本文關(guān)鍵詞：microRNA對兒童哮喘靶基因調(diào)控的生物信息學(xué)分析

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【摘要】：目的應(yīng)用生物信息學(xué)技術(shù)分析塵螨過敏哮喘兒童特異性microRNA(miRNA)及其靶基因篩選,探討哮喘發(fā)病機制。方法采用病例對照研究,在62對塵螨過敏哮喘患兒及同齡正常無過敏兒童中,隨機選取12例哮喘患兒及對照者進行microRNA芯片分析,比較兩組中存在異常表達的miRNAs,并在其余病例中進行RT-qPCR驗證和生物信息學(xué)分析。結(jié)果塵螨過敏哮喘兒童中有6個microRNA表達較對照組下調(diào)2倍以上,分別為miRNA-151a-5p、625-5p、126-3p、513a-5p、27b-3p、22-3p,差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05)。進一步的生物信息學(xué)富集分析發(fā)現(xiàn),這些microRNAs調(diào)控的PPARGC1B、CBL、ONECUT2、ESR1、EGFR、SYK、STAT1與炎癥因子信號通路有著顯著性關(guān)聯(lián)(P0.05)。結(jié)論 miRNA-625-5p、513a-5p、27b-3p、22-3p可能通過共同調(diào)控相關(guān)靶基因,形成一個網(wǎng)絡(luò)通路,參與塵螨誘發(fā)兒童哮喘的發(fā)生。
【作者單位】： 上海市兒童醫(yī)院上海交通大學(xué)附屬兒童醫(yī)院呼吸科;上海醫(yī)學(xué)遺傳研究所;
【關(guān)鍵詞】： microRNA 哮喘 生物信息學(xué) 信號通路 兒童
【基金】：上海市衛(wèi)生和計劃生育委員會資助項目(No.20124132)
【分類號】：R725.6
【正文快照】： micro RNA(mi RNA)是非蛋白質(zhì)編碼的小分子RNA,長度約21~25堿基�，F(xiàn)在有越來越多證據(jù)顯示,mi RNA參與了不同生物進程,包括細胞增殖、變異和凋亡。大多數(shù)人類疾病,如各種類型癌癥、代謝、神經(jīng)變性、感染、慢性炎癥和自身免疫性疾病有mi RNA表達和功能異常[1]。這些功能的產(chǎn)生建

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