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安吉小鯢MHCⅡ類基因及系統(tǒng)地理學研究

發(fā)布時間:2017-07-26 20:07

  本文關鍵詞:安吉小鯢MHCⅡ類基因及系統(tǒng)地理學研究


  更多相關文章: 安吉小鯢 MHCⅡB基因 細胞色素b 重組活化基因2 遺傳多樣性 分子系統(tǒng)地理學


【摘要】:安吉小鯢(Hynobius amjiensis)是我國特有極度瀕危物種,分布范圍狹窄,種群數(shù)量稀少,面臨著滅絕的危險。本研究選用MHC (Major histocompatibility complex)基因、細胞色素b(cytochrome b)、重組活化基因2(recombination activating gene)三種分子標記,對安吉小鯢的遺傳多樣性、遺傳結構、系統(tǒng)發(fā)生關系、種群歷史動態(tài)等進行研究,主要的成果如下:(1)安吉小鯢三個地理種群的遺傳多樣性水平低。基于MHC ⅡB數(shù)據(jù)、Cyt b數(shù)據(jù)、RAG2數(shù)據(jù)對浙江清涼峰(ZJQLF)種群、安徽清涼峰(AHQLF)種群、浙江省龍王山(LWS)種群的遺傳多樣性水平進行分析,表明安吉小鯢群體呈現(xiàn)出低水平的的遺傳多樣性,應加強保護管理。(2)空島效應導致安吉小鯢群體分化程度大;贑yt b和RAG2基因整合數(shù)據(jù)的分析,ZJQLF種群、AHQLF種群、LWS種群間的交流不頻繁,各個種群間遺傳分化程度非常高。安吉小鯢僅分布于海拔高于1300m的泥炭蘚濕地中,空島效應導致處于不同山系的安吉小鯢種群交流受阻,為種群間的遺傳分化提供了機會。(3)安吉小鯢種群曾發(fā)生過種群擴張。安徽清涼峰的氣候可能受到第四紀冰期的影響,對安吉小鯢種群造成較大的影響。AHQLF種群位于安徽清涼峰腹部,受更新世末次冰期影響較大,具有明顯的擴種群張過程。ZJQLF種群和LWS種群長時間相對穩(wěn)定,未經(jīng)歷過擴張。(4)安吉小鯢三個地理種群被定義為兩個進化顯著單元。遵循保護遺傳學的原理,本研究制定了兩個安吉小鯢保護單元,即東部LWS種群為一個獨立的進化顯著單元,西部的ZJQLF種群與AHQLF種群作為一個大的進化顯著單元。因此,安吉小鯢可作為東部和西部兩個獨立的管理單元開展保護工作。
【關鍵詞】:安吉小鯢 MHCⅡB基因 細胞色素b 重組活化基因2 遺傳多樣性 分子系統(tǒng)地理學
【學位授予單位】:浙江師范大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:Q953;Q958
【目錄】:
  • 摘要3-5
  • ABSTRACT5-9
  • 第一章 綜述9-24
  • 1 安吉小鯢綜述9-13
  • 1.1 安吉小鯢生物學特征及其資源現(xiàn)狀9-10
  • 1.2 安吉小鯢研究現(xiàn)狀10-13
  • 2 兩棲類MHC基因研究文獻綜述13-19
  • 2.1 兩棲類MHC的分類、組織分布13-14
  • 2.2 兩棲類MHC的結構特點14-16
  • 2.3 MHC基因多態(tài)性維持機制16-18
  • 2.4 MHC基因在保護遺傳學中的應用18-19
  • 3 系統(tǒng)地理學19-22
  • 3.1 系統(tǒng)地理學簡介19
  • 3.2 分子系統(tǒng)地理學在兩棲類中的應用19-20
  • 3.3 分子標記的選用20-22
  • 4 本研究論文的主要目的和意義22-24
  • 第二章 MHCⅡB基因的克隆及多態(tài)性分析24-39
  • 1. 引言24
  • 2 材料與方法24-32
  • 2.1 實驗材料24-26
  • 2.2 實驗方法26-32
  • 3 實驗結果32-37
  • 3.1 基因組總RNA的提取32
  • 3.2 MHCⅡB基因exon2和exon3的克隆結果32-33
  • 3.3 MHCⅡB基因exon2側翼intronl序列的擴增結果33
  • 3.4 安吉小鯢MHCⅡB exon2基因SSCP分析33-34
  • 3.5 安吉小鯢MHCⅡB基因的序列變異分析34-36
  • 3.6 選擇作用檢測結果36-37
  • 3.7 重組檢測37
  • 4 討論37-39
  • 4.1 MHC基因的遺傳多樣性37-38
  • 4.2 MHC基因多態(tài)性維持機制的分析38-39
  • 第三章 安吉小鯢的系統(tǒng)地理學研究39-57
  • 1. 引言39
  • 2 材料和方法39-42
  • 2.1 樣本采集39-40
  • 2.2 實驗方法40-42
  • 3 實驗結果42-53
  • 3.1 序列擴增及測序結果42-43
  • 3.2 遺傳多樣性分析43-47
  • 3.3 系統(tǒng)發(fā)育分析47-49
  • 3.4 種群遺傳結構分析49-51
  • 3.5 群體歷史動態(tài)分析51-53
  • 4 討論53-57
  • 4.1 安吉小鯢的遺傳多樣性研究53-54
  • 4.2 安吉小鯢的系統(tǒng)發(fā)育分析54
  • 4.3 安吉小鯢的遺傳結構研究54-55
  • 4.4 安吉小鯢的種群動態(tài)研究55-56
  • 4.5 保護啟示56-57
  • 第四章 結論57-59
  • 參考文獻59-69
  • 攻讀學位期間取得的研究成果發(fā)表文章69-70
  • 致謝70-72

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前3條

1 溫濤,謝鋒,江建平,鄭中華;中國有尾兩棲動物的多樣性保護及俗名探析[J];水利漁業(yè);2005年02期

2 顧輝清,馬小梅,王玨,杜振華,樓信權;安吉小鯢種群數(shù)量和數(shù)量動態(tài)的研究[J];四川動物;1999年03期

3 曾曉茂,費梁,葉昌媛,江建平;三種小鯢和極北鯢的核型[J];動物學研究;1997年03期

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本文編號:578092

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