發(fā)布時(shí)間：2017-07-04 10:09

  本文關(guān)鍵詞：蘭州鲇MyoD基因的克隆與生物信息學(xué)分析

  更多相關(guān)文章： 蘭州鲇(Silurus lanzhouensis) MyoD 基因克隆 生物信息學(xué)

【摘要】：為研究蘭州鲇(Silurus lanzhouensis)生長性狀相關(guān)基因,運(yùn)用RT-PCR、TA克隆和核酸測(cè)序等技術(shù)對(duì)蘭州鲇MyoD基因的CDS區(qū)及全基因進(jìn)行克隆和生物信息學(xué)分析。獲得蘭州鲇MyoD基因的完整CDS區(qū)序列810 bp(Gen Bank登錄號(hào):KT277551)及MyoD基因全序列1 210 bp(Gen Bank登錄號(hào):KT339175),包括部分5'端63 bp和3'端58 bp;ORF區(qū)含有3個(gè)外顯子和2個(gè)內(nèi)含子,外顯子長度分別為510 bp、80 bp和220 bp,內(nèi)含子長度分別為156 bp和123 bp,編碼269個(gè)氨基酸殘基組成的可溶酸性蛋白質(zhì);預(yù)測(cè)亞細(xì)胞定位MyoD主要分布于細(xì)胞核(56.5%),MyoD二聚體結(jié)構(gòu)是一個(gè)螺旋-環(huán)-螺旋(b HLH)�；�12種魚類MyoD基因CDS序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹及編碼區(qū)同源性比較,分析結(jié)果表明,MyoD基因編碼區(qū)在進(jìn)化過程中比較保守,且蘭州鲇MyoD與斑點(diǎn)叉尾、白鯰魚、藍(lán)鯰魚之間存在較高的同源性。
【作者單位】： 甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院;寧夏回族自治區(qū)水產(chǎn)研究所;寧夏漁業(yè)工程技術(shù)研究中心;
【關(guān)鍵詞】： 蘭州鲇(Silurus lanzhouensis) MyoD 基因克隆 生物信息學(xué)
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31360633) 寧夏對(duì)外科技合作項(xiàng)目 寧夏自然科學(xué)基金(NZ14212) 國家科技支撐計(jì)劃項(xiàng)目(2012BAD25B09)
【分類號(hào)】：S917.4
【正文快照】： 提高魚類生長速度和抗性成為目前魚類育種研究領(lǐng)域的熱點(diǎn)。已有研究表明,魚類肌肉生長主要受生肌調(diào)節(jié)因子MRFs家族(Myogenic regulatoryfactors)調(diào)控[1],該家族包括Myo D、Myo G、Myf5和MRF4轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子,其中Myo D基因的全稱是成肌分化抗原(Myogenic differentiation antigen

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本文編號(hào)：517341