孟氏隱唇瓢蟲qRT-PCR分析中內(nèi)參基因的篩選
發(fā)布時間:2017-08-09 17:37
本文關(guān)鍵詞:孟氏隱唇瓢蟲qRT-PCR分析中內(nèi)參基因的篩選
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【摘要】:選擇合適的內(nèi)參基因是qRT-PCR研究的關(guān)鍵。本文以孟氏隱唇瓢蟲Cryptolaemus montrouzieri Mulsant為研究材料,利用qRT-PCR技術(shù),對孟氏隱唇瓢蟲4個候選內(nèi)參基因Actin、RPS23、GAPDH和β-tubulin的mRNA的表達量進行了分析,并用Ge Norm、Norm Finder和Best Keeper軟件分析它們在孟氏隱唇瓢蟲不同發(fā)育階段及成蟲不同組織中的表達穩(wěn)定性。結(jié)果表明,以成蟲不同組織為材料時,綜合三種軟件分析結(jié)果顯示4個候選基因表達穩(wěn)定性平均等級值排名為RPS23(rank=1)β-tubulin(rank=2.3)GAPDH(rank=3)Actin(rank=3.7),以不同發(fā)育時期蟲體為材料時,綜合分析結(jié)果顯示4個候選內(nèi)參基因表達穩(wěn)定性平均等級值排名為RPS23(rank=1.7)Actin(rank=2)GAPDH(rank=2.7)β-tubulin(rank=3.7)。綜合分析在瓢蟲不同發(fā)育階段及成蟲不同組織兩種處理下,三種軟件的評價效果,4個候選基因表達穩(wěn)定性等級值的總平均排名為RPS23(rank=1.3)Actin(rank=2.8)=GAPDH(rank=2.8)β-tubulin(rank=3)。RPS23在瓢蟲不同發(fā)育階段及成蟲不同組織中均顯示出較高的表達穩(wěn)定性及與其它基因之間極大的相關(guān)性,可以確定為孟氏隱唇蟲不同發(fā)育階段及成蟲不同組織基因表達分析中一個穩(wěn)定表達的基因,可作為單個內(nèi)參基因或者其它內(nèi)參基因的協(xié)同基因,本實驗為開展孟氏隱唇瓢蟲功能基因表達分析奠定了方法學(xué)基礎(chǔ)。
【作者單位】: 有害生物控制與資源利用國家重點實驗室中山大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;廣東省昆蟲研究所廣東省農(nóng)業(yè)害蟲綜合治理重點實驗室廣東省野生動物保護與利用公共實驗室;
【關(guān)鍵詞】: 孟氏隱唇瓢蟲 qRT-PCR 內(nèi)參基因 表達穩(wěn)定性 GeNorm軟件 NormFinder軟件 BestKeeper軟件
【基金】:國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃(973)項目(2013CB127600) 國家自然科學(xué)基金面上項目(31171899,31572052);國家自然科學(xué)基金項目(31301720)
【分類號】:S476.2
【正文快照】: 實時熒光定量PCR(real time quantitativePCR,qRT-PCR)是在傳統(tǒng)PCR基礎(chǔ)上發(fā)展起來的一種新型核酸定量技術(shù),通過熒光信號對PCR全程進行實時監(jiān)測,既可應(yīng)用于定性研究,如雜合子、純合子鑒定,SNPs(single nucleotidepolymorphisms,單核苷酸多態(tài)性)分析等,也可用于定量研究,如計算
【相似文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前3條
1 劉平;張宇宏;吳紅勝;謝佳沁;鄧從雙;龐虹;;孟氏隱唇瓢蟲的觸角感受器[J];環(huán)境昆蟲學(xué)報;2013年04期
2 趙士熙,曾兆華,吳光遠;孟氏隱唇瓢蟲和臺毛艷瓢蟲對茶椰圓蚧的捕食作用[J];華東昆蟲學(xué)報;2001年01期
3 ;[J];;年期
,本文編號:646529
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