2013~2014年中國大陸四株不同基因型麻疹病毒分離株血凝素基因特征分析
發(fā)布時間:2017-07-27 07:07
本文關(guān)鍵詞:2013~2014年中國大陸四株不同基因型麻疹病毒分離株血凝素基因特征分析
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【摘要】:研究2013~2014年中國大陸分離到4株不同基因型麻疹野毒株血凝素蛋白(HA)編碼基因的基因和氨基酸特征及變異程度。選取2013~2014年我國優(yōu)勢基因型H1a1株,輸入基因型B3、D8和D9各1株作為代表株,核酸提取,采用逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)擴增H基因編碼區(qū)全序列(1 854bp)并測序,使用sequencher5.0進(jìn)行序列拼接,并與GenBank下載的H1基因型4株、B3基因型和D8基因型各8株、D9基因型2株及中國A基因型麻疹疫苗株滬191(S191)和長47(C47)H基因全序列進(jìn)行比較分析,使用MEGA5.0比對并構(gòu)建親緣性關(guān)系樹及分析其核苷酸和氨基酸差異。4株不同基因型野毒株與A基因型疫苗株H基因核苷酸和氨基酸同源性為94.2%~96.7%,95.4%~96.7%,氨基酸差異數(shù)為20~28,其中Beijing14-1(H1a)與A基因型疫苗株H基因同源性最低。H1a毒株與1993~1994年分離的毒株核苷酸同源性較高為97.7%~98.2%。Beijing14-1(H1a)和Shanghai14-1(B3)第240位點氨基酸位點由S→N,導(dǎo)致HA蛋白的1個N-糖基化位點丟失。4株野毒株與中國A基因型疫苗株H基因核苷酸和氨基酸同源性較高,且重要中和抗原位點未出現(xiàn)明顯突變。從基因?qū)用嫔戏治鯝基因型疫苗株對我國流行的H1a亞型及B3、D8和D9輸入性基因型野毒株感染仍具有較好的保護(hù)效果。
【作者單位】: 中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所;山東省疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所;
【關(guān)鍵詞】: 血凝素蛋白 麻疹病毒 基因特征 輸入性
【基金】:國家自然科學(xué)基金課題(項目號:81371791) 國家科學(xué)技術(shù)重大專項艾滋病和病毒性肝炎等重大傳染病防治課題(編號:2012ZX10004215、2013ZX10004202、2012ZX10004401、2012ZX10004201-003) 世界衛(wèi)生組織西太平洋區(qū)麻疹參比實驗室的職能(WP CHN AAA 011XZ 08)
【分類號】:R373
【正文快照】: 麻疹是一種由麻疹病毒感染引起的急性發(fā)熱出疹性呼吸道傳染病。麻疹病毒是副粘病毒科麻疹病毒屬[1],為單股負(fù)鏈RNA病毒,基因組含有6個開放閱讀框架,分別編碼6種蛋白,從5’到3’分別為依賴于RNA的RNA聚合酶,血凝素蛋白(HA),融合蛋白(F),膜蛋白(M),磷蛋白(P),和核蛋白(N),其中HA
【相似文獻(xiàn)】
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,本文編號:580261
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