利用GEO數(shù)據(jù)庫分析結(jié)腸癌中EZH2及其相關(guān)基因的表達(dá)與意義
發(fā)布時間:2017-07-18 06:08
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更多相關(guān)文章: 結(jié)直腸腫瘤 基因表達(dá) EZH 細(xì)胞周期 基因芯片
【摘要】:目的探討果蠅Zeste基因增強子人類同源物(EZH2)在結(jié)腸癌的表達(dá)情況、評估對結(jié)直腸癌患者預(yù)后的意義,并分析預(yù)測與其相關(guān)的基因及細(xì)胞通路。方法通過GEO數(shù)據(jù)庫下載基因芯片GSE17538數(shù)據(jù)內(nèi)包含232例結(jié)直腸癌病例;結(jié)合R2平臺,篩選出與EZH2表達(dá)顯著相關(guān)的基因并進(jìn)行GO和KEGG通路分析;通過Kaplan-Meier法繪制生存曲線,研究EZH2與患者預(yù)后、生存之間的關(guān)系。結(jié)果 232例結(jié)腸癌標(biāo)本中,EZH2的表達(dá)與年齡(χ2=4.426,P=0.035)、AJCC分期(χ2=8.259,P=0.041)和分化程度(χ2=7.301,P=0.026)有關(guān),與性別(χ2=0.622,P=0.430)無關(guān)。全部檢測出與EZH2表達(dá)顯著相關(guān)基因共4 305個(其中正相關(guān)2 240個、負(fù)相關(guān)2 065個),對GO及KEGG通路分析后發(fā)現(xiàn)其中1 509個相關(guān)基因涉及細(xì)胞周期、RNA的轉(zhuǎn)錄、DNA復(fù)制等多個腫瘤發(fā)生、發(fā)展過程。Kaplan-Meier法分析,EZH2的表達(dá)與患者的無病生存期有相關(guān)性(P0.05)。結(jié)論推測EZH2可成為研究患者預(yù)后的分子標(biāo)志物,為未來深入研究提供參考。
【作者單位】: 哈爾濱醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院結(jié)直腸腫瘤外科;哈爾濱醫(yī)科大學(xué)大腸癌研究所;國家癌癥中心/中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院腫瘤醫(yī)院結(jié)直腸外科;
【關(guān)鍵詞】: 結(jié)直腸腫瘤 基因表達(dá) EZH 細(xì)胞周期 基因芯片
【基金】:黑龍江省醫(yī)學(xué)科學(xué)院科研計劃項目(No.201504) 哈爾濱醫(yī)科大學(xué)科研基金(No.KYB2015-30)
【分類號】:R735.35
【正文快照】: 結(jié)直腸腫瘤是目前第3常見的惡性腫瘤。根據(jù)中國癌癥統(tǒng)計分析數(shù)據(jù),2015年結(jié)直腸癌的發(fā)病率和死亡率均位于第5位,并且發(fā)病率和死亡率均呈逐年上升趨勢[1]。結(jié)直腸癌的發(fā)生與發(fā)展是一個多步驟、多因素的過程。隨著近20年來,以核酸測序為代表的高通量組學(xué)分析技術(shù)的日趨成熟,結(jié)直
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1 孫德利,舒琦瑾;基因表達(dá)譜在中醫(yī)藥研究中的意義[J];中國中醫(yī)藥信息雜志;2002年01期
2 劉s,
本文編號:556308
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