【摘要】：傳染性軟腐病病毒(Iflavirus)屬于小核糖核酸病毒目,是一類單股正鏈RNA病毒,其家族成員正在不斷擴(kuò)大。Iflavirus的寄主包括鱗翅目、膜翅目和半翅目的昆蟲以及瓦螨,因其對一些重要的農(nóng)業(yè)害蟲產(chǎn)生致病性,因此是重要的潛在生防病毒種類之一。本研究利用小菜蛾轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)拼接出一條Iflavirus病毒基因組序列。通過查找ORF和序列相似性比對發(fā)現(xiàn)此基因組可編碼一條完整的病毒多聚蛋白并與其他Iflavirus病毒同源,因此將這一新病毒命名為小菜蛾傳染性軟腐病病毒(Diamondback moth iflavirus),英文簡稱DBMIV。通過多聚蛋白序列與RNA聚合酶序列構(gòu)建的進(jìn)化樹表明DBMIV與PNV、EOPLV和SEIV2進(jìn)化關(guān)系最近。最后,利用RT-PCR擴(kuò)增出DBMIV的外殼蛋白區(qū)域驗(yàn)證了新命名病毒在田間小菜蛾種群的感染。DBMIV的鑒定與命名為利用高通量測序數(shù)據(jù)鑒定病毒新種提供參考,為利用病毒生防重要蔬菜害蟲小菜蛾提供研究思路。
[Abstract]:Infectious soft rot virus (Iflavirus) belongs to the small ribonucleic acid virus order, is a single strand positive chain RNA virus, and its family members are expanding. Iflavirus hosts include Lepidoptera, Hymenoptera and Hemiptera insects as well as Var mites. Because of its pathogenicity to some important agricultural pests, it is one of the important potential biocontrol viruses. In this study, a genome sequence of Iflavirus virus was obtained by sequencing data of Plutella xylostella transcript set. By searching for ORF and sequence similarity comparison, it was found that this genome could encode a complete viral polymeric protein and be homologous to other Iflavirus viruses. Therefore, the new virus was named (Diamondback moth iflavirus), of Plutella xylostella Infectious soft Rot virus (DBMIV. for short). The phylogenetic tree constructed by Polymeric protein sequence and RNA polymerase sequence showed that DBMIV had the closest evolutionary relationship with PNV,EOPLV and SEIV2. Finally, the coat protein region of DBMIV was amplified by RT-PCR to verify the infection of the newly named virus in the population of Plutella xylostella in the field. The identification and naming of DBMIV provided a reference for the identification of new species by using high-throughput sequencing data. In order to use virus biocontrol of important vegetable pest Plutella xylostella to provide research ideas.
【作者單位】： 廣東省生物資源應(yīng)用研究所廣東省動(dòng)物保護(hù)與資源利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室廣東省野生動(dòng)物保護(hù)與利用公共實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(31371932) 廣東省科學(xué)院青年科學(xué)研究基金(qnjj201602);廣東省科學(xué)院科技發(fā)展專項(xiàng)(2017GDASCX-0107)
【分類號(hào)】：S476.13

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