本文關(guān)鍵詞：香蕉miRNA及其靶基因的生物信息學(xué)預(yù)測(cè)

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【摘要】：利用生物信息學(xué)方法預(yù)測(cè)香蕉中的miRNA,即通過將miRBase數(shù)據(jù)庫(kù)中的已知植物的miRNA與香蕉EST和GSS數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行BLAST比對(duì)搜索,篩選出潛在的miRNA,最后得到16條香蕉miRNA,分屬于9個(gè)miRNA家族,其中3條來源于EST數(shù)據(jù)庫(kù),13條來源于GSS數(shù)據(jù)庫(kù),并利用在線軟件psRNATarget預(yù)測(cè)其靶基因,共得到168個(gè)靶基因,分別編碼多種功能蛋白,參與各生物學(xué)過程。
【作者單位】： 海南大學(xué)農(nóng)學(xué)院/海南省熱帶生物資源可持續(xù)利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 香蕉 microRNA 靶基因 生物信息學(xué)分析
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(31360364) 教育部熱帶作物新品種選育工程中心與作物學(xué)重點(diǎn)學(xué)科聯(lián)合資助項(xiàng)目(lhxm-2012-2) 海南省重大科技項(xiàng)目(ZDZX2013023) “中央財(cái)政支持中西部高校提升綜合實(shí)力專項(xiàng)”子課題
【分類號(hào)】：S668.1;Q943.2
【正文快照】：

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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7 記者 王雪飛;我國(guó)科學(xué)家向政府建議——加強(qiáng)生物信息學(xué)學(xué)科建設(shè)[N];健康報(bào);2000年

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9 王雪飛 吳黎;中國(guó)生物信息學(xué)研究快速發(fā)展[N];健康報(bào);2002年

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本文編號(hào)：516169