本文選題：生物分子 + D可視化　； 參考：《華中科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版)》2017年04期

【摘要】：為了克服Jmol等傳統(tǒng)工具在序列信息參照方式方面存在的缺陷,提出并實(shí)現(xiàn)了一種利用序列文本動(dòng)態(tài)參照協(xié)助生物分子3D結(jié)構(gòu)觀察的方法.該方法利用Javascript,Frame,DIV,CSS,PHP和MySQL等Web相關(guān)技術(shù),在Jmol基礎(chǔ)上進(jìn)行功能拓展.首先,分子序列文本與3D結(jié)構(gòu)同時(shí)顯示,且隨著各種針對局部片段的操作同步發(fā)生變化.通過對序列文本特定編排以方便對局部片段的查看和定位,且利用下劃線、刪除線、上劃線等多種文本樣式及其配色來直觀地表示多種局部操作結(jié)果狀態(tài).此外,還提供了多個(gè)序列片段的集中顯示、歷史操作狀態(tài)的切換、當(dāng)前狀態(tài)的服務(wù)器保存等輔助功能.該方法在實(shí)際應(yīng)用中取得了較好效果,有助于提升生物分子序列和結(jié)構(gòu)相關(guān)生物信息的整合、模擬和可視化水平.
[Abstract]:In order to overcome the defects of traditional tools such as Jmol in the reference mode of sequence information, a method of using dynamic reference of sequence text to assist in 3D structure observation of biomolecules is proposed and implemented. In this method, the functions of Jmol are extended based on the Web related techniques, such as Web and MySQL. First, the molecular sequence text is displayed simultaneously with 3D structure, and changes synchronously with various operations for local fragments. By arranging the sequence text specifically to facilitate the viewing and locating of local segments, and by using a variety of text styles, such as underline, delete line, line on the line, and their color matching, we can intuitively express the state of various local operation results. In addition, some auxiliary functions are provided, such as the centralized display of multiple sequence fragments, the switching of the historical operation state, the server saving of the current state, and so on. The method has achieved good results in practical application and is helpful to improve the level of integration, simulation and visualization of biomolecules and structure-related biological information.
【作者單位】： 華中科技大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;華中科技大學(xué)教育部分子生物物理重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;華中科技大學(xué)科技部基因工程國際合作基地;中南民族大學(xué)電子信息工程學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(81373379) 科技部國際科技合作重點(diǎn)資助項(xiàng)目(2009DFB30340) 國家科技重大專項(xiàng)資助項(xiàng)目(2016ZX08010004-004) 湖北省自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(2012FFB07402) 中南民族大學(xué)中央高校基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)專項(xiàng)資金資助項(xiàng)目(CZY12004)
【分類號】：TP391.41

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本文編號：1817015