本文關(guān)鍵詞：谷子ARF基因家族的鑒定與生物信息學(xué)分析

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【摘要】：生長素應(yīng)答因子(ARF,auxin response factors)是一類可以結(jié)合在生長素應(yīng)答基因啟動子部位的轉(zhuǎn)錄因子,在植物的生長發(fā)育中起至關(guān)重要的作用。本研究以谷子為材料,共鑒定出24個ARF基因,命名為Si ARFs。利用生物信息學(xué)對谷子Si ARFs基因的結(jié)構(gòu)、染色體分布、基因倍增模式、系統(tǒng)進化以及基因的表達模式進行分析。結(jié)果表明,Si ARF基因家族在染色體上呈不均勻分布,除2號染色體外,其他染色體上都有該家族基因,基因的擴增模式為分散復(fù)制與片段復(fù)制。Si ARFs基因家族具有相對保守的結(jié)構(gòu),即包含1個保守的B3 DNA結(jié)構(gòu)域、ARF結(jié)構(gòu)域和Aux/IAA結(jié)構(gòu)域,ARF蛋白的3D結(jié)構(gòu)含有3個α螺旋和7個β折疊結(jié)構(gòu)。進化樹分析表明谷子ARF蛋白和物種相近的高粱、玉米聚在一起。大多數(shù)ARF基因在谷子根、莖、葉和穗中都有表達,且不同基因表達量有較大差異。
【作者單位】： 河北北方學(xué)院;河北省農(nóng)林科學(xué)院谷子研究所;
【關(guān)鍵詞】： 谷子 ARF 生物信息學(xué)分析 蛋白結(jié)構(gòu)
【基金】：國家科技重大專項(2014ZX0800909B) 河北省高等學(xué)科拔尖人才選拔與培養(yǎng)計劃(BRZ-234) 河北北方學(xué)院重大項目(ZD201305);河北北方學(xué)院作物學(xué)重點實驗室
【分類號】：S515
【正文快照】： URL:http://www.cnki.net/kcms/detail/11.4996.S.20160406.1117.012.html第一作者研究方向為藥物化學(xué)。E-mail:929353642@qq.com生長素(auxin)是發(fā)現(xiàn)最早、研究最多、在植物體內(nèi)普遍存在的植物激素。生長素在植物的頂端優(yōu)勢、微管的分化、胚胎的分化、根和莖的形態(tài)建成等植物

【參考文獻】

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【共引文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 趙艷;甕巧云;馬海蓮;宋晉輝;袁進成;王凌云;董志平;劉穎慧;;谷子ARF基因家族的鑒定與生物信息學(xué)分析[J];植物遺傳資源學(xué)報;2016年03期

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【二級參考文獻】

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【相似文獻】

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

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本文編號：547730