發(fā)布時間：2017-07-26 05:04

  本文關鍵詞：桃WRKY基因家族全基因組鑒定和表達分析

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【摘要】：WRKY轉錄因子是植物中最大的轉錄調(diào)控家族之一,在生物和非生物脅迫以及植物生長和發(fā)育過程中起著重要調(diào)控作用。本文利用HMMER 3.0軟件,使用WRKY保守域全蛋白序列(Pfam數(shù)據(jù)庫編號:PF03106)鑒定桃(Prunus persica L.)基因組中的WRKY基因;利用DNAMAN 5.0、Web Logo 3、MEGA5.1、Map Inspect和MEME等軟件對其蛋白序列進行生物信息學分析。本文共鑒定得到61個桃WRKY基因。進化樹分析結果顯示,桃WRKY蛋白分為Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ類型,類型Ⅰ分為Ⅰ-C亞組和Ⅰ-N亞組,類型Ⅱ分為Ⅱ-a、II-b、II-c、II-d和II-e亞組。WRKY結構域分析顯示,WRKY結構域高度保守,絕大多數(shù)都含有WRKYGQK七肽和鋅指結構。染色體定位分析顯示,桃WRKY基因分布于8條染色體中,呈不均勻分布。內(nèi)含子和外顯子結構分析表明,WRKY基因結構進化高度保守。保守元件分析表明,桃WRKY基因家族包含5個保守元件,元件1、2和3為WRKY盒,元件4、5為未知盒。桃WRKY基因家族都包含有WRKY盒,類型Ⅰ中含有2個WRKY盒;II-d亞組中含有未知元件5。半定量和熒光定量PCR結果顯示,16個WRKY基因均在桃的根、莖、葉、花和果中表達,但其相對表達水平不同。
【作者單位】： 中國農(nóng)業(yè)科學院果樹研究所;
【關鍵詞】： 桃 WRKY 轉錄因子 基因家族 表達分析
【基金】：國家自然科學基金項目(編號:31401852) 農(nóng)業(yè)部公益性行業(yè)項目(編號:201203034)資助~~
【分類號】：Q943.2;S662.1
【正文快照】： 桃(Prunus persica L.)是我國水果產(chǎn)業(yè)的重要支柱產(chǎn)業(yè)之一,其種植面積和總產(chǎn)量僅次于蘋果和梨。但是在桃產(chǎn)業(yè)高速發(fā)展的同時,各種病害也造成了巨大的危害和損失,已成為制約我國桃產(chǎn)業(yè)可持續(xù)發(fā)展的一道門檻。大量研究表明,植物WRKY轉錄因子作為在寄主?病原物互作中一個重要的轉

【共引文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

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