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基于LGE-MRI的心室瘢痕組織分割系統(tǒng)設(shè)計(jì)與實(shí)現(xiàn)

發(fā)布時(shí)間:2019-01-05 11:16
【摘要】:目前,全球死亡的主要原因是缺血性心臟病,臨床常規(guī)的心臟磁共振成像診斷技術(shù),可以全面提供心臟組織關(guān)于形態(tài)學(xué),組織表征,血流或灌注等信息,LGE-MRI(晚釓增強(qiáng)磁共振成像)是目前用于評(píng)估心肌活性的金標(biāo)準(zhǔn)。損傷組織根據(jù)T1加權(quán)成像,使造影劑出現(xiàn)不同程度的累積導(dǎo)致不同的增強(qiáng)效果,壞死組織具有高信號(hào)強(qiáng)度,而心肌的邊界幾乎不增強(qiáng)。已有研究表明LGE-MRI成像用于指導(dǎo)心肌梗死疾的預(yù)后管理治療的可行性,要實(shí)施這些發(fā)展起來(lái)的成像技術(shù),必須實(shí)現(xiàn)心肌梗死區(qū)域的重復(fù)和可靠分割。因此本文基于具有評(píng)估策略的數(shù)據(jù)集進(jìn)行心室瘢痕組織分割系統(tǒng)的設(shè)計(jì)。由于LGE-MRI成像過(guò)程會(huì)受到潛在的外界噪聲干擾,因此圖像分割前的平滑預(yù)處理步驟十分關(guān)鍵,本文首先對(duì)基準(zhǔn)圖像數(shù)據(jù)中手動(dòng)分割出的心肌圖像文件和心肌瘢痕圖像文件的灰度分布進(jìn)行特征提取,并對(duì)心肌圖像應(yīng)用了高斯濾波、雙邊濾波和基于形態(tài)學(xué)開(kāi)閉運(yùn)算的噪聲平滑技術(shù),得出經(jīng)形態(tài)學(xué)濾波處理的圖像更能有效保留圖像邊緣。考慮到獲得的數(shù)據(jù)集中手工劃分出的心室內(nèi)外膜邊界區(qū)域可能會(huì)因?yàn)獒t(yī)生先驗(yàn)知識(shí)的不足而導(dǎo)致心肌邊緣的錯(cuò)分,因此本文對(duì)基于灰度修正的圖像預(yù)處理過(guò)程進(jìn)行了實(shí)現(xiàn),并將灰度修正預(yù)處理方法應(yīng)用于后文提出的區(qū)域生長(zhǎng)分割,對(duì)經(jīng)灰度修正預(yù)處理前后區(qū)域生長(zhǎng)分割的心肌瘢痕分割結(jié)果進(jìn)行了定量分析,實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證表明灰度修正能夠有效提高分割算法的性能。本文用于系統(tǒng)集成的分割方法主要包括Level Set(水平集)、Graph Cuts(圖割)、WaterShed(分水嶺)和區(qū)域生長(zhǎng)分割算法來(lái)實(shí)現(xiàn)心肌瘢痕組織的分割,每一種分割算法的具體實(shí)現(xiàn)均融合了不同的圖像預(yù)處理過(guò)程。針對(duì)分割算法性能的評(píng)估,本文采用了實(shí)驗(yàn)分析的方法,分別從Dice指數(shù)、Jaccard系數(shù)、Ravd系數(shù)和精召率等多個(gè)評(píng)價(jià)指標(biāo)來(lái)對(duì)各分割算法的分割結(jié)果與手動(dòng)分割出的金標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行比較。各分割算法性能評(píng)估結(jié)果表明,融合了灰度修正的GraphCuts方法與基準(zhǔn)分割能夠達(dá)到更好的一致性。本文分割系統(tǒng)的設(shè)計(jì)主要包括LGE-MRI圖像的文件管理、LGE-MRI圖像的降噪預(yù)處理、心室瘢痕組織的分割、基于體繪制方法的三維成像顯示,以及各分割算法分割結(jié)果的定量分析和直方圖統(tǒng)計(jì)分析。
[Abstract]:At present, the main cause of death in the world is ischemic heart disease, clinical conventional cardiac magnetic resonance imaging diagnosis technology, can provide a comprehensive heart tissue about morphology, tissue characterization, blood flow or perfusion and other information. LGE-MRI (late gadolinium enhanced magnetic resonance imaging) is the current gold standard for assessing myocardial activity. According to T1-weighted imaging of injured tissue, the accumulation of contrast agent in different degree leads to different enhancement effect. The necrotic tissue has high signal intensity, but the boundary of myocardium is hardly enhanced. It has been shown that LGE-MRI imaging is feasible to guide the prognosis management of myocardial infarction disease. In order to implement these developed imaging techniques, repeated and reliable segmentation of myocardial infarction area must be realized. Therefore, the system of ventricular scar tissue segmentation is designed based on the data set with evaluation strategy. Because the LGE-MRI imaging process will be disturbed by the potential external noise, the smoothing preprocessing step before image segmentation is very important. In this paper, firstly, the grayscale distribution of the myocardial image file and the myocardial scar image file are extracted, and Gao Si filter is applied to the myocardial image. Bilateral filtering and noise smoothing technology based on morphological open and close operation show that the image processed by morphological filtering is more effective to preserve the edge of the image. Considering that the boundary region of ventricular inner and outer membrane can be divided manually by the acquired data set, the defect of medical prior knowledge may lead to the misclassification of myocardial edge, so the image preprocessing process based on gray correction is implemented in this paper. The gray correction pretreatment method is applied to the region growth segmentation proposed later. The segmentation results of myocardial scar growth before and after the gray correction pretreatment are quantitatively analyzed. Experimental results show that gray level correction can effectively improve the performance of the segmentation algorithm. In this paper, the segmentation methods for system integration mainly include Level Set (horizontal set), Graph Cuts (map cut), WaterShed (watershed) and region growth segmentation algorithm to achieve myocardial scar tissue segmentation. The implementation of each segmentation algorithm integrates different image preprocessing processes. In order to evaluate the performance of the segmentation algorithm, this paper uses the method of experimental analysis, from the Dice index, Jaccard coefficient, Ravd coefficient and precision rate and other evaluation indicators to compare the segmentation results of each segmentation algorithm with the gold standard of manual segmentation. The performance evaluation results of each segmentation algorithm show that the fusion of gray level modified GraphCuts method and benchmark segmentation can achieve better consistency. The design of this segmentation system mainly includes the file management of LGE-MRI image, the pre-processing of LGE-MRI image, the segmentation of ventricular scar tissue, and the 3D imaging display based on volume rendering method. Quantitative analysis and histogram statistical analysis of segmentation results of each segmentation algorithm.
【學(xué)位授予單位】:哈爾濱工業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:R445.2;TP391.41

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本文編號(hào):2401711

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