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《第二十一屆中國數(shù)據(jù)庫學(xué)術(shù)會(huì)議論文集(研究報(bào)告篇)》2004年

發(fā)布時(shí)間:2016-08-03 21:13

  本文關(guān)鍵詞:基于基因表達(dá)數(shù)據(jù)的腫瘤分類算法研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


《第二十一屆中國數(shù)據(jù)庫學(xué)術(shù)會(huì)議論文集(研究報(bào)告篇)》2004年

基因表達(dá)數(shù)據(jù)的基于類別樹和SVMs的多類癌癥分類算法

楊昆  李建中  王朝坤  徐繼偉  

【摘要】:對(duì)不同類型癌癥精確可靠的分類在癌癥的診斷和治療是極其重要的.近年來提出了很多使用基因表達(dá)數(shù)據(jù)來分類多個(gè)癌癥類型的方法.這些方法在分類過程中不考慮類別間的關(guān)系,獨(dú)立地處理每個(gè)類別,丟失了很多類別和基因的信息.提出了一個(gè)基于類別樹和支持向量機(jī)(SVMs)的多類癌癥分類算法(TSS),考慮類別間的相互關(guān)系和生物學(xué)意義.這一方法借助類別間的關(guān)系(距離)構(gòu)建一棵二叉樹,然后沿著樹進(jìn)行基因選擇,最后由樹和選出的基因訓(xùn)練基于支持向量機(jī)的分類器.在樹結(jié)構(gòu)上選出的基因和樹的層次關(guān)系為生物學(xué)家提供了更多的生物學(xué)信息.提出的方法用一個(gè)公共可得到的真實(shí)數(shù)據(jù)集進(jìn)行了測試,結(jié)果表明,分類能力優(yōu)于先前證實(shí)表現(xiàn)最好的OVA方法.

【作者單位】:
【分類號(hào)】:TP311.13
【正文快照】:

1引言在癌癥治療中,為了取得更好的治療效果和盡可能地減小毒性,對(duì)不同類型的腫瘤采用有針對(duì)性的治療方法是極其重要的〔‘〕.因而,,正確地分類癌癥(腫瘤)類型是癌癥診斷和治療必不可少的重要環(huán)節(jié)一般的癌癥分類方法主要基于臨床腫瘤形態(tài)上的特征,由于臨床信息不完全和主

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1 楊昆;李建中;王朝坤;徐繼偉;;基因表達(dá)數(shù)據(jù)的基于類別樹和SVMs的多類癌癥分類算法[A];第二十一屆中國數(shù)據(jù)庫學(xué)術(shù)會(huì)議論文集(研究報(bào)告篇)[C];2004年

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本文編號(hào):82616

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