發(fā)布時(shí)間：2017-11-02 06:07

  本文關(guān)鍵詞：基于高通量計(jì)算平臺的過渡態(tài)搜索算法及自動(dòng)流程實(shí)現(xiàn)

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【摘要】：本文針對尋找反應(yīng)過程中過渡態(tài)結(jié)構(gòu)的問題,基于高通量計(jì)算平臺設(shè)計(jì)并實(shí)現(xiàn)了一種過渡態(tài)搜索算法及其自動(dòng)計(jì)算流程。實(shí)現(xiàn)了包括中間結(jié)構(gòu)自動(dòng)產(chǎn)生功能在內(nèi)的過渡態(tài)搜索的自動(dòng)流程計(jì)算,具體包括計(jì)算的準(zhǔn)備文件產(chǎn)生、結(jié)構(gòu)篩選、結(jié)果后處理等各個(gè)流程。同時(shí),在整個(gè)自動(dòng)計(jì)算過程中還引入自動(dòng)糾錯(cuò)機(jī)制,可以實(shí)現(xiàn)自動(dòng)根據(jù)錯(cuò)誤類型實(shí)現(xiàn)對錯(cuò)誤的恢復(fù)與處理功能,以提高過渡態(tài)搜索計(jì)算的可靠性。最后,本文進(jìn)行了H原子在Mg晶體表面擴(kuò)散的研究,將計(jì)算結(jié)果與文獻(xiàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行了對照,以驗(yàn)證計(jì)算結(jié)果的合理性。
【作者單位】： 中國科學(xué)院計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)信息中心;中國科學(xué)院大學(xué);
【關(guān)鍵詞】： 過渡態(tài)搜索 自動(dòng)計(jì)算流程 第一性原理計(jì)算 MatCloud
【基金】：國家自然科學(xué)基金(11547177,11534012)
【分類號】：TP391.3
【正文快照】： 算法及其自動(dòng)計(jì)算流程。實(shí)現(xiàn)了包括中間結(jié)構(gòu)自動(dòng)產(chǎn)生功能在內(nèi)的過渡態(tài)搜索的自動(dòng)流程計(jì)算,具體包括計(jì)算的準(zhǔn)備文件產(chǎn)生、結(jié)構(gòu)篩選、結(jié)果后處理等各個(gè)流程。同時(shí),在整個(gè)自動(dòng)計(jì)算過程中還引入自動(dòng)糾錯(cuò)機(jī)制,可以實(shí)現(xiàn)自動(dòng)根據(jù)錯(cuò)誤類型實(shí)現(xiàn)對錯(cuò)誤的恢復(fù)與處理功能,以提高過渡態(tài)搜索

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本文編號：1130281