哈茨木霉菌拮抗辣椒疫霉的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究
發(fā)布時(shí)間:2021-07-02 14:23
農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中由于化肥農(nóng)藥的過(guò)度使用,導(dǎo)致生態(tài)環(huán)境污染、種植地土壤板結(jié)退化、農(nóng)產(chǎn)品農(nóng)藥殘留高、產(chǎn)品質(zhì)量下降等問(wèn)題日漸嚴(yán)重,選擇高效安全的生防菌劑取代化學(xué)防治可以很好地解決上述問(wèn)題。木霉屬(Trichoderma spp.)真菌具有極強(qiáng)大的分泌生物防治活性物質(zhì)能力,能夠拮抗多種植物病原真菌,已被廣泛應(yīng)用于農(nóng)業(yè)生物防控。然而,木霉菌發(fā)揮生防作用的分子機(jī)制尚未明確,這極大地限制了木霉菌的工業(yè)化發(fā)展。隨著木霉基因組的測(cè)序完成,基于轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)挖掘木霉菌生防功能基因成為一種有效的手段,研究木霉菌拮抗作用的分子機(jī)理,有助于對(duì)植物病原菌進(jìn)行高效的生物防治,減少農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)損失。本研究以貴州地區(qū)分離得到的木霉菌材料,將分離菌株與辣椒疫霉(Phytophthora capsici)對(duì)峙培養(yǎng),檢測(cè)其抑菌效果,觀察拮抗條件下相關(guān)生理生化指標(biāo)的變化,篩選出1株拮抗效果較好的哈茨木霉菌株。通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析比較哈茨木霉菌拮抗辣椒疫霉前(3d)、中(5d)、后(7d)不同時(shí)期的顯著差異表達(dá)和可變剪接基因的功能,進(jìn)一步探究哈茨木霉菌拮抗性狀相關(guān)代謝的調(diào)控途徑,為揭示木霉菌生防作用的分子機(jī)制奠定基礎(chǔ)。研究?jī)?nèi)容和結(jié)果如下;1、...
【文章來(lái)源】:貴州大學(xué)貴州省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:138 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
木霉菌菌株進(jìn)化關(guān)系圖(Mukherjee,etal.,2013)
圖 1.2 基因可變剪輯的類型(引自周冬虎等,2015)Fig. 1.2 The type of gene that forms alternative splicing量測(cè)序技術(shù)在整個(gè)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(RNA-Seq)中的發(fā)展促進(jìn)了人(AS)的理解。RNA-Seq 數(shù)據(jù)可以通過(guò)跨越內(nèi)含子的 read別內(nèi)含子,這對(duì)鑒定基因的內(nèi)含子和剪接多樣性有著重要價(jià)中有數(shù)千個(gè)可變剪接事件被發(fā)現(xiàn),甚至于有數(shù)十個(gè)剪接事件是子進(jìn)行連(Cloonan, et al.,2008)。不只是高等真核生物,即有大量可變剪接事件通過(guò) RNA-Seq 被發(fā)現(xiàn)(Zhao, et al., 201達(dá)不論是在物種之間還是在組織個(gè)體之間都存在超乎想象的 分析顯示,人類多順?lè)醋涌勺兗艚樱ˋS)基因的比例在人類(Pan Q, et al,. 2008; Wang ,et al,.2008)在水稻中為 42.4%(Z擬南芥中為 61%(Marquez,et al,. 2012)。最近一項(xiàng)針對(duì) 23
2019 屆碩士研究生畢業(yè)論文變化現(xiàn)象。2.7 哈茨木霉菌拮抗辣椒疫霉菌的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析2.7.1 測(cè)序樣品處理綜合分離木霉菌株的平板抑制效率與發(fā)酵液的拮抗效果,選取了哈茨木霉菌做轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。將辣椒疫霉先接種于 PDA 平板培養(yǎng)基上 3d 后,在等距離先后點(diǎn)接種哈茨木霉于同一培養(yǎng)基,28 °C 培養(yǎng) 3 d 時(shí)發(fā)現(xiàn)哈茨木霉與辣椒疫霉均開(kāi)始正常生長(zhǎng)、5 d 時(shí)兩菌株菌絲生長(zhǎng)到平板中央開(kāi)始接觸生長(zhǎng),7d 時(shí)哈茨木霉菌絲幾乎全部覆蓋整個(gè)平板,辣椒疫霉不僅停止了生長(zhǎng)而且菌絲體被消解,最終確定拮抗 3、5、7d 為拮抗前、中、后 3 個(gè)時(shí)期樣品測(cè)序,每個(gè)樣品設(shè)置 3 次重復(fù)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]不同木霉菌株對(duì)黃瓜枯萎病菌的拮抗作用[J]. 谷祖敏,畢卉,張兵,田曉穎. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2018(03)
[2]真菌源幾丁質(zhì)酶在植物抗真菌病害中的應(yīng)用[J]. 程笑笑,馮自力,馮鴻杰,趙麗紅,師勇強(qiáng),李志芳,朱荷琴. 植物保護(hù). 2017(03)
[3]棘孢木霉發(fā)酵液對(duì)番茄早疫病抗氧化系統(tǒng)和脂質(zhì)過(guò)氧化作用的影響[J]. 楊帥,孫麗麗,鄧世林,袁碧玉,蘇佳滿,王志英,孫卉. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2017(05)
[4]組學(xué)時(shí)代的可變剪接研究進(jìn)展[J]. 周冬虎,姜穎,賀福初. 中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2015(12)
[5]木霉菌生物防治辣椒疫病的研究進(jìn)展[J]. 楊萬(wàn)榮,邢丹,蓬桂華,張愛(ài)民,付文婷. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2015(19)
[6]辣椒疫霉多聚半乳糖醛酸酶活性對(duì)其致病力的影響[J]. 李萍,張茜茹,吳亞,高智謀. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(19)
[7]黃綠木霉菌發(fā)酵液對(duì)稻瘟病菌的影響[J]. 林志偉,孫冬梅. 貴州農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(03)
[8]貴州省辣椒疫霉菌生物學(xué)特性和辣椒抗疫病性鑒定方法初探[J]. 王瑩,王姝,趙玉橋,向準(zhǔn),劉盈盈,張玉武. 湖北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(20)
[9]長(zhǎng)枝木霉菌抑菌譜測(cè)定及其抑菌作用機(jī)理研究[J]. 張瑾,張樹(shù)武,徐秉良,古麗君,薛應(yīng)鈺. 中國(guó)生態(tài)農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2014(06)
[10]辣椒疫病生物防治技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 張愛(ài)民,邢丹,楊萬(wàn)榮,楊紅. 長(zhǎng)江蔬菜. 2013(08)
博士論文
[1]苦參內(nèi)生真菌抑菌物質(zhì)純化鑒定及作用機(jī)制研究[D]. 何璐.沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
本文編號(hào):3260635
【文章來(lái)源】:貴州大學(xué)貴州省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:138 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
木霉菌菌株進(jìn)化關(guān)系圖(Mukherjee,etal.,2013)
圖 1.2 基因可變剪輯的類型(引自周冬虎等,2015)Fig. 1.2 The type of gene that forms alternative splicing量測(cè)序技術(shù)在整個(gè)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(RNA-Seq)中的發(fā)展促進(jìn)了人(AS)的理解。RNA-Seq 數(shù)據(jù)可以通過(guò)跨越內(nèi)含子的 read別內(nèi)含子,這對(duì)鑒定基因的內(nèi)含子和剪接多樣性有著重要價(jià)中有數(shù)千個(gè)可變剪接事件被發(fā)現(xiàn),甚至于有數(shù)十個(gè)剪接事件是子進(jìn)行連(Cloonan, et al.,2008)。不只是高等真核生物,即有大量可變剪接事件通過(guò) RNA-Seq 被發(fā)現(xiàn)(Zhao, et al., 201達(dá)不論是在物種之間還是在組織個(gè)體之間都存在超乎想象的 分析顯示,人類多順?lè)醋涌勺兗艚樱ˋS)基因的比例在人類(Pan Q, et al,. 2008; Wang ,et al,.2008)在水稻中為 42.4%(Z擬南芥中為 61%(Marquez,et al,. 2012)。最近一項(xiàng)針對(duì) 23
2019 屆碩士研究生畢業(yè)論文變化現(xiàn)象。2.7 哈茨木霉菌拮抗辣椒疫霉菌的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析2.7.1 測(cè)序樣品處理綜合分離木霉菌株的平板抑制效率與發(fā)酵液的拮抗效果,選取了哈茨木霉菌做轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。將辣椒疫霉先接種于 PDA 平板培養(yǎng)基上 3d 后,在等距離先后點(diǎn)接種哈茨木霉于同一培養(yǎng)基,28 °C 培養(yǎng) 3 d 時(shí)發(fā)現(xiàn)哈茨木霉與辣椒疫霉均開(kāi)始正常生長(zhǎng)、5 d 時(shí)兩菌株菌絲生長(zhǎng)到平板中央開(kāi)始接觸生長(zhǎng),7d 時(shí)哈茨木霉菌絲幾乎全部覆蓋整個(gè)平板,辣椒疫霉不僅停止了生長(zhǎng)而且菌絲體被消解,最終確定拮抗 3、5、7d 為拮抗前、中、后 3 個(gè)時(shí)期樣品測(cè)序,每個(gè)樣品設(shè)置 3 次重復(fù)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]不同木霉菌株對(duì)黃瓜枯萎病菌的拮抗作用[J]. 谷祖敏,畢卉,張兵,田曉穎. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2018(03)
[2]真菌源幾丁質(zhì)酶在植物抗真菌病害中的應(yīng)用[J]. 程笑笑,馮自力,馮鴻杰,趙麗紅,師勇強(qiáng),李志芳,朱荷琴. 植物保護(hù). 2017(03)
[3]棘孢木霉發(fā)酵液對(duì)番茄早疫病抗氧化系統(tǒng)和脂質(zhì)過(guò)氧化作用的影響[J]. 楊帥,孫麗麗,鄧世林,袁碧玉,蘇佳滿,王志英,孫卉. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2017(05)
[4]組學(xué)時(shí)代的可變剪接研究進(jìn)展[J]. 周冬虎,姜穎,賀福初. 中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2015(12)
[5]木霉菌生物防治辣椒疫病的研究進(jìn)展[J]. 楊萬(wàn)榮,邢丹,蓬桂華,張愛(ài)民,付文婷. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2015(19)
[6]辣椒疫霉多聚半乳糖醛酸酶活性對(duì)其致病力的影響[J]. 李萍,張茜茹,吳亞,高智謀. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(19)
[7]黃綠木霉菌發(fā)酵液對(duì)稻瘟病菌的影響[J]. 林志偉,孫冬梅. 貴州農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(03)
[8]貴州省辣椒疫霉菌生物學(xué)特性和辣椒抗疫病性鑒定方法初探[J]. 王瑩,王姝,趙玉橋,向準(zhǔn),劉盈盈,張玉武. 湖北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(20)
[9]長(zhǎng)枝木霉菌抑菌譜測(cè)定及其抑菌作用機(jī)理研究[J]. 張瑾,張樹(shù)武,徐秉良,古麗君,薛應(yīng)鈺. 中國(guó)生態(tài)農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2014(06)
[10]辣椒疫病生物防治技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 張愛(ài)民,邢丹,楊萬(wàn)榮,楊紅. 長(zhǎng)江蔬菜. 2013(08)
博士論文
[1]苦參內(nèi)生真菌抑菌物質(zhì)純化鑒定及作用機(jī)制研究[D]. 何璐.沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
本文編號(hào):3260635
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/nykj/3260635.html
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