本文關(guān)鍵詞：草菇GH61家族基因的生物信息學(xué)分析及金屬離子對其表達(dá)水平的影響

  更多相關(guān)文章： 草菇 GH家族 串聯(lián)重復(fù) 基因表達(dá)

【摘要】：在前期工作中發(fā)現(xiàn)草菇含有30個GH61家族基因同源物(Vv_gh61_1至Vv_gh61_30),進(jìn)一步分析了這些基因的結(jié)構(gòu)特點以及其編碼蛋白基本性質(zhì)和系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系,并研究了Cu~(2+)和Mn~(2+)對基因表達(dá)水平的影響。分析表明有17個草菇GH61基因串聯(lián)成6個基因簇,存在明顯的串聯(lián)重復(fù)現(xiàn)象,系統(tǒng)發(fā)育樹與基因外顯子位置分析表明串聯(lián)重復(fù)基因分布在同一進(jìn)化分枝上并具有相似的基因結(jié)構(gòu),串聯(lián)重復(fù)基因編碼序列一致性在71% 94%之間。草菇GH61編碼蛋白的氨基酸數(shù)目在217 442aa之間,分子量和等電點分別介于22.4 45.4k Da和5.2 9.3之間,絕大多數(shù)都含有信號肽并定位在細(xì)胞外,都含有Glyco_hydro_61功能域以及CBM1、peroxidase等多樣化的功能域,系統(tǒng)進(jìn)化樹表明草菇GH61家族基因具有3個主要進(jìn)化分枝,與灰蓋鬼傘等的GH61基因有較近的進(jìn)化關(guān)系。金屬離子誘導(dǎo)作用顯示,Mn2+對草菇GH61家族基因的表達(dá)水平存在誘導(dǎo)作用而Cu2+的誘導(dǎo)作用不明顯。
【作者單位】： 國家食用菌工程技術(shù)研究中心農(nóng)業(yè)部南方食用菌資源利用專業(yè)重點實驗室上海市農(nóng)業(yè)遺傳育種重點開放實驗室上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所;上海海洋大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 草菇 GH家族 串聯(lián)重復(fù) 基因表達(dá)
【基金】：上海市科技人才計劃項目(13XD1424700)~~
【分類號】：S646.13
【正文快照】： 草菇Volvariella volvacea是一種源于熱帶、亞熱帶地區(qū)的大型草腐真菌,主要生長在稻草、廢棉、麥稈等富含纖維素的基質(zhì)上。草菇全基因組測序完成后,通過基因注釋發(fā)現(xiàn)了30個GH61(glycosidehydrolases,GH)家族同源基因(Bao et al.2013)。GH61家族(現(xiàn)在劃分為Auxiliary Activitie

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前3條

1 馮飛;王紹文;王娟;劉剛;;里氏木霉GH61家族糖苷酶的高效表達(dá)及酶學(xué)特性研究[J];微生物學(xué)通報;2014年07期

2 李娟;倪新江;樊守金;蔡德華;;金頂側(cè)耳不同生長期幾種胞外酶活性變化[J];吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報;2006年06期

3 李鴻健;譚軍;;基因倍增研究進(jìn)展[J];生命科學(xué);2006年02期

【共引文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 段超;孫璇;薛變麗;李波;陳麗;賈崢榮;南建福;;蘋果枝屑栽培香菇胞外酶酶活變化的研究[J];食用菌;2015年05期

2 楊曼曼;侯紹郅;馬帥;初洋;倪新江;董新偉;張正坦;劉偉;;醋糟栽培對杏鮑菇胞外酶活性的影響[J];湖北農(nóng)業(yè)科學(xué);2015年17期

3 任彩俠;周廣麒;;碳源對蟲草菌產(chǎn)生幾種胞外酶活性的影響[J];工業(yè)微生物;2015年03期

4 張森翔;尹小燕;龔志偉;楊忠華;侯亞利;周衛(wèi);;纖維素酶降解秸稈特性及其基因工程研究進(jìn)展[J];生物技術(shù)通報;2015年05期

5 饒佳;鮑大鵬;李燕;汪瀅;程向陽;王瑩;;草菇GH61家族基因的生物信息學(xué)分析及金屬離子對其表達(dá)水平的影響[J];菌物學(xué)報;2016年05期

6 吳周斌;張健;王佳敏;蘇德偉;林興生;林占q，

本文編號：657335