本文關(guān)鍵詞：全基因外顯子測序技術(shù)在肝細胞癌侵襲性研究中的應(yīng)用

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【摘要】：目的肝細胞癌(HCC)是一種常見的惡性腫瘤,全球范圍內(nèi)居惡性腫瘤死因第三位,HCC的發(fā)生與癌基因和(或)抑癌基因突變有關(guān),但發(fā)病機制仍不明確,全基因組外顯子測序技術(shù)(Whole exome sequence,WES)是一種經(jīng)濟、高效的測序方法,可用于篩選鑒定復(fù)雜疾病的相關(guān)致病基因。本實驗擬采用WES技術(shù)對臨床上不同轉(zhuǎn)移潛能HCC組織及癌旁正常肝組織進行對比分析,初步探討肝癌術(shù)后復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移的基因序列改變包括各種突變。方法將10例HCC分按臨床特征分為高轉(zhuǎn)移潛能組和低轉(zhuǎn)移潛能組,分別提取HCC組織及周圍正常肝組織DNA,使用Complete Genomics(CG)Black Bird測序平臺進行測序,所得數(shù)據(jù)同參考序列對比篩選變異基因,首先進行兩組間對比后篩選出高潛能轉(zhuǎn)移組中特有的突變,其次篩選出僅在腫瘤組織中的突變。結(jié)果1.有58個突變僅在高轉(zhuǎn)移潛能組中出現(xiàn);其中CCND3(rs1051130T/G)、CCRL2(rs3204849T/A)、CNTN2(rs2229866C/T)、FAT2(rs10044879G/A、rs150946802A/T*、rs2278370G/A)、MAP3K19(rs1112542G/C,rs16831235C/T)、PARP15(rs12489170G/A)、RECK(rs36108087G/A*,rs16932912G/A)、SDC1(rs10205485T/A)曾被報道過同一些腫瘤侵襲、轉(zhuǎn)移有關(guān);2.ADD1(rs4961G/T)、ALDH2(rs112235942G/T*,rs671G/A,rs145077856G/C)及FTSJ3(rs2727288A/T)頻繁突變值得關(guān)注;3.有22個突變僅存在腫瘤組織中,其中ADGB(rs147022152A/T*、rs147045354G/T*)、CTNNB1(rs121913412A/G)、SAMD9L(rs92764797G/A*、rs92763885T/G*)曾被報道過同腫瘤發(fā)生有關(guān)。結(jié)論1.CCND3、CCRL2、CNTN2、FAT2、MAP3K19、PARP15、RECK、SDC1突變與HCC術(shù)后侵襲轉(zhuǎn)移密切相關(guān);2.ADD1、ALDH2及FTSJ3突變可能與HCC術(shù)后侵襲轉(zhuǎn)移有關(guān),還需進一步驗證;3.ADGB、CTNNB1、SAMD9L的突變可能與HCC的發(fā)生有關(guān)。
【關(guān)鍵詞】：肝細胞癌 外顯子 外顯子測序技術(shù) 侵襲 轉(zhuǎn)移
【學(xué)位授予單位】：南華大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：R735.7
【目錄】：

• 縮略詞表4-5
• 摘要5-7
• Abstract7-10
• 引言10-14
• 材料和儀器14-16
• 方法和步驟16-20
• 結(jié)果與分析20-40
• 討論40-44
• 結(jié)論44-46
• 參考文獻46-52
• 綜述 全基因外顯子測序在肝細胞癌復(fù)發(fā)、轉(zhuǎn)移研究中的應(yīng)用52-60
• 參考文獻57-60
• 致謝60

【參考文獻】

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本文編號：611708