小板內(nèi)環(huán)磷酸腺苷(cAMP)的藥物10-11
- 1.2.3 抗凝血藥物11-12
- 1.2.3.1 肝素類11
- 1.2.3.2香豆素類11
- 1.2.3.3 直接凝血酶抑制劑11
- 1.2.3.4 Xa因子抑制劑11-12
- 1.3 計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)12-15
- 1.3.1 定量構(gòu)效關(guān)系13
- 1.3.2 藥效團(tuán)模型13-14
- 1.3.3 分子對(duì)接14
- 1.3.4 分子動(dòng)力學(xué)模擬14-15
- 1.4 本文的研究?jī)?nèi)容和意義15-16
- 第2章 FXa抑制劑的分子模擬研究16-36
- 2.1 數(shù)據(jù)來源和研究方法16-22
- 2.1.1 數(shù)據(jù)來源16-18
- 2.1.2 建立模型18-20
- 2.1.3 分子對(duì)接20-22
- 2.1.4 分子動(dòng)力學(xué)模擬22
- 2.2 結(jié)果與討論22-34
- 2.2.1 模型結(jié)果分析22-30
- 2.2.1.1 3D-QSAR模型結(jié)果分析22-28
- 2.2.1.2 Topomer CoMFA模型結(jié)果分析28-29
- 2.2.1.3 藥效團(tuán)模型分析29-30
- 2.2.2 分子對(duì)接結(jié)果分析30-32
- 2.2.3 分子動(dòng)力學(xué)結(jié)果分析32-34
- 2.3 本章小結(jié)34-36
- 第3章 苯并噻唑衍生物的分子模擬研究36-46
- 3.1 研究背景36
- 3.2 數(shù)據(jù)來源和研究方法36-39
- 3.2.1 數(shù)據(jù)來源36-38
- 3.2.2 建立模型38-39
- 3.2.2.1 3D-QSAR模型結(jié)果分析38
- 3.2.2.2 Topomer CoMFA模型結(jié)果分析38-39
- 3.3 結(jié)果與討論39-45
- 3.3.1 3D-QSAR模型結(jié)果分析39-44
- 3.3.2 Topomer CoMFA模型結(jié)果分析44-45
- 3.4 本章小結(jié)45-46
- 第4章 全文總結(jié)46-47
- 參考文獻(xiàn)47-53
- 致謝53-54
- 攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文54
本文關(guān)鍵詞:計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)對(duì)FXa抑制劑和苯并噻唑衍生物的研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號(hào):275783
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