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基于高通量測序的大豆連作土壤細菌群落多樣性分析

發(fā)布時間:2018-02-28 14:53

  本文關鍵詞: 大豆 長期連作 Miseq 細菌群落 結構多樣性 出處:《大豆科學》2017年03期  論文類型:期刊論文


【摘要】:研究應用基于Illumina公司的Miseq高通量測序平臺,深度解析東北黑土大豆短期連作和長期連作土壤細菌群落結構多樣性。通過對細菌16S rRNA序列V4區(qū)的高通量測序,短期(3年)和長期連作(20年)大豆田土壤分別得到180 980和221 424條有效序列,注釋為1 254和1 432個細菌可操作分類單元(operational taxonomic unit,OTU),且長期連作土壤細菌群落豐富度和多樣性均高于短期連作土壤。在細菌門分類水平上,短期和長期連作土壤中細菌優(yōu)勢菌群構成為相同的8個細菌菌門(所占比例1%),依次包括變形菌門、酸桿菌門、疣微菌門、厚壁菌門、擬桿菌門、放線菌門、芽單胞菌門和硝化螺菌門,其所占總比例之和分別達到細菌菌門總數的85.5%和86.3%。在細菌屬分類水平上,短期和長期連作土壤中細菌TOP10優(yōu)勢菌群構成相同,包括疣微菌門的Spartobacteria屬、酸桿菌門的Gp1、Gp4、Gp3和Gp6屬、芽單胞菌門的Gemmatimonas屬、硝化螺菌門的Nitrospira屬、變形菌門的Sphingomonas屬和Bradyrhizobium屬以及厚壁菌門的Bacillus屬,且10個細菌菌屬所占比例之和分別達到細菌菌門總數的71.3%和69.0%。結果表明:東北黑土區(qū)大豆經過長期連作后土壤細菌優(yōu)勢菌菌群結構變化較小,但群落豐富度和多樣性較短期連作略有增加,且對大豆養(yǎng)分吸收和生長有促進作用的根瘤菌Bradyrhizobium屬和硝化細菌Nitrospira屬所占比例增加。研究結果對解釋大豆長期連作根病抑制性土壤形成機制具有一定價值。
[Abstract]:Based on Illumina ' s Miseq high - throughput sequencing platform , we studied the diversity of bacterial community structure in the short - term and long - term cropping of black - soil soybean in Northeast China .

【作者單位】: 江蘇大學食品與生物工程學院;江蘇大學農業(yè)裝備工程學院;中國科學院東北地理與農業(yè)生態(tài)研究所;
【基金】:國家自然科學基金(41571253) 江蘇省高校自然科學研究面上項目(15KJB180002) 鎮(zhèn)江市重點研發(fā)計劃-現代農業(yè)(NY2015023)
【分類號】:S154.3;S565.1

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本文編號:1547760

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