本文關(guān)鍵詞：梁山慈竹UGP基因克隆與生物信息學(xué)分析

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【摘要】：以梁山慈竹筍為材料,采用RT-PCR方法克隆梁山慈竹UGP基因,對(duì)梁山慈竹UGP基因的編碼區(qū)、氨基酸序列及蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能進(jìn)行生物信息學(xué)分析。獲得1個(gè)梁山慈竹UGP基因,命名為Df UGP(Genebank:KJ525752)。測(cè)序結(jié)果顯示該序列全長(zhǎng)1561 bp,包含一個(gè)完整的ORF框,長(zhǎng)度為1422 bp,編碼473個(gè)氨基酸。梁山慈竹UGP基因與巨龍竹、綠竹、水稻、大麥、玉米、甘蔗的具有高度的同源相似性,編碼的蛋白結(jié)構(gòu)較為相似,均含有N端區(qū)域、中心區(qū)域和C端區(qū)域,且蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)中都具有NBloop環(huán)和l-loop環(huán)。Df UGP具有N端的UDPGP功能域,其位于第90~379氨基酸,證明Df UGP屬于尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因家族。
【作者單位】： 西南科技大學(xué)植物細(xì)胞工程實(shí)驗(yàn)室;四川省生物質(zhì)資源利用與改性工程技術(shù)研究中心;
【關(guān)鍵詞】： 梁山慈竹 UGP 克隆 生物信息學(xué)
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金青年基金項(xiàng)目(31400257;31400333) 四川省“十二五”重點(diǎn)公關(guān)資助項(xiàng)目(2011YZGG-10) 四川省應(yīng)用基礎(chǔ)研究基金資助項(xiàng)目(2013JY0182) 四川省生物質(zhì)資源利用與改性工程技術(shù)研究中心基金資助(12zxsk07;13zxsk01)
【分類號(hào)】：S795.5
【正文快照】： 梁山慈竹纖維質(zhì)量好、含量豐富,在四川已經(jīng)形成了以其為龍頭的竹漿造紙工業(yè)產(chǎn)業(yè)鏈[1],然而在造紙過程中原料中纖維素和木質(zhì)素的含量將直接影響制漿率和紙的質(zhì)量[2]。以往研究發(fā)現(xiàn),纖維素的生物合成需要多種酶協(xié)同參與[3],而UGPase可能起著重要作用。UGPase又稱尿苷二磷酸葡萄

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：552781