本文關(guān)鍵詞：火炬松生長和松脂性狀相關(guān)候選基因的單核苷酸多樣性分析

  更多相關(guān)文章： 火炬松 候選基因 單核苷酸多態(tài)性 連鎖不平衡

【摘要】：【目的】對火炬松Pinus taeda生長和松脂產(chǎn)量相關(guān)功能基因單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位點(diǎn)進(jìn)行篩選與分析,為分子標(biāo)記輔助育種提供技術(shù)基礎(chǔ)。【方法】利用生物信息學(xué)對火炬松c DNA文庫進(jìn)行整理、比對、剪接、注釋,挑選出與生長素、赤霉素、細(xì)胞分裂素及蒎烯合成相關(guān)的非重復(fù)序列基因(Unigene)作為候選基因片段,利用MEGA5.0和Dna SP4.0軟件對火炬松36個單株的8個候選基因片段進(jìn)行序列比對和分析。【結(jié)果】所測序列總長為5 177 bp,檢測到184個SNP位點(diǎn),平均36.9 bp的基因序列中出現(xiàn)1個SNP位點(diǎn),其中123個為非同義突變、61個為同義突變SNP位點(diǎn)。核苷酸多態(tài)性πa和θw分別為0.020和0.016。對8個候選基因片段內(nèi)SNP位點(diǎn)進(jìn)行的連鎖不平衡分析顯示,隨著核苷酸序列長度的延伸,SNP位點(diǎn)的連鎖不平衡在基因內(nèi)部迅速衰退(R2≤0.2)�！窘Y(jié)論】在火炬松中,基于候選基因內(nèi)SNP位點(diǎn)間的連鎖不平衡作圖是可行的。
【作者單位】： 廣東省林業(yè)科學(xué)研究院;廣東省森林植物種質(zhì)創(chuàng)新與利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/華南農(nóng)業(yè)大學(xué)林學(xué)與風(fēng)景園林學(xué)院;英德市林業(yè)科學(xué)研究所;
【關(guān)鍵詞】： 火炬松 候選基因 單核苷酸多態(tài)性 連鎖不平衡
【基金】：廣東省林業(yè)科技創(chuàng)新專項(xiàng)資金(2011KJCX013-02) “十二五”農(nóng)村領(lǐng)域國家科技計(jì)劃專題(2012BAD01B0203) 聯(lián)合國發(fā)展計(jì)劃署援建的火炬松改良種子園項(xiàng)目(CPR/91/153;1992-1996)
【分類號】：S718.4
【正文快照】： 優(yōu)先出版網(wǎng)址:http://www.cnki.net/kcms/detail/44.1110.s.20151207.1133.028.html林木的重要性狀大多屬于數(shù)量性狀,由許多基因和環(huán)境共同作用來調(diào)控其生長與發(fā)育。傳統(tǒng)的數(shù)量遺傳學(xué)不能檢測控制數(shù)量性狀的基因的數(shù)量、基因在染色體上的位置、每個位點(diǎn)的貢獻(xiàn)大小以及基因間的

【參考文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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1 羅晶,張宏,楊潤清;動態(tài)性狀候選基因檢測效率分析[J];上海交通大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)科學(xué)版);2004年04期

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3 王莉興;魯紹雄;;豬產(chǎn)仔數(shù)相關(guān)候選基因的研究進(jìn)展[J];上海畜牧獸醫(yī)通訊;2008年04期

4 楊海玲;曾勇慶;王慧;;豬抗病和免疫相關(guān)候選基因的研究進(jìn)展[J];豬業(yè)科學(xué);2010年01期

5 吳語寧;叢凡m

本文編號：614868