《第二十一屆中國數(shù)據(jù)庫學術(shù)會議論文集(研究報告篇)》2004年
本文關(guān)鍵詞:基于基因表達數(shù)據(jù)的腫瘤分類算法研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
《第二十一屆中國數(shù)據(jù)庫學術(shù)會議論文集(研究報告篇)》2004年
基因表達數(shù)據(jù)的基于類別樹和SVMs的多類癌癥分類算法
楊昆 李建中 王朝坤 徐繼偉
【摘要】:對不同類型癌癥精確可靠的分類在癌癥的診斷和治療是極其重要的.近年來提出了很多使用基因表達數(shù)據(jù)來分類多個癌癥類型的方法.這些方法在分類過程中不考慮類別間的關(guān)系,獨立地處理每個類別,丟失了很多類別和基因的信息.提出了一個基于類別樹和支持向量機(SVMs)的多類癌癥分類算法(TSS),考慮類別間的相互關(guān)系和生物學意義.這一方法借助類別間的關(guān)系(距離)構(gòu)建一棵二叉樹,然后沿著樹進行基因選擇,最后由樹和選出的基因訓練基于支持向量機的分類器.在樹結(jié)構(gòu)上選出的基因和樹的層次關(guān)系為生物學家提供了更多的生物學信息.提出的方法用一個公共可得到的真實數(shù)據(jù)集進行了測試,結(jié)果表明,分類能力優(yōu)于先前證實表現(xiàn)最好的OVA方法.
【作者單位】:
【分類號】:TP311.13
【正文快照】:
1引言在癌癥治療中,為了取得更好的治療效果和盡可能地減小毒性,對不同類型的腫瘤采用有針對性的治療方法是極其重要的〔‘〕.因而,,正確地分類癌癥(腫瘤)類型是癌癥診斷和治療必不可少的重要環(huán)節(jié)一般的癌癥分類方法主要基于臨床腫瘤形態(tài)上的特征,由于臨床信息不完全和主
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本文編號:82616
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