發(fā)布時間：2017-08-02 06:06

  本文關(guān)鍵詞：水稻矮稈基因iga-1的序列變異和表達分析

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【摘要】：該研究以水稻矮稈突變體cha-2為材料,對控制其表型性狀的iga-1基因進行候選基因篩選,利用基因注釋數(shù)據(jù)庫對定位區(qū)間進行候選基因預(yù)測,通過ORF及其上下游調(diào)控區(qū)域的測序、序列比對及關(guān)鍵元件分析進行序列變異研究,半定量PCR檢測目標(biāo)基因的表達模式,明確其在基因序列、表達模式的變異,探討其分子遺傳調(diào)控機理。結(jié)果顯示:(1)在隱性核基因iga-1精細定位基礎(chǔ)上預(yù)測得到3個ORF,其中2個編碼dnaJ分子伴侶(含有dnaJ結(jié)構(gòu)域的蛋白),分別是LOC_Os05g26902和LOC_Os05g26926;另外1個為已克隆的水稻矮稈基因RGA1(LOC_Os05g26890)。(2)ORF序列分析表明矮稈突變體cha-2與野生型僅在RGA1基因座存在SNP變異,但未造成氨基酸編碼的改變。(3)表達模式分析發(fā)現(xiàn),矮稈突變體cha-2的RGA1基因在種子萌發(fā)期、二葉期、四葉期和分蘗期等4個發(fā)育時期均不表達,且在‘中花11’、‘石狩白茅’的遺傳背景下穩(wěn)定遺傳,均顯現(xiàn)出失活狀態(tài),初步確定RGA1為iga-1的候選基因。(4)對RGA1基因上游和下游調(diào)控轉(zhuǎn)錄關(guān)鍵區(qū)進行測序結(jié)果表明,突變體cha-2存在865bp的大片段缺失,包括第1外顯子、部分第1內(nèi)含子和轉(zhuǎn)錄起始上游區(qū)域。研究推斷,突變體cha-2的矮稈基因iga-1正是沒有活性的RGA1基因,其轉(zhuǎn)錄關(guān)鍵區(qū)域的大片段缺失,導(dǎo)致無法正常轉(zhuǎn)錄表達。
【作者單位】： 華南農(nóng)業(yè)大學(xué)國家植物航天育種工程技術(shù)研究中心;
【關(guān)鍵詞】： 水稻 矮稈基因 缺失突變 G蛋白α亞基 iga-
【基金】：國家自然科學(xué)基金(31200250) 國家“863”計劃(2012AA101201) 廣州市對外科技合作項目(2014J4500030) 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項資金(CARS-01-12)
【分類號】：S511.21
【正文快照】： 株高和分蘗是水稻株型結(jié)構(gòu)中的兩個重要農(nóng)藝性狀,也是影響產(chǎn)量的關(guān)鍵因素[1]。自然變異產(chǎn)生的半矮稈基因sd-1在水稻育種史上具有重要影響[2-3],利用sd-1系列矮源種質(zhì),中國在水稻矮化育種上取得重要進展,先后育成了大批高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、抗倒伏的優(yōu)良品種在生產(chǎn)上大面積應(yīng)用。但是,

【相似文獻】

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本文編號：607898