都柳江鲇形目?jī)煞N經(jīng)濟(jì)魚類種群Cyt b基因的遺傳多樣性分析
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【摘要】:【目的】研究分析貴州都柳江鲇、斑鱧種群細(xì)胞色素b基因(Cyt b)的遺傳多樣性,為都柳江鲇形目經(jīng)濟(jì)魚類資源的保護(hù)和開發(fā)利用提供參考依據(jù)。【方法】以PCR擴(kuò)增都柳江鲇、斑溹種群的Cytb基因序列,經(jīng)雙向測(cè)序、拼接后采用相關(guān)在線軟件進(jìn)行序列變異及遺傳多樣性分析�!窘Y(jié)果】都柳江鲇、斑溹種群Cyt b基因序列均為1122 bp,分別檢測(cè)到46和15個(gè)變異位點(diǎn),對(duì)應(yīng)定義為11個(gè)單倍型(NHap1~NHap11)和10個(gè)單倍型(BHap1~BHap10)。都柳江鲇、斑溹種群的單倍型多樣性指數(shù)、核苷酸多樣性指數(shù)分別為0.646、0.00899和0.610、0.00101。都柳江鲇、斑溹種群Cytb基因序列均編碼374個(gè)氨基酸,包含20種氨基酸,以亮氨酸平均含量最高(17.65%和16.58%)、半胱氨酸平均含量最低(0.80%和0.78%)。4種堿基在這兩種魚類Cyt b基因密碼子第1位點(diǎn)上出現(xiàn)頻率約等,在第2、3位點(diǎn)上的出現(xiàn)頻率則存在明顯差異。都柳江鲇、斑溹種群Cyt b基因密碼子第3位點(diǎn)上的變異頻率顯著高于第1和第2位點(diǎn),但第3位點(diǎn)上的變異多為同義突變�!窘Y(jié)論】都柳江鲇種群大小穩(wěn)定,具有較豐富的遺傳多樣性;都柳江斑溹種群遺傳多樣性較匱乏,可能經(jīng)歷過瓶頸效應(yīng)和種群擴(kuò)張事件,急需開展種群保護(hù)和恢復(fù)工作。
【作者單位】: 貴州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院;貴州大學(xué)特種水產(chǎn)研究所;
【關(guān)鍵詞】: 鲇 斑溹 Cyt b基因 遺傳多樣性 都柳江
【基金】:貴州省留學(xué)人員科技活動(dòng)項(xiàng)目(黔人項(xiàng)目資助合同[2013]10號(hào))
【分類號(hào)】:S917.4
【正文快照】: 0引言 研右音 guftatus)、為我國(guó)重要淡水經(jīng)濟(jì)魚類,分別隸屬于鲇形目(Siluriformes)的鲇科(Siluridae)和SI科(Bagridae)。鲇在我國(guó)各大水系均有分布(除新疆和西藏外);斑鰭主要分布于錢塘江、九龍江和珠江等水系(褚新洛等,1999),因其肉質(zhì)細(xì)嫩、味道鮮美、無肌間刺等優(yōu)點(diǎn),被
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,本文編號(hào):600464
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