發(fā)布時(shí)間：2017-07-26 05:04

  本文關(guān)鍵詞：桃WRKY基因家族全基因組鑒定和表達(dá)分析

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【摘要】：WRKY轉(zhuǎn)錄因子是植物中最大的轉(zhuǎn)錄調(diào)控家族之一,在生物和非生物脅迫以及植物生長(zhǎng)和發(fā)育過(guò)程中起著重要調(diào)控作用。本文利用HMMER 3.0軟件,使用WRKY保守域全蛋白序列(Pfam數(shù)據(jù)庫(kù)編號(hào):PF03106)鑒定桃(Prunus persica L.)基因組中的WRKY基因;利用DNAMAN 5.0、Web Logo 3、MEGA5.1、Map Inspect和MEME等軟件對(duì)其蛋白序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析。本文共鑒定得到61個(gè)桃WRKY基因。進(jìn)化樹(shù)分析結(jié)果顯示,桃WRKY蛋白分為Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ類型,類型Ⅰ分為Ⅰ-C亞組和Ⅰ-N亞組,類型Ⅱ分為Ⅱ-a、II-b、II-c、II-d和II-e亞組。WRKY結(jié)構(gòu)域分析顯示,WRKY結(jié)構(gòu)域高度保守,絕大多數(shù)都含有WRKYGQK七肽和鋅指結(jié)構(gòu)。染色體定位分析顯示,桃WRKY基因分布于8條染色體中,呈不均勻分布。內(nèi)含子和外顯子結(jié)構(gòu)分析表明,WRKY基因結(jié)構(gòu)進(jìn)化高度保守。保守元件分析表明,桃WRKY基因家族包含5個(gè)保守元件,元件1、2和3為WRKY盒,元件4、5為未知盒。桃WRKY基因家族都包含有WRKY盒,類型Ⅰ中含有2個(gè)WRKY盒;II-d亞組中含有未知元件5。半定量和熒光定量PCR結(jié)果顯示,16個(gè)WRKY基因均在桃的根、莖、葉、花和果中表達(dá),但其相對(duì)表達(dá)水平不同。
【作者單位】： 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院果樹(shù)研究所;
【關(guān)鍵詞】： 桃 WRKY 轉(zhuǎn)錄因子 基因家族 表達(dá)分析
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(編號(hào):31401852) 農(nóng)業(yè)部公益性行業(yè)項(xiàng)目(編號(hào):201203034)資助~~
【分類號(hào)】：Q943.2;S662.1
【正文快照】： 桃(Prunus persica L.)是我國(guó)水果產(chǎn)業(yè)的重要支柱產(chǎn)業(yè)之一,其種植面積和總產(chǎn)量?jī)H次于蘋(píng)果和梨。但是在桃產(chǎn)業(yè)高速發(fā)展的同時(shí),各種病害也造成了巨大的危害和損失,已成為制約我國(guó)桃產(chǎn)業(yè)可持續(xù)發(fā)展的一道門(mén)檻。大量研究表明,植物WRKY轉(zhuǎn)錄因子作為在寄主?病原物互作中一個(gè)重要的轉(zhuǎn)

【共引文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 陳歐;王振英;;植物WRKY轉(zhuǎn)錄因子結(jié)構(gòu)及功能研究進(jìn)展[J];生物學(xué)通報(bào);2008年06期

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 李娜;;WRKY耐逆研究進(jìn)展[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2010年13期

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3 郝林,徐昕;植物轉(zhuǎn)錄因子WRKY家族的結(jié)構(gòu)及功能[J];植物生理學(xué)通訊;2004年02期

4 仇玉萍,荊邵娟,付堅(jiān),李璐,余迪求;13個(gè)水稻W(wǎng)RKY基因的克隆及其表達(dá)譜分析[J];科學(xué)通報(bào);2004年18期

5 李蕾,謝丙炎,戴小楓,楊宇紅;WRKY轉(zhuǎn)錄因子及其在植物防御反應(yīng)中的作用[J];分子植物育種;2005年03期

6 ;Leucine zipper like structure in rice WRKY89 enhances its affinity for binding with W box elements[J];Chinese Science Bulletin;2005年10期

7 王海華,郝中娜,謝科,吳坤陸,郭澤建;水稻W(wǎng)RKY89中的亮氨酸拉鏈結(jié)構(gòu)增強(qiáng)蛋白與W盒元件的相互作用[J];科學(xué)通報(bào);2005年10期

8 高國(guó)慶,儲(chǔ)成才,劉小強(qiáng),李楊瑞;植物WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族研究進(jìn)展[J];植物學(xué)通報(bào);2005年01期

9 劉戈宇;胡鳶雷;祝建波;;植物WRKY蛋白家族的結(jié)構(gòu)及其功能[J];生命的化學(xué);2006年03期

10 ;Transcription Factor WRKY70 Displays Important but No Indispensable Roles in Jasmonate and Salicylic Acid Signaling[J];Journal of Integrative Plant Biology;2008年05期

中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 郝俊杰;王海華;陳旭君;郝中娜;郭澤建;;水稻W(wǎng)RKY89參與水稻對(duì)紫外B的耐受性[A];中國(guó)植物病理學(xué)會(huì)2006年學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2006年

2 孫清鵬;王麗芳;于涌鯤;萬(wàn)善霞;郝玉蘭;;番茄WRKY基因的克隆[A];中國(guó)植物病理學(xué)會(huì)2009年學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2009年

3 梁姍姍;于涌鯤;王麗芳;趙福寬;杜希華;孫清鵬;;茉莉酸誘導(dǎo)的番茄WRKY克隆[A];中國(guó)植物生理學(xué)會(huì)第十次會(huì)員代表大會(huì)暨全國(guó)學(xué)術(shù)年會(huì)論文摘要匯編[C];2009年

4 陳益芳;徐謙;王慧;武維華;;擬南芥WRKY轉(zhuǎn)錄因子在植物響應(yīng)低磷脅迫中的功能分析[A];中國(guó)植物學(xué)會(huì)植物細(xì)胞生物學(xué)2010年學(xué)術(shù)年會(huì)論文摘要匯編[C];2010年

5 ;Increased Expression of Rice WRKY30 Gene Enhances Resistance to Sheath Blight and Blast Fungi in Rice[A];中國(guó)植物病理學(xué)會(huì)2011年學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2011年

6 王晨;劉磊;姚凝聰;譚翼;馬會(huì);王夏天;何光源;楊廣笑;;小麥WRKY基因的克隆、表達(dá)分析及其遺傳轉(zhuǎn)化[A];中國(guó)的遺傳學(xué)研究——遺傳學(xué)進(jìn)步推動(dòng)中國(guó)西部經(jīng)濟(jì)與社會(huì)發(fā)展——2011年中國(guó)遺傳學(xué)會(huì)大會(huì)論文摘要匯編[C];2011年

7 ;A group of conserved SPTT domain containing WRKY transcription factors are potential substrates of MAP kinases in plants[A];第六屆中國(guó)植物逆境生理學(xué)與分子生物學(xué)學(xué)術(shù)研討會(huì)論文摘要匯編[C];2010年

8 余迪求;陳利鋼;胡彥如;;擬南芥WRKY8調(diào)控植物多種逆境信號(hào)通路[A];中國(guó)遺傳學(xué)會(huì)第九次全國(guó)會(huì)員代表大會(huì)暨學(xué)術(shù)研討會(huì)論文摘要匯編（2009-2013）[C];2013年

9 鄒長(zhǎng)松;江文波;余迪求;;擬南芥雄配子特異表達(dá)的WRKY34基因負(fù)調(diào)控成熟花粉抗冷性[A];中國(guó)的遺傳學(xué)研究——遺傳學(xué)進(jìn)步推動(dòng)中國(guó)西部經(jīng)濟(jì)與社會(huì)發(fā)展——2011年中國(guó)遺傳學(xué)會(huì)大會(huì)論文摘要匯編[C];2011年

10 REN Yujun;JIANG Jingjing;ZHAO Ziwei;HUANG Dongmei;MIAO Ying;;The single-stranded DNA binding protein WHIRLY1 represses WRKY53 expression and delays leaf senescence in a developmental stage-dependent manner in Arabidopsis thaliana[A];2013全國(guó)植物生物學(xué)大會(huì)論文集[C];2013年

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 劉飛;大麥草酸氧化酶與WRKY轉(zhuǎn)錄因子參與調(diào)控核盤(pán)菌抗性的分子機(jī)理[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

2 謝科;水稻W(wǎng)RKY10基因的功能研究[D];浙江大學(xué);2005年

3 沈懷舜;WRKY家族調(diào)控植物抗逆信號(hào)途徑分子機(jī)制的初步研究[D];復(fù)旦大學(xué);2007年

4 于延沖;擬南芥轉(zhuǎn)錄因子WRKY71對(duì)花和分枝發(fā)育的調(diào)控機(jī)制研究[D];山東大學(xué);2011年

5 王慧;擬南芥WRKY45轉(zhuǎn)錄因子參與響應(yīng)低磷脅迫的實(shí)驗(yàn)證據(jù)[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

6 江文波;擬南芥WRKY2轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的功能研究[D];中國(guó)科學(xué)院研究生院（西雙版納熱帶植物園）;2009年

7 肖俊;水稻W(wǎng)RKY13通過(guò)選擇性結(jié)合不同順式作用元件調(diào)控非生物和生物脅迫信號(hào)路徑間的互作[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年

8 蔣文明;葡萄WRKY30轉(zhuǎn)錄因子對(duì)生物與非生物脅迫的響應(yīng)[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

9 吳坤陸;WRKY基因家族的進(jìn)化及水稻W(wǎng)RKY基因表達(dá)譜的研究[D];浙江大學(xué);2005年

10 張飛萃;擬南芥WRKY28和WRKY42調(diào)控磷吸收和轉(zhuǎn)運(yùn)的機(jī)制研究[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 賈翠玲;葡萄WRKY基因超家族的進(jìn)化分析[D];遼寧師范大學(xué);2010年

2 Abdul Karim;[D];西南大學(xué);2015年

3 王繼穎;楊樹(shù)應(yīng)答鹽脅迫WRKY基因的篩選及功能分析[D];東北林業(yè)大學(xué);2015年

4 嚴(yán)俊;玉米轉(zhuǎn)錄因子ZmWRKY19基因的克隆及功能研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2015年

5 馮虎;刺葡萄0943抗白腐病WRKY調(diào)控因子功能分析[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2015年

6 趙曾強(qiáng);棉花GhWRKY44和GhWRKY22基因的克隆及功能初步分析[D];石河子大學(xué);2015年

7 楊明澤;番茄ShWRKY6基因的抗逆功能研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

8 喬丹娜;玫瑰黃鏈霉菌誘導(dǎo)黃瓜抗線相關(guān)WRKY基因的表達(dá)分析及其藥效試驗(yàn)[D];河北農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

9 楊爍;水稻W(wǎng)RKY68在Xa21介導(dǎo)的抗病途徑中的功能研究[D];河北農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

10 龔巧巧;水稻轉(zhuǎn)錄因子WRKY22在鋁脅迫應(yīng)答中的功能研究[D];浙江大學(xué);2015年

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本文編號(hào)：574785