本文關(guān)鍵詞：毛竹bZIP轉(zhuǎn)錄因子的基因結(jié)構(gòu)與進(jìn)化分析

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【摘要】：以毛竹基因組數(shù)據(jù)庫中的107個(gè)編碼b ZIP轉(zhuǎn)錄因子的基因?yàn)椴牧?對其進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析,篩選得到了A、D和S亞族的b ZIP家族成員,并對其基因結(jié)構(gòu)、適應(yīng)性進(jìn)化、與水稻基因?qū)χg的進(jìn)化分歧時(shí)間及蛋白質(zhì)同源建模等進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明,毛竹A、D和S亞族共有47個(gè)b ZIP家族成員,其中A亞族18個(gè),D亞族16個(gè),S亞族13個(gè)�；蚪Y(jié)構(gòu)分析表明,3個(gè)亞族中內(nèi)含子數(shù)量為0-16個(gè),而且D亞族基因的內(nèi)含子—外顯子組成比A亞族和S亞族更為復(fù)雜。適應(yīng)性進(jìn)化分析表明,3個(gè)亞族總體上處于凈化選擇壓力之下;A、D和S亞族的平均進(jìn)化分歧時(shí)間分別為279.0,265.6和202.9 Mya;47個(gè)毛竹b ZIP蛋白質(zhì)主要以α-螺旋為主,且D亞族的三級結(jié)構(gòu)比A和S亞族復(fù)雜。
【作者單位】： 西南科技大學(xué)植物細(xì)胞工程實(shí)驗(yàn)室;四川省生物質(zhì)資源利用與改性工程技術(shù)研究中心;
【關(guān)鍵詞】： 毛竹 bZIP轉(zhuǎn)錄因子 生物信息學(xué)分析
【基金】：國家自然科學(xué)基金青年基金項(xiàng)目“超量表達(dá)NaSUSs基因?qū)α荷酱戎窭w維素生物合成調(diào)控效應(yīng)的研究”(31400257) 四川省應(yīng)用基礎(chǔ)研究基金項(xiàng)目“4CL、CCoAOMT、C3H基因調(diào)控工業(yè)用竹的研究”(2013JY0182) 西南科技大學(xué)研究生創(chuàng)新基金項(xiàng)目“慈竹bZIP轉(zhuǎn)錄因子的克隆及其遺傳轉(zhuǎn)化研究”(15ycx084)
【分類號】：S795.7
【正文快照】： 堿性亮氨酸拉鏈(basic leucine zipper,b ZIP)轉(zhuǎn)錄因子是真核生物轉(zhuǎn)錄因子中分布最廣泛、最保守的一類轉(zhuǎn)錄因子,其保守的b ZIP結(jié)構(gòu)域由結(jié)合DNA的堿性區(qū)域和一個(gè)亮氨酸拉鏈的二聚化基序構(gòu)成,根據(jù)其結(jié)構(gòu)特點(diǎn)和功能可以將b ZIP轉(zhuǎn)錄因子家族劃分為10個(gè)亞族,分為A、B、C、D、E、F、，

本文編號：683652