【摘要】：采用轉(zhuǎn)錄組測序的方法分析了白三葉根際溶磷菌RW8在含有難溶磷(A組)、可溶磷(B組)與無磷(C組)培養(yǎng)條件下差異基因表達(dá)。以可溶磷為對照,在難溶磷條件下,分別檢測到4782個基因在RW8中上調(diào)表達(dá),447個基因下調(diào)表達(dá);在無磷組中,共檢測到3630個基因上調(diào)表達(dá),209個基因下調(diào)表達(dá)。GO基因注釋發(fā)現(xiàn)RW8在A組和C組中的差異基因聚類基本相同。生物學(xué)過程主要聚類在代謝過程、細(xì)胞過程、單細(xì)胞過程、刺激應(yīng)答、定位以及生物反應(yīng)調(diào)節(jié);細(xì)胞組分主要聚類在細(xì)胞組分、細(xì)胞膜、膜組分與高分子配合體等;分子功能主要聚類在催化活性、結(jié)合功能與轉(zhuǎn)運功能。代謝途徑分析發(fā)現(xiàn)2-α-氧代羧、α-亞麻酸、五碳二元酸、脂肪酸、甘氨酸-絲氨酸-蛋氨酸以及纈氨酸-亮氨酸-異亮氨酸等代謝途徑的基因顯著被富集。挑選10個差異基因并用熒光定量檢測其在A、B、C 3種不同培養(yǎng)條件下的基因表達(dá),發(fā)現(xiàn)所有挑選基因的表達(dá)變化與轉(zhuǎn)錄組結(jié)果變化趨勢相同。液相色譜檢測有機酸組成及含量,發(fā)現(xiàn)在A組和C組中乳酸、琥珀酸與檸檬酸顯著高于B組,富馬酸與蘋果酸的含量在C組中顯著升高,A組與B組差異不顯著;α-酮戊二酸的含量在A組中顯著增高,B組和C組差異不顯著。
[Abstract]:The differential gene expression of phosphorus-lysing bacteria RW8 in the rhizosphere of white clover was analyzed by transcriptome sequencing under the conditions of insoluble phosphorus (group A), soluble phosphorus (group B) and non-phosphorus (group C). GO gene annotation showed that RW8 was clustered basically the same in group A and group C. Biological processes were mainly clustered in metabolic processes, cell processes, single cell processes, stimulus responses, localization and regulation of biological reactions; cell components were mainly clustered in cell components, cell membranes, and membrane. Metabolic pathway analysis revealed that genes in metabolic pathways such as 2-alpha-oxo-carboxylic acid, alpha-linolenic acid, pentadecanedioic acid, fatty acid, glycine-serine-methionine and valine-leucine-isoleucine were significantly enriched. Allogenes were detected by fluorescence quantitative analysis under three different culture conditions A, B and C. The results showed that the expression of all selected genes had the same trend as that of transcriptome. The composition and content of organic acids in group A and group C were detected by liquid chromatography. Lactic acid, succinic acid and citric acid in group A and group C were significantly higher than those in group B, and fumaric acid and malic acid were significantly higher than those in group B. The content of alpha-ketoglutarate in group A was significantly higher than that in group C, but there was no significant difference between group A and group B.
【作者單位】： 貴州省農(nóng)業(yè)科學(xué)院草業(yè)研究所;
【基金】：貴州省科技支撐項目(黔科合支撐[2016]2504號) 貴州省農(nóng)科院專項基金(黔農(nóng)科院院專項[2013]03)資助
【分類號】：S154.3;S541.2

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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本文編號：2247554