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噪聲和延遲協(xié)同對基因網(wǎng)絡中開關切換行為研究

發(fā)布時間:2017-08-02 19:08

  本文關鍵詞:噪聲和延遲協(xié)同對基因網(wǎng)絡中開關切換行為研究


  更多相關文章: 噪聲 時間延遲 概率密度 平均首通時間 隨機共振


【摘要】:本文研究了單基因網(wǎng)絡系統(tǒng)、基因表達中的緊急雙穩(wěn)態(tài)模型和miR-17-92調(diào)控Myc/E2F基因表達系統(tǒng)中關聯(lián)噪聲作用下的時間延遲效應。首先在第二章闡述了與本論文相關的隨機和延遲理論,然后運用小時間延遲近似理論和隨機模擬方法,分析了關聯(lián)噪聲強度和延遲時間對基因網(wǎng)絡系統(tǒng)動力學行為的影響。獲得了如下研究成果:第三章,在單基因網(wǎng)絡中研究了時間延遲(Td,T8,Tg)和關聯(lián)噪聲強度λi(i=d,s,g)的協(xié)同作用分別對基因開關切換過程中概率密度、開關切換時間即平均首通時間的影響。結果表明:(1)關聯(lián)噪聲λi可以使蛋白質(zhì)濃度從高濃度態(tài)轉化到低濃度態(tài),換句話說可以誘導基因開關從閉合狀態(tài)到斷開狀態(tài)的切換。(2)當λi0時,降解過程中的時間延遲τd可以誘導基因開關從斷開狀態(tài)到閉合狀態(tài)轉化,合成過程和全局過程中時間延遲T8,T9卻誘導開關從閉合到斷開態(tài);當λi0時,τd和τs可以誘導開關從斷開態(tài)切換到閉合態(tài),而此時全局過程中時間延遲卻誘導開關從閉合切換到斷開態(tài)。(3)開關切換的時間也就是兩個態(tài)之間轉化的平均首通時間并在噪聲誘導下出現(xiàn)了極大值(即噪聲增強穩(wěn)定性效應),然而在降解過程時間延遲的影響下這個極大值消失。(4)τd和τs在基因開關切換的過程中對這一現(xiàn)象的影響起著相對的作用,即它們對平均首通時間的影響是相互抵消的。第四章,對基因表達中的緊急雙穩(wěn)態(tài)模型研究表明:(1)隨著乘性噪聲D1,D2和加性噪聲Q1,Q2的增大,SPD的結構從高濃度態(tài)向低濃度態(tài)躍遷,即出現(xiàn)了緊急雙穩(wěn)現(xiàn)象。(2)但是λ對SPD的影響顯示并未出現(xiàn)緊急雙穩(wěn)現(xiàn)象。當K和τ增大時,蛋白質(zhì)高濃度態(tài)增大,低濃度態(tài)減小至消失,也就是說緊急雙穩(wěn)現(xiàn)象消失。(3)進一步定量分析了噪聲和延遲反饋對兩穩(wěn)定態(tài)之間躍遷時間的影響。MFPT作為噪聲強度(D或Q)的函數(shù)存在極大值。關聯(lián)噪聲強度λ,時間延遲丁及延遲反饋強度K能夠增強高濃度態(tài)的穩(wěn)定性。第五章,對miR-17-92調(diào)控的Myc/E2F基因網(wǎng)絡系統(tǒng)研究結果顯示:(1)時間延遲τ和關聯(lián)噪聲強度λ可以使蛋白質(zhì)濃度從低濃度往高濃度態(tài)躍遷。(2)MFPT作為噪聲強度(D或Q)的函數(shù)存在極大值,這個極大值預示了存在一個近似的噪聲強度能使MFPT出現(xiàn)極大值。也就是說時間延遲τ和關聯(lián)噪聲強度λ增強了高濃度態(tài)的穩(wěn)定性。(3)SNR隨著Q的變化存在隨機共振和隨機反共振現(xiàn)象。然而,隨著D變化只存在隨機共振現(xiàn)象。當SNR隨著Q變化時,λ和7τ都增強了隨機共振,削弱隨機反共振現(xiàn)象。SNR隨著D變化時出現(xiàn)隨機共振。λ增強了隨機共振現(xiàn)象,然而τ卻削弱了隨機共振現(xiàn)象。不過當SNR作為λ的函數(shù)時,τ不僅削弱了隨機共振現(xiàn)象,而且使隨機共振現(xiàn)象消失。
【關鍵詞】:噪聲 時間延遲 概率密度 平均首通時間 隨機共振
【學位授予單位】:昆明理工大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:Q811.4
【目錄】:
  • 摘要6-7
  • Abstract7-11
  • 第一章 引言11-17
  • 1.1 本論文的研究背景和現(xiàn)狀11-14
  • 1.1.1 噪聲和延遲協(xié)同作用下的非線性系統(tǒng)11
  • 1.1.2 基因表達系統(tǒng)中噪聲和時間延遲的研究現(xiàn)狀11-14
  • 1.2 本論文的研究意義14-16
  • 1.3 本論文的主要內(nèi)容和安排16-17
  • 第二章 隨機和延遲的相關理論17-41
  • 2.1 理論分析17-38
  • 2.1.1 布朗運動的Langevin方程17-20
  • 2.1.2 高斯白噪聲驅(qū)動下的Fokker-Planck方程20-25
  • 2.1.3 噪聲和延遲協(xié)同作用下的系統(tǒng)Fokker-Planck方程25-31
  • 2.1.4 平均首通時間31-35
  • 2.1.5 隨機共振35-38
  • 2.2 隨機模擬38-41
  • 第三章 噪聲和延遲協(xié)同作用對單基因網(wǎng)絡系統(tǒng)的影響41-57
  • 3.1 噪聲和延遲協(xié)同作用下的單基因網(wǎng)絡系統(tǒng)模型41-44
  • 3.2 噪聲和延遲協(xié)同對概率分布的影響44-49
  • 3.3 噪聲和延遲協(xié)同對首通時間的影響49-52
  • 3.4 小結與討論52-57
  • 第四章 噪聲和延遲誘導下的基因表達中的緊急雙穩(wěn)態(tài)模型57-73
  • 4.1 噪聲和延遲協(xié)同作用下的緊急雙穩(wěn)態(tài)模型57-58
  • 4.2 噪聲和延遲反饋對概率分布的影響58-64
  • 4.3 噪聲和延遲反饋對首通時間的影響64-67
  • 4.4 小結與討論67-73
  • 第五章 噪聲和延遲作用下的miR-17-92調(diào)控Myc/E2F基因表達系統(tǒng)73-89
  • 5.1 噪聲和延遲協(xié)同作用下的miR-17-92調(diào)制E2F/Myc基因表達模型73-76
  • 5.2 噪聲和延遲協(xié)同對概率分布的影響76-79
  • 5.3 噪聲和延遲協(xié)同對首通時間的影響79-82
  • 5.4 噪聲和延遲協(xié)同對隨機共振的影響82-86
  • 5.5 小結與討論86-89
  • 第六章 總結與展望89-91
  • 6.1 總結89-90
  • 6.2 展望90-91
  • 致謝91-93
  • 參考文獻93-105
  • 附錄A (攻讀碩士學位期間發(fā)表的學術論文)105-107
  • 附錄B (攻讀碩士學位期間參與項目及獲獎)107

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本文編號:610769

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