本文關鍵詞：白樺BpCesA基因的生物信息學及表達分析

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【摘要】：從白樺45個轉錄組數(shù)據中分析獲得6條白樺纖維素合成酶基因,其中2條為該家族的新基因,通過生物信息學及實時定量PCR技術探討白樺Bp Ces A在不同材性白樺中的表達量情況。結果表明,6條白樺Bp Ces A基因的ORF長度在2 958~3 312 bp,編碼的氨基酸數(shù)目在985~1 103 aa,相對分子量在110.40~124.29 k D,理論等電點為5.90~7.43;6條Bp Ces A均含有D,D,D,QXXRW保守結構域和8個跨膜螺旋,其中2個位于N端,6個位于C端。對來自6個雙子葉植物,4個單子葉植物和1個裸子植物的52條Ces A進行了聚類分析發(fā)現(xiàn):白樺Bp Ces A與同為木本的楊樹Ptr Ces A具有較高的同源性,其中Bp Ces A2與Ptr Ces A3同源性達到92%、另外Bp Ces A5與Ptr Ces A6、Bp Ces A1與Ptr Ces A8也具有較高的同源性,分別為89%和82%。Bp Ces A1、Bp Ces A2、Bp Ces A3、Bp Ces A5基因隨纖維素含量的增加,表達量也呈現(xiàn)增加趨勢,推測這些基因在白樺的纖維素合成中起到促進的作用。本研究為揭示纖維素合成酶基因的功能分析提供了基礎。
【作者單位】： 東北林業(yè)大學林木遺傳育種國家重點實驗室;黑龍江省農業(yè)科學院經濟作物研究所;
【關鍵詞】： 白樺 纖維素 木質素 生物信息學 表達量
【基金】：“十二五”農村領域國家科技計劃課題(2012BAD21B02) 東北林業(yè)大學林木遺傳育種國家重點實驗室開放基金項目(201203)~~
【分類號】：S792.153
【正文快照】： 白樺(Betula platyphylla Suk.)屬樺木科(Bet-ulaceae)樺木屬(Betula),廣泛分布于我國東北、華北、西北、西南等14個省區(qū)。白樺形態(tài)優(yōu)美,樹皮光滑潔白,有較高的觀賞價值,適合作為城市綠化樹種[1]。20世紀90年代初白樺被列為國家科技攻關研究對象之一,目前白樺作為國家科技支撐，

本文編號：562350