桂花組織基因表達中熒光定量PCR內參基因的篩選
本文關鍵詞:桂花組織基因表達中熒光定量PCR內參基因的篩選
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【摘要】:為了篩選桂花Osmanthus fragrans不同組織基因表達分析中適合的內參基因,以桂花‘堰虹桂’O.fragrans‘YanhongGui’花蕾、盛開花序、嫩葉、成熟葉和1年生莖等5個不同組織為材料,利用實時熒光定量聚合酶鏈式反應(qRT-PCR)檢測7個候選內參基因的表達水平,并利用geNorm,NormFinder和BestKeeper軟件對各候選內參基因的表達穩(wěn)定性進行評價,最后利用桂花不同組織中OfCRTISO1基因相對表達水平驗證篩選的內參基因的可靠性。結果表明:綜合3個軟件的評價排序,確定不同組織中最佳內參基因為OfRAN1和OfUBC2,而Of18S是最差內參基因。OfCRTISO1基因相對表達水平分析證實,不同組織中qRT-PCR分析使用OfRAN1和OfUBC2等2個表達最穩(wěn)定的基因組合,即可獲得更為精確的基因表達結果。旨在為桂花組織間重要基因的定量表達分析提供科學依據。
【作者單位】: 浙江農林大學風景園林與建筑學院;浙江農林大學亞熱帶森林培育國家重點實驗室培育基地;
【關鍵詞】: 植物學 桂花 內參基因 geNorm NormFinder BestKeeper
【基金】:國家自然科學基金資助項目(31501790,31170656) 浙江省自然科學基金資助項目(LQ15C160004) 浙江農林大學科研發(fā)展基金人才啟動項目(2014FR072)
【分類號】:S685.13;Q943.2
【正文快照】: 實時熒光定量聚合酶鏈式反應(quantitative real time fluorescence polymerase chain reaction,q RT-PCR)因具有靈敏度高、特異性強、精準性高、檢測范圍廣等優(yōu)點[1],已被廣泛應用于植物基因表達的相關研究中。利用q RT-PCR分析基因相對定量表達時,為了消除不同組織細胞間初
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