禾谷類作物孢囊線蟲（Cereal Cyst Nematodes）是一類世界性的重要線蟲，可侵染小麥、大麥、燕麥等。中國是世界上小麥產(chǎn)量最大的國家，每年的總產(chǎn)量為1.2億噸，平均每公頃的產(chǎn)量達(dá)4噸。小麥禾谷孢囊線蟲（Heterodera avenae）目前在我國的發(fā)生面積達(dá)到400萬公頃，涉及16個(gè)省份，占小麥總種植面積的1/6，引起產(chǎn)量損失從10%⁴0%不等，嚴(yán)重者達(dá)80%，甚至絕收。系統(tǒng)地研究了北京大興和青海湟源地區(qū)小麥禾谷孢囊線蟲群體的致病型差異。利用23個(gè)國際鑒別寄主和1個(gè)本地感病對(duì)照進(jìn)行測(cè)試。在青海湟源群體和北京大興群體中發(fā)現(xiàn)大麥品系中Ortolan, Siri, Morocco表現(xiàn)抗性，6個(gè)燕麥品種除了IGV.H72-646對(duì)北京群體表現(xiàn)感病外，其余均表現(xiàn)抗性，小麥品種中除Iskamish-K-2-light外，其余品種表現(xiàn)出感病，僅有Herta、Harlan43、IGV.H72-646、Iskamish-K-2-light4個(gè)品種之間的抗感表現(xiàn)略有差異，其余品種之間的抗感反應(yīng)均一致。因此根據(jù)推斷和命名規(guī)則我們將禾谷孢囊線蟲青海湟源群體和北京大興群體命名... 

【文章來源】：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市

【文章頁數(shù)】：97 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
英文縮略表
第一章 引言
    1.1 植物寄生線蟲
        1.1.1 孢囊線蟲簡(jiǎn)介
        1.1.2 小麥禾谷孢囊線蟲的發(fā)生危害
        1.1.3 小麥禾谷孢囊線蟲生物學(xué)特性
        1.1.4 小麥禾谷孢囊線蟲傳播途徑
    1.2 小麥禾谷孢囊線蟲致病型研究進(jìn)展
        1.2.1 小麥禾谷孢囊線蟲致病型鑒定國際鑒別寄主
        1.2.2 小麥禾谷孢囊線蟲群體致病型變異
    1.3 轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究進(jìn)展
        1.3.1 第一代測(cè)序技術(shù)的發(fā)展
        1.3.2 第二代測(cè)序技術(shù)的發(fā)展
        1.3.3 RNA 測(cè)序（RNA sequencing，RNAseq）技術(shù)的發(fā)展
        1.3.4 孢囊線蟲轉(zhuǎn)錄組學(xué)的發(fā)展
    1.4 本地?cái)?shù)據(jù)庫的建立
    1.5 目的意義
        1.5.1 目的
        1.5.2 意義
第二章 小麥禾谷孢囊線蟲（Heterodera avenae）的致病型測(cè)定
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.1 主要儀器與試劑
        2.1.2 主要試劑及培養(yǎng)基的配制方法
        2.1.3 供試材料來源
    2.2 小麥禾谷孢囊線蟲的分離檢測(cè)
        2.2.1 土壤中孢囊的分離
        2.2.2 小麥禾谷孢囊線蟲的基因組 DNA 的提取方法
        2.2.3 孢囊線蟲 rDNA-ITS 區(qū)域 PCR 擴(kuò)增驗(yàn)證
        2.2.4 禾谷孢囊線蟲的 SCAR 標(biāo)記檢測(cè)
    2.3 小麥禾谷孢囊線蟲的孵化收集
    2.4 小麥禾谷孢囊線蟲致病型室內(nèi)接種鑒定
        2.4.1 鑒別寄主的種植及 J2s 的接種
        2.4.2 致病型反應(yīng)調(diào)查統(tǒng)計(jì)方法
        2.4.3 致病型反應(yīng)鑒定標(biāo)準(zhǔn)
    2.5 結(jié)果與分析
        2.5.1 小麥禾谷孢囊線蟲 rDNA-ITS 區(qū)域 PCR 擴(kuò)增驗(yàn)證結(jié)果
        2.5.2 禾谷孢囊線蟲 SCAR 標(biāo)記檢測(cè)結(jié)果
        2.5.3 小麥禾谷孢囊線蟲致病型鑒定結(jié)果
    2.6 小結(jié)與討論
第三章 小麥禾谷孢囊線蟲（Heterodera avenae）轉(zhuǎn)錄組 DE NOVO 測(cè)序分析
    3.1 實(shí)驗(yàn)材料
        3.1.1 小麥禾谷孢囊線蟲的來源與分離
        3.1.2 小麥品種的選擇
    3.2 小麥禾谷孢囊線蟲的基因組 DNA 的提取
    3.3 小麥禾谷孢囊線蟲的 SCAR 標(biāo)記檢測(cè)
        3.3.1 小麥禾谷孢囊線蟲 SCAR 標(biāo)記檢測(cè)引物
        3.3.2 小麥禾谷孢囊線蟲 SCAR 標(biāo)記引物的驗(yàn)證 PCR 反應(yīng)
    3.4 禾谷孢囊線蟲各齡期蟲源的收集
        3.4.1 二齡幼蟲的收集
        3.4.2 各齡期幼蟲的準(zhǔn)備
        3.4.3 各齡期幼蟲的收集
    3.5 禾谷孢囊線蟲 RNA 的制備
        3.5.1 各齡期禾谷孢囊線蟲 RNA 的提取
        3.5.2 提取總 RNA 的純化
        3.5.3 RNA 的提取質(zhì)量檢測(cè)
    3.6 小麥禾谷孢囊線蟲轉(zhuǎn)錄組拼接組裝及功能注釋
    3.7 結(jié)果與分析
        3.7.1 小麥禾谷孢囊線蟲 SCAR 標(biāo)記檢測(cè)
        3.7.2 各齡期小麥禾谷孢囊線蟲 RNA 的提取
        3.7.3 小麥禾谷孢囊線蟲轉(zhuǎn)錄組的拼接組裝
        3.7.4 對(duì) 3 個(gè)轉(zhuǎn)錄組分別進(jìn)行 KEGG、GO、和 Swiss-Prot 數(shù)據(jù)庫功能注釋
        3.7.5 禾谷孢囊線蟲不同齡期差異表達(dá)基因篩選
        3.7.6 效應(yīng)蛋白鑒定
        3.7.7 RNAi 致死表型基因篩選
    3.8 小結(jié)與討論
第四章 全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附表 1 小麥禾谷孢囊線蟲各齡期差異表達(dá)基因
    附表 1-1 禾谷孢囊線蟲轉(zhuǎn)錄組侵染前 J2 VS 雌成蟲上調(diào)表達(dá)的基因（24/2905）
    附表 1-2 禾谷孢囊線蟲轉(zhuǎn)錄組侵染前 J2 VS 雌成蟲下調(diào)表達(dá)的基因（24/1684）
    附表 1-3 禾谷孢囊線蟲轉(zhuǎn)錄組侵染前 J2 VS 侵染后 J4 上調(diào)表達(dá)的基因（24/1101）
    附表 1-4 禾谷孢囊線蟲轉(zhuǎn)錄組侵染前 J2 VS 侵染后 J4 下調(diào)表達(dá)的基因（24/1894）
    附表 1-5 禾谷孢囊線蟲轉(zhuǎn)錄組侵染后 J4 VS 雌成蟲上調(diào)表達(dá)的基因（24/285）
    附表 1-6 禾谷孢囊線蟲轉(zhuǎn)錄組侵染后 J4 VS 雌成蟲下調(diào)表達(dá)的基因（24/123）
附表 2 小麥禾谷孢囊線蟲轉(zhuǎn)錄組中 471 個(gè)已報(bào)道的植物寄生線蟲效應(yīng)因子
附表 3 小麥禾谷孢囊線蟲轉(zhuǎn)錄組中 117 個(gè)未見報(bào)道注釋（22 個(gè)）的效應(yīng)因子
附表 4 小麥禾谷孢囊線蟲轉(zhuǎn)錄組中具有 RNAI表型的基因序列（50/376）
致謝
作者簡(jiǎn)歷


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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