本文關(guān)鍵詞：黃果柑XET基因的克隆及其序列分析

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【摘要】：以成熟的黃果柑果實(shí)為材料,根據(jù)已登錄植物的XET基因并參考甜橙基因組設(shè)計(jì)特異性引物,采用同源克隆方法,獲得黃果柑XET基因完整的編碼區(qū)序列,命名為Cit XET。運(yùn)用生物學(xué)軟件對(duì)該序列及其編碼的氨基酸序列進(jìn)行相關(guān)生物信息學(xué)及結(jié)構(gòu)功能分析,結(jié)果顯示黃果柑XET基因長(zhǎng)960 bp,與其它植物序列具有較高的同源性。該基因編碼319個(gè)氨基酸,蛋白質(zhì)分子量為37.4547 k D,等電點(diǎn)為9.05,分子式為C_(1724)H_(2548)N_*(448)O_(466)S_(14),是一個(gè)具有跨膜結(jié)構(gòu)的親水性蛋白。序列比對(duì)及進(jìn)化樹(shù)分析,XET在進(jìn)化的過(guò)程中具有高度的保守性。同時(shí),Cit XET蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)有21%的α-螺旋,30.72%的延伸鏈,9.09%的β-轉(zhuǎn)角,39.18%的無(wú)規(guī)蜷曲。黃果柑XET具有GH16等結(jié)構(gòu)域,屬于糖苷水解酶GH16超家族的成員,其含有該家族的特征基序DEIDFEFLG和β-卷芯(β-jellyroll)折疊結(jié)構(gòu),同時(shí)預(yù)測(cè)該蛋白質(zhì)可能參與碳水化合物代謝,木葡聚糖代謝,細(xì)胞壁生物合成等過(guò)程。本研究分離鑒定了黃果柑XET基因,同時(shí)初步了解該基因的生物學(xué)信息,有助于進(jìn)一步探討其的表達(dá)模式和具體功能,為黃果柑果實(shí)品質(zhì)的改善提供理論依據(jù)。
【作者單位】： 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院;四川農(nóng)業(yè)大學(xué)果蔬研究所;
【關(guān)鍵詞】： 黃果柑 XET 克隆 序列分析
【基金】：四川省科技廳項(xiàng)目(2011NZ0034) 四川省教育廳項(xiàng)目(2013SZX0054) 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)研究生社會(huì)實(shí)踐與科技服務(wù)團(tuán)項(xiàng)目(ACT201304)共同資助
【分類(lèi)號(hào)】：S666
【正文快照】：

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本文編號(hào)：604989