本文關(guān)鍵詞：基于藥物靶點從傳統(tǒng)中藥庫中高通量虛擬篩選HIV-1整合酶抑制劑　出處：《中國實驗方劑學(xué)雜志》2016年19期 　論文類型：期刊論文

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【摘要】：目的:運用虛擬篩選技術(shù)從傳統(tǒng)中藥數(shù)據(jù)庫(traditional Chinese medicine database platform,TCMSP)中尋找HIV-1整合酶的中藥小分子抑制劑。方法:以整合酶與細(xì)胞因子LEDGF/P75相互作用位點為靶點,運用分子對接技術(shù)進(jìn)行首輪篩選,然后運用ADME/T預(yù)測進(jìn)行第二輪篩選,最后基于靶點與藥物相互作用位點進(jìn)行第三輪篩選。結(jié)果:以原配體(4-[(5-bromo-4-{[2,4-dioxo-3-(2-oxo-2-phenylethyl)-1,3-thiazolidin-5-ylidene]methyl}-2-ethoxyphenoxy)-methyl]-benzoic acid,D77)為陽性對照,篩選出2個類藥性良好的天然小分子化合物,二者與HIV-1整合酶親和力及相互作用基團(tuán)均優(yōu)于D77(新型的HIV-1整合酶抑制劑),并且確定了它們的中草藥來源。結(jié)論:成功建立一整套高通量虛擬篩選HIV-1整合酶抑制劑的策略,該研究結(jié)果可促進(jìn)從傳統(tǒng)中藥庫中提取、設(shè)計以及實驗合成新的抗艾滋病藥物。
[Abstract]:Objective: to use virtual screening technology to search for traditional Chinese medicine database platform (TCMSP) in order to search for a small molecule inhibitor of HIV-1 integrase. Methods: Taking the interaction site of integrase and cytokine LEDGF/P75 as the target, we used molecular docking technology to conduct the first round screening, and then used ADME/T prediction to conduct the second round of screening. Finally, based on the third round screening of target drug interaction sites. Results: the primary ligand (4-[(5-bromo-4-{[2,4-dioxo-3- (2-oxo-2-phenylethyl) -1,3-thiazolidin-5-ylidene]methyl}-2-ethoxyphenoxy) -methyl]-benzoic acid, D77) as a positive control, screened 2 drug like natural small molecular compounds with good, two HIV-1 integrase affinity and interaction group were better than D77 (HIV-1 integrase inhibitors model), and determine the they are the source of herbal medicine. Conclusion: we successfully established a set of high-throughput virtual screening strategy for HIV-1 integrase inhibitors, which can promote the extraction, design and synthesis of new anti AIDS drugs from traditional Chinese medicine libraries.
【作者單位】： 陜西中醫(yī)藥大學(xué);西北大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【分類號】：R914.2
【正文快照】： [網(wǎng)絡(luò)出版地址]http://www.cnki.net/kcms/detail/11.3495.R.20160804.1048.022.html[網(wǎng)絡(luò)出版時間]2016-08-04 10:48目前,30多種抗艾滋病藥物已被美國食品和藥物管理局(FDA)批準(zhǔn)用于臨床,由此產(chǎn)生了多種藥物聯(lián)合使用的高效抗逆轉(zhuǎn)錄病毒治療(highly activeanti-retroviral the

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