人MtHfr基因啟動(dòng)子區(qū)結(jié)合蛋白的生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2017-07-17 13:09
本文關(guān)鍵詞:人MtHfr基因啟動(dòng)子區(qū)結(jié)合蛋白的生物信息學(xué)分析
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【摘要】:目的:對(duì)人N5,N10-亞甲基四氫葉酸還原酶(MTHFR)基因啟動(dòng)子區(qū)結(jié)合蛋白進(jìn)行生物信息學(xué)分析。方法:從GeneBank數(shù)據(jù)庫(kù)中獲取人MTHFR基因5'調(diào)控區(qū),使用在線軟件JASPAR對(duì)該序列可能存在的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測(cè)。結(jié)果:Relative profile score threshold在85%、90%、95%和100%時(shí),該序列存在890、267、73和11個(gè)可能的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn),包含Prrx2、ARID3A、Pax2、AHR、ARID3A、MZF1、MafG、SP1和KLF5等。結(jié)論:人MTHFR基因5'調(diào)控區(qū)存在多種轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn),這些轉(zhuǎn)錄因子大多與神經(jīng)管畸形、腫瘤和心腦血管疾病等有關(guān)。
【作者單位】: 海南醫(yī)學(xué)院理學(xué)院生物技術(shù)專業(yè)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】: 人MTHFR基因 啟動(dòng)子 '調(diào)控區(qū) 轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)
【基金】:海南醫(yī)學(xué)院人才引進(jìn)基金項(xiàng)目(No.2013005)
【分類號(hào)】:Q811.4
【正文快照】: 0引言5,10-亞甲基四氫葉酸還原酶(5,10-methylenetetrahydrofolate, MTHFR, E.C.1.1.1.68)是一種黃素蛋白,在葉酸代謝過(guò)程及同型半胱氨酸(homocysteine, Hcy)重新甲基化為甲硫氨酸所需中起著重要作用的一個(gè)關(guān)鍵酶,其生化功能為可催化5,10-亞甲基四氫葉酸轉(zhuǎn)換成5-甲基四氫葉酸
【相似文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 況守龍;胡廷章;;啟動(dòng)子的克隆和研究方法[J];重慶工學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2007年01期
2 李志新;曹雙河;張相岐;張懷剛;;偽鵝觀草高分子量麥谷蛋白基因啟動(dòng)子的克隆[J];長(zhǎng)江大學(xué)學(xué)報(bào)(自科版)農(nóng)學(xué)卷;2007年02期
3 高剛;魯艷芹;韓金祥;趙麗;;雙啟動(dòng)子對(duì)增強(qiáng)型綠色熒光蛋白表達(dá)的影響[J];中國(guó)生物制品學(xué)雜志;2009年10期
4 郝迪,
本文編號(hào):553721
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