本文關(guān)鍵詞：應(yīng)用RNA-Seq技術(shù)篩選不同濃度葉酸培養(yǎng)的QSG-7701細胞中的差異表達基因

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【摘要】：目的在驗證不同濃度葉酸培養(yǎng)影響人正常肝細胞系增殖、周期和遷移能力的基礎(chǔ)上,應(yīng)用轉(zhuǎn)錄組測序(RNASeq)技術(shù)篩選差異表達基因,為進一步探討葉酸缺乏與基因差異表達以及正常肝細胞惡性轉(zhuǎn)化之間的相關(guān)性打下基礎(chǔ)。方法不同濃度葉酸培養(yǎng)(無葉酸組0 mg/L,正常葉酸組40 mg/L)的人正常肝細胞系QSG-7701 6個月,應(yīng)用CCK-8實驗檢測細胞增殖、流式細胞技術(shù)檢測細胞周期、細胞凋亡、Transwell小室檢測細胞遷移;利用RNA-Seq技術(shù)對兩組細胞中的mRNA進行檢測,篩選差異mRNA;通過用實時定量PCR對RNA-Seq的結(jié)果進行驗證,并結(jié)合統(tǒng)計學(xué)和生物信息學(xué)方法分析差異mRNA。結(jié)果無葉酸培養(yǎng)顯著提高QSG-7701細胞的增殖能力,促進細胞由靜止期進入分裂期,促進細胞的遷移能力;RNA-Seq檢測得到含有16 774條差異mRNA的數(shù)據(jù)集,初步分析顯示其中391條差異mRNA可能與不同濃度葉酸培養(yǎng)相關(guān),其中上調(diào)的115條,下調(diào)的276條;隨機對其中11條進行實時定量PCR驗證,72.73%的結(jié)果與RNA-Seq一致;分析顯示,差異mRNA相對應(yīng)的基因與細胞周期等生理過程以及多種腫瘤的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān)。結(jié)論最終篩選出參與葉酸調(diào)控正常肝細胞惡性轉(zhuǎn)化相關(guān)的基因,RNA-Seq技術(shù)能有效地用于差異基因地篩選。
【作者單位】： 第二軍醫(yī)大學(xué)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)教研室;
【關(guān)鍵詞】： 葉酸 QSG-細胞 轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù) 基因表達
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項目(81272331)
【分類號】：R151
【正文快照】： 葉酸(Folate,FA)是水溶性B族維生素,因在綠葉蔬菜中含量豐富而得名。葉酸參與了人體眾多重要物質(zhì)的合成和代謝,尤其是DNA的合成和甲基化修飾,然而人體自身只能合成少量葉酸,各種生理過程中所需要的葉酸主要由食物中攝取。近年來大量的流行病學(xué)調(diào)查資料及動物模型實驗皆表明,葉

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2 劉志德;;心臟病患兒的葉酸缺乏[J];國外醫(yī)學(xué)參考資料(兒科學(xué)分冊);1974年03期

3 王時耿;;葉酸缺乏與神經(jīng)系統(tǒng)[J];國外醫(yī)學(xué)參考資料(內(nèi)科學(xué)分冊);1977年08期

4 陳青川,牟世芬;葉酸的需要量研究[J];國外醫(yī)學(xué).衛(wèi)生學(xué)分冊;1996年06期

5 ;葉酸的重要性[J];中國腫瘤;1998年01期

6 朱梅;;準媽咪必做功課——補葉酸[J];婚育與健康;2011年33期

7 陳志春;老藥葉酸有新用[J];醫(yī)藥與保健;1999年11期

8 王留娣 ,朱曉平;葉酸的臨床研究進展[J];醫(yī)學(xué)綜述;2001年07期

9 王青,尹嶺;葉酸治療高同型半胱氨酸血癥38例[J];中國老年學(xué)雜志;2002年03期

10 歐敬民;葉酸與腫瘤發(fā)生[J];國外醫(yī)學(xué).外科學(xué)分冊;2002年02期

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1 張繼軍;石曉麗;王南平;;葉酸功能研究進展[A];營養(yǎng)與慢性病——中國營養(yǎng)學(xué)會第七屆理事會青年工作委員會第一次學(xué)術(shù)交流會議論文集[C];2010年

2 孫淑娜;桂永浩;宋后燕;王躍祥;鐘濤;;葉酸缺乏導(dǎo)致先天性心血管疾病的實驗動物研究[A];中華醫(yī)學(xué)會第十四次全國兒科學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2006年

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本文編號：564086