本文關(guān)鍵詞：谷子ARF基因家族的鑒定與生物信息學(xué)分析

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【摘要】：生長(zhǎng)素應(yīng)答因子(ARF,auxin response factors)是一類可以結(jié)合在生長(zhǎng)素應(yīng)答基因啟動(dòng)子部位的轉(zhuǎn)錄因子,在植物的生長(zhǎng)發(fā)育中起至關(guān)重要的作用。本研究以谷子為材料,共鑒定出24個(gè)ARF基因,命名為Si ARFs。利用生物信息學(xué)對(duì)谷子Si ARFs基因的結(jié)構(gòu)、染色體分布、基因倍增模式、系統(tǒng)進(jìn)化以及基因的表達(dá)模式進(jìn)行分析。結(jié)果表明,Si ARF基因家族在染色體上呈不均勻分布,除2號(hào)染色體外,其他染色體上都有該家族基因,基因的擴(kuò)增模式為分散復(fù)制與片段復(fù)制。Si ARFs基因家族具有相對(duì)保守的結(jié)構(gòu),即包含1個(gè)保守的B3 DNA結(jié)構(gòu)域、ARF結(jié)構(gòu)域和Aux/IAA結(jié)構(gòu)域,ARF蛋白的3D結(jié)構(gòu)含有3個(gè)α螺旋和7個(gè)β折疊結(jié)構(gòu)。進(jìn)化樹分析表明谷子ARF蛋白和物種相近的高粱、玉米聚在一起。大多數(shù)ARF基因在谷子根、莖、葉和穗中都有表達(dá),且不同基因表達(dá)量有較大差異。
【作者單位】： 河北北方學(xué)院;河北省農(nóng)林科學(xué)院谷子研究所;
【關(guān)鍵詞】： 谷子 ARF 生物信息學(xué)分析 蛋白結(jié)構(gòu)
【基金】：國(guó)家科技重大專項(xiàng)(2014ZX0800909B) 河北省高等學(xué)科拔尖人才選拔與培養(yǎng)計(jì)劃(BRZ-234) 河北北方學(xué)院重大項(xiàng)目(ZD201305);河北北方學(xué)院作物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
【分類號(hào)】：S515
【正文快照】： URL:http://www.cnki.net/kcms/detail/11.4996.S.20160406.1117.012.html第一作者研究方向?yàn)樗幬锘瘜W(xué)。E-mail:929353642@qq.com生長(zhǎng)素(auxin)是發(fā)現(xiàn)最早、研究最多、在植物體內(nèi)普遍存在的植物激素。生長(zhǎng)素在植物的頂端優(yōu)勢(shì)、微管的分化、胚胎的分化、根和莖的形態(tài)建成等植物

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

1 司馬曉嬌;鄭炳松;;植物生長(zhǎng)素原初響應(yīng)基因Aux/IAA研究進(jìn)展[J];浙江農(nóng)林大學(xué)學(xué)報(bào);2015年02期

2 李曉燕;陳雪梅;蓋穎;;楊樹不同組織中ARF表達(dá)與生長(zhǎng)素相關(guān)性研究[J];廣東農(nóng)業(yè)科學(xué);2013年06期

【共引文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

1 趙艷;甕巧云;馬海蓮;宋晉輝;袁進(jìn)成;王凌云;董志平;劉穎慧;;谷子ARF基因家族的鑒定與生物信息學(xué)分析[J];植物遺傳資源學(xué)報(bào);2016年03期

2 李愛;于雪;馮濤;李慧;于瑋瑋;彭立新;;落葉松生長(zhǎng)素受體基因LkTIR1的克隆及功能分析[J];植物生理學(xué)報(bào);2016年01期

【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前5條

1 何勇清;方佳;余敏芬;方仲相;江波;潘寅輝;鄭炳松;;植物質(zhì)膜內(nèi)在水通道蛋白PIPs的分子生物學(xué)研究進(jìn)展[J];浙江農(nóng)林大學(xué)學(xué)報(bào);2012年03期

2 張俊紅;孟成生;張彩英;史崢;王笑穎;李愛麗;馬峙英;;小麥和水稻auxin基因家族的生物信息學(xué)比較分析[J];華北農(nóng)學(xué)報(bào);2009年06期

3 鄭炳松;陳苗;褚懷亮;艾雪;黃有軍;李雪芹;黃堅(jiān)欽;;用cDNA-AFLP技術(shù)分析山核桃嫁接過程中的CcARF基因表達(dá)[J];浙江林學(xué)院學(xué)報(bào);2009年04期

4 王正加;黃有軍;夏國(guó)華;鄭炳松;金松恒;黃堅(jiān)欽;;山核桃APETALA1同源基因的克隆與序列分析[J];浙江林學(xué)院學(xué)報(bào);2008年04期

5 董秀春;樊金會(huì);于學(xué)寧;束懷瑞;;一個(gè)屬于Aux/IAA基因家族的毛白楊PtIAA1的克隆和序列分析(英文)[J];分子植物育種;2007年04期

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 劉艷;玉米全基因組ARF基因的分析及進(jìn)化研究[D];安徽農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年

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本文編號(hào)：547730