不同農(nóng)田土壤微生物群落對(duì)石油污染及種植刺槐的響應(yīng)
本文關(guān)鍵詞:不同農(nóng)田土壤微生物群落對(duì)石油污染及種植刺槐的響應(yīng),,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:土壤是農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的基礎(chǔ),當(dāng)土壤受到石油污染后,土壤功能下降,農(nóng)作物的生長(zhǎng)和土壤微生物都會(huì)受到嚴(yán)重危害。土壤微生物是土壤形成、生物地球化學(xué)循環(huán)、污染物質(zhì)降解的主要參與者,它是影響土壤生態(tài)過(guò)程的一個(gè)重要因素。研究農(nóng)田土壤微生物對(duì)石油污染的響應(yīng)對(duì)探索農(nóng)田生態(tài)系統(tǒng)功能和促進(jìn)土壤的可持續(xù)利用具有重要的意義。本論文從全國(guó)21個(gè)地點(diǎn)采集農(nóng)田土壤,分別對(duì)土壤進(jìn)行4種處理:加水保育、石油污染、種植刺槐、石油污染+種植刺槐,溫室培養(yǎng)60天,利用16S rRNA Miseq高通量測(cè)定土壤細(xì)菌群落,分析不同處理的土壤細(xì)菌群落的多樣性和群落組成,比較處理間細(xì)菌群落的差異,闡明響應(yīng)石油污染的農(nóng)田土壤微生物群落變化,同時(shí),利用種植刺槐捕捉土壤中的根瘤菌,探究石油污染土壤刺槐共生根瘤菌的多樣性及其對(duì)共生根瘤菌的選擇。主要的結(jié)果如下:通過(guò)高通量測(cè)序,從105個(gè)土壤樣品共得到3489918條高質(zhì)量序列,6698個(gè)OTUs,這些OTUs分布在39種門(mén),120種綱,174種目,226種科,260種屬中。其中,主要包括細(xì)菌4個(gè)門(mén),分別是Proteobacteria、Actinobacteria、Acidobacteria和Chloroflexi;古細(xì)菌中Crenarchaeota門(mén)中的Nitrososphaera屬是主要類(lèi)群(0.19%)。對(duì)微生物群落組成進(jìn)行分析,結(jié)果表明不同的土壤處理對(duì)土壤細(xì)菌群落的α多樣性與β多樣性具有顯著的影響。經(jīng)過(guò)石油污染處理后,土壤中細(xì)菌的多樣性降低,且群落結(jié)構(gòu)發(fā)生顯著改變。與原始土壤各組富集的OTUs類(lèi)型相比,各處理OTUs的組成和豐度顯著不同,其中石油污染與石油污染+種刺槐處理組中富集的類(lèi)群大多都能參與石油降解過(guò)程。在石油污染和未污染的土壤中種植刺槐,結(jié)果共捕捉得到的61株根瘤菌,16S rDNA序列分析表明這些根瘤菌屬于4個(gè)屬Rhizobium、Shinella、Sinorhizobium和Mesorhizobium。其nodA基因與Mesorhizobium、Sinorhizobium和Rhizobium三個(gè)屬接近;nodC基因和Rhizobium leguminosarum系統(tǒng)發(fā)育距離最近。固氮基因nifH與nodA基因分析結(jié)果相似。將21個(gè)地點(diǎn)視為整體來(lái)看,石油對(duì)刺槐根瘤菌多樣性無(wú)顯著影響。針對(duì)各點(diǎn)具體分析,發(fā)現(xiàn)在三個(gè)地點(diǎn)石油顯著改變根瘤菌的共生。本試驗(yàn)研究了多個(gè)地點(diǎn)農(nóng)田土壤微生物群落響應(yīng)石油污染和植物種植的變化,揭示了石油-植物復(fù)合體系對(duì)農(nóng)田生態(tài)系統(tǒng)微生物組成及結(jié)構(gòu)的影響,為預(yù)測(cè)大區(qū)域土壤污染后,農(nóng)田土壤微生物的響應(yīng)及種植植物后微生物群落的變化等提供基本線索,為農(nóng)田土壤石油污染修復(fù)提供相關(guān)微生物多樣性資源和基因水平上的微生態(tài)信息。
【關(guān)鍵詞】:農(nóng)田土壤 石油污染 微生物群落 根瘤菌
【學(xué)位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類(lèi)號(hào)】:X53;S792.27;S154.3
【目錄】:
- 摘要5-7
- Abstract7-11
- 第一章 綜述11-25
- 1.1 土壤受石油污染現(xiàn)狀及危害11-13
- 1.1.1 石油污染及危害11
- 1.1.2 我國(guó)耕地污染現(xiàn)狀11-12
- 1.1.3 土壤微生物重要性12-13
- 1.2 石油污染研究現(xiàn)狀13-16
- 1.2.1 石油污染對(duì)微生物群落的影響13-14
- 1.2.2 石油降解菌的研究14-15
- 1.2.3 微生物的降解功能基因研究15-16
- 1.3 石油污染的修復(fù)16-17
- 1.4 微生物生態(tài)的研究方法17-19
- 1.4.1 平板培養(yǎng)觀察17
- 1.4.2 BIOLOG鑒定系統(tǒng)17
- 1.4.3 分子生物學(xué)技術(shù)17-18
- 1.4.4 宏基因組18-19
- 1.5 微生物生態(tài)中常用的多元統(tǒng)計(jì)方法19-23
- 1.5.1 探索性途徑19-20
- 1.5.2 解釋性途徑20-22
- 1.5.3 差異方法22-23
- 1.6 研究目標(biāo)23-24
- 1.7 技術(shù)路線24-25
- 第二章 石油污染對(duì)農(nóng)田土壤微生物群落的影響25-42
- 2.1 材料與方法25-29
- 2.1.1 采樣25-26
- 2.1.2 人工模擬石油污染26
- 2.1.3 刺槐種子的催芽26
- 2.1.4 試驗(yàn)處理26-27
- 2.1.5 土壤理化性質(zhì)測(cè)定27
- 2.1.6 取樣及土壤DNA的提取27-28
- 2.1.7 MiSeq焦磷酸高通量測(cè)序28
- 2.1.8 16S rRNA擴(kuò)增測(cè)序分析28-29
- 2.1.9 高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析29
- 2.2 結(jié)果與分析29-40
- 2.2.1 各地土壤理化性質(zhì)29-31
- 2.2.2 不同處理的微生物群落組成31-32
- 2.2.3 不同處理對(duì)土壤中微生物群落的多樣性的影響32-40
- 2.3 討論40-42
- 第三章 石油污染脅迫對(duì)刺槐根瘤菌多樣性及共生的影響42-62
- 3.1 材料與方法43-46
- 3.1.1 刺槐種子的萌發(fā)43
- 3.1.2 收集植物及根瘤43
- 3.1.3 根瘤菌菌株的分離43
- 3.1.4 根瘤菌DNA的提取43-44
- 3.1.5 根瘤菌 16S rDNA、nodA、nodC、nif H基因的擴(kuò)增鑒定44-45
- 3.1.6 結(jié)瘤試驗(yàn)45-46
- 3.2 結(jié)果與分析46-59
- 3.2.1 植物數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)46
- 3.2.2 根瘤菌 16S rDNA系統(tǒng)發(fā)育地位46-50
- 3.2.3 捕捉得到根瘤菌地理分布50-51
- 3.2.4 根瘤菌結(jié)瘤基因系統(tǒng)發(fā)育51-55
- 3.2.5 根瘤菌固氮基因系統(tǒng)發(fā)育55
- 3.2.6 結(jié)瘤試驗(yàn)結(jié)果55-57
- 3.2.7 石油污染下刺槐對(duì)根瘤菌的選擇57-59
- 3.3 討論59-62
- 總結(jié)和展望62-63
- 參考文獻(xiàn)63-71
- 致謝71-72
- 作者簡(jiǎn)介72
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