浙貝母HMGR基因保守區(qū)序列的克隆及生物信息學(xué)分析
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【摘要】:3-羥基-3-甲基戊二酰輔酶A還原酶(HMGR)是甲羥戊酸途徑中的第一個(gè)限速酶,在植物生物堿類物質(zhì)代謝過程中發(fā)揮重要的作用。為探究HMGR酶在浙貝母甾體類生物堿合成代謝途徑中的調(diào)控作用,以百合科浙貝母狹葉品種為材料,利用RT-PCR技術(shù)和Ta克隆技術(shù)首次從浙貝母中克隆出HMGR基因保守區(qū)序列,長度為390 bp。序列分析表明,浙貝母HMGR基因保守區(qū)序列與其他9種植物的HMGR基因有較高的相似性(84%~79%);蛋白質(zhì)同源比對、特征區(qū)及系統(tǒng)進(jìn)化樹分析表明,浙貝母HMGR氨基酸片段與其他植物有較高的同源性(95%~88%),與球藥隔重樓和海棗等單子葉植物的親緣關(guān)系較近,據(jù)此,初步確定該基因?yàn)檎阖惸窰MGR基因,命名為Ft HMGR。Ft HMGR基因的克隆及分子鑒定為進(jìn)一步解析該基因在浙貝母甾體類生物堿合成代謝途徑中的分子調(diào)控作用奠定了基礎(chǔ),有助于對浙貝母活性物質(zhì)的合成進(jìn)行調(diào)控,從而提高產(chǎn)量。
【作者單位】: 浙江萬里學(xué)院生物技術(shù)研究所;
【關(guān)鍵詞】: 浙貝母 HMGR 基因克隆 生物信息學(xué)
【基金】:浙江省科技廳育種專項(xiàng)(2012C12912) 寧波市公益類重大專項(xiàng)(2015C110007) 浙江萬里學(xué)院重中之重學(xué)科開放基金項(xiàng)目(KF2015001)
【分類號】:S567.231
【正文快照】: 浙貝母(Fritillaria thunbergii)為百合科貝母屬的一種多年生草本植物,是“浙八味”中最主要的中藥之一,其鱗莖具有清熱化痰、止咳、開郁、散結(jié)之功效,常用于熱痰咳嗽、肺癰、乳癰、痰核等多種病癥的治療[1]。研究表明,浙貝母中主要活性成份是甾體類生物堿,包括浙貝甲素、浙貝
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,本文編號:677674
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