發(fā)布時(shí)間：2017-07-02 08:08

  本文關(guān)鍵詞：利用GoldenGate分析的高通量SNP芯片對(duì)鯉基因進(jìn)行分型，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：單核苷酸多態(tài)性(SNPs)標(biāo)記在大多數(shù)物種基因組中數(shù)量巨大且分布均勻,是許多水產(chǎn)物種遺傳研究的理想標(biāo)記,因此快速發(fā)展了幾種高通量、快速的SNP標(biāo)記分型平臺(tái)。本研究利用Golden Gate分析技術(shù)對(duì)鯉Cyprinus carpio轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的1 536個(gè)SNP標(biāo)記合成了一張中等密度SNP芯片,對(duì)5個(gè)鯉群體的480份樣本進(jìn)行基因分型。結(jié)果表明:1 235個(gè)SNP標(biāo)記成功分型,約占80%;915個(gè)標(biāo)記至少在一個(gè)家系中呈現(xiàn)多態(tài)性,占74.1%;標(biāo)記最小等位基因頻率(MAF)介于0.05~0.5之間,平均為0.334,其中48.9%的標(biāo)記最小等位基因頻率(MAF)大于平均值;5個(gè)群體中SNP標(biāo)記平均多態(tài)性信息含量(PIC)在0.3左右,為中度多態(tài),雜合度為0.010~0.990,平均為0.5左右,暗示群體具有豐富的遺傳多態(tài)性,育種價(jià)值及性狀改良潛力很大。本研究分型的多態(tài)性SNP標(biāo)記可廣泛應(yīng)用于遺傳多樣性研究、標(biāo)記-性狀關(guān)聯(lián)分析以及分子標(biāo)記輔助育種。
【作者單位】： 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院黑龍江水產(chǎn)研究所淡水魚(yú)類(lèi)育種國(guó)家地方聯(lián)合工程實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 單核苷酸多態(tài)(SNP) 鯉 遺傳多樣性 Golden Gate分析 高通量
【基金】：中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院基本業(yè)務(wù)費(fèi)重點(diǎn)項(xiàng)目(2016ZD0301) 農(nóng)業(yè)部“948”計(jì)劃項(xiàng)目(2016-X15)
【分類(lèi)號(hào)】：S917.4
【正文快照】： 隨著各種分子標(biāo)記技術(shù)的應(yīng)用,在過(guò)去20多年中鯉Cyprinus carpio遺傳研究得到快速發(fā)展。應(yīng)用比較廣的標(biāo)記有基于雜交技術(shù)的RFLPs[1](Re-striction fragment length polymorphism)標(biāo)記和基于PCR技術(shù)的SSRs[2](Microsatellite polymorphism)標(biāo)記。理想的分子標(biāo)記系統(tǒng)應(yīng)數(shù)量巨大且

【相似文獻(xiàn)】

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  本文關(guān)鍵詞：利用GoldenGate分析的高通量SNP芯片對(duì)鯉基因進(jìn)行分型，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號(hào)：509093