本文關(guān)鍵詞：RARG及BMP15基因與從江香豬繁殖性能關(guān)聯(lián)分析及表達(dá)規(guī)律研究

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【摘要】：本研究以從江香豬為研究對象,選取視黃酸受體γ(RARG)基因和骨形成蛋白15(BMP15)基因作為影響從江香豬繁殖性能的候選基因,采用DNA混池、PCR直接測序及PCR-SSCP技術(shù),對從江香豬的RARG基因、BMP15基因進(jìn)行單核苷酸多態(tài)性研究,尋找與繁殖性狀相關(guān)聯(lián)的遺傳標(biāo)記;利用實時熒光定量PCR技術(shù),對RARG基因、BMP15基因在從江香豬不同生長時期不同組織的mRNA表達(dá)水平差異進(jìn)行分析,其結(jié)果如下:1.對RARG基因的研究表明,在受試群體中發(fā)現(xiàn)4個SNPs,可構(gòu)建12種單倍型;關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn),C1464T和C128T位點對從江香豬的繁殖性能存在顯著影響(P0.05),等位基因C和等位基因A可能為從江香豬總產(chǎn)仔數(shù)、產(chǎn)活仔數(shù)、乳頭數(shù)的有利等位基因,且CC基因型和AA基因型為有利基因型。2.對BMP15基因的研究表明,在受試群體中發(fā)現(xiàn)3個SNPs,且處于連鎖不平衡狀態(tài),可構(gòu)建6種單倍型;關(guān)聯(lián)分析初步推斷,BMP15基因C122T和A13G位點可能是影響從江香豬繁殖性能的2個分子標(biāo)記,H3單倍型與CC、AB基因型分別為影響從江香豬母豬產(chǎn)仔數(shù)及乳頭數(shù)的有利單倍型和基因型。3.實時熒光定量PCR檢測發(fā)現(xiàn),RARG基因和BMP15基因的mRNA在2、4、6、8、10月齡母豬的15種組織中均有表達(dá),但不同月齡不同組織間存在表達(dá)差異;在從江香豬母豬卵巢、輸卵管、子宮體及子宮角中,6月齡從江香豬比其他月齡香豬表現(xiàn)出較高的RARG基因mRNA表達(dá)量;但對于BMP15基因,5個月齡階段的母豬卵巢、輸卵管、子宮體、子宮角中的mRNA相對表達(dá)量均高于其它組織(P0.05),且在卵巢組織中的BMP15基因mRNA表達(dá)量隨著母豬月齡增加呈逐漸遞增的趨勢。
【關(guān)鍵詞】：從江香豬 RARG基因 BMP15基因 關(guān)聯(lián)分析 多態(tài)性 表達(dá)
【學(xué)位授予單位】：貴州大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：S828
【目錄】：

• 摘要7-8
• Abstract8-10
• 前言10-11
• 第一章 文獻(xiàn)綜述11-24
• 1 從江香豬資源概況11-14
• 1.1 中心產(chǎn)區(qū)及分布11
• 1.2 產(chǎn)區(qū)自然生態(tài)條件11
• 1.3 品種來源與變化11-12
• 1.4 品種特征12-13
• 1.5 品種保護(hù)與研究利用13-14
• 1.6 品種評價14
• 2 RARG基因研究進(jìn)展14-17
• 2.1 RARG基因家族概況14-15
• 2.2 RARG基因結(jié)構(gòu)和功能15-16
• 2.3 RARG基因調(diào)控機(jī)制16-17
• 2.4 RARG基因多態(tài)性及表達(dá)研究進(jìn)展17
• 3 BMP15基因研究進(jìn)展17-22
• 3.1 BMP15基因結(jié)構(gòu)和功能17-19
• 3.2 BMP15基因調(diào)控機(jī)理19-20
• 3.3 BMP15基因多態(tài)性及表達(dá)研究進(jìn)展20-22
• 4 目的與意義22-24
• 第二章 RARG基因與BMP15基因多態(tài)性研究24-57
• 1 試驗材料24-26
• 1.1 試驗動物24
• 1.2 試驗儀器24-25
• 1.3 試劑及溶液配制25-26
• 2 試驗方法26-37
• 2.1 DNA提取26-27
• 2.2 瓊脂糖電泳檢測27-28
• 2.3 DNA濃度和純度檢測28
• 2.4 DNA池構(gòu)建28-29
• 2.5 引物設(shè)計及合成29-30
• 2.6 引物溶解與稀釋30-31
• 2.7 PCR反應(yīng)體系及條件31
• 2.8 DNA池PCR擴(kuò)增及測序31
• 2.9 PCR-SSCP分析31-34
• 2.10 多態(tài)片段測序34
• 2.11 相關(guān)軟件及統(tǒng)計方法34-37
• 3 結(jié)果與分析37-53
• 3.1 基因組DNA提取37
• 3.2 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測37-39
• 3.3 DNA池PCR產(chǎn)物測序結(jié)果39
• 3.4 RARG基因不同SNP位點遺傳變異分析39-47
• 3.5 BMP15基因不同SNP位點遺傳變異分析47-53
• 4 討論53-57
• 4.1 RARG基因多態(tài)性與繁殖性狀關(guān)聯(lián)性分析53-54
• 4.2 BMP15基因多態(tài)性與繁殖性狀關(guān)聯(lián)性分析54-57
• 第三章 從江香豬RARG基因與BMP15基因表達(dá)規(guī)律研究57-83
• 1 試驗材料57-58
• 1.1 試驗動物57
• 1.2 主要儀器57
• 1.3 主要試劑57-58
• 2 試驗方法58-62
• 2.1 總RNA提取58-59
• 2.2 第一鏈cDNA合成59-60
• 2.3 熒光定量PCR引物設(shè)計60-61
• 2.4 熒光定量PCR體系及反應(yīng)程序61
• 2.5 建立標(biāo)準(zhǔn)曲線61-62
• 2.6 數(shù)據(jù)處理62
• 3 結(jié)果與分析62-78
• 3.1 總RNA提取及檢測62-63
• 3.2 實時熒光定量PCR產(chǎn)物特異性及擴(kuò)增效率分析63-65
• 3.3 RARG基因表達(dá)差異分析65-71
• 3.4 BMP15基因表達(dá)差異分析71-78
• 4 討論78-83
• 4.1 RARG基因與BMP15基因RT-QPCR檢測78-79
• 4.2 RARG基因表達(dá)規(guī)律研究79-80
• 4.3 BMP15基因表達(dá)規(guī)律研究80-83
• 第四章 結(jié)論與展望83-85
• 1 結(jié)論83
• 2 創(chuàng)新點83-84
• 3 展望84-85
• 參考文獻(xiàn)85-91
• 致謝91-92
• 附錄92-96

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本文編號：706235