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江蘇省2015年柯薩奇病毒A組16型VP1基因特征

發(fā)布時間:2017-06-27 04:03

  本文關(guān)鍵詞:江蘇省2015年柯薩奇病毒A組16型VP1基因特征,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:分析江蘇省2015年柯薩奇病毒A組16型(CA16)分離株VP1基因特征。對江蘇省2015年分離得到的20株CA16毒株進行VP1區(qū)基因擴增和擴增產(chǎn)物測序,并應(yīng)用Mega 6.0和DNA Star軟件對其構(gòu)建基因進化樹并分析核苷酸和氨基酸同源性。20株CA16分離株VP1核苷酸和氨基酸同源性分別為88.2%~100.0%和98.0%~100.0%;與A型國際原型株G10核苷酸和氨基酸同源性分別為75.3%~77.4%和90.6%~92.3%;與B1型代表株核苷酸和氨基酸同源性分別為88.3%~98.4%和96.3%~100.0%;與B2型代表株核苷酸和氨基酸同源性分別為88.4%~90.8%和96.6%~100.0%。20株CA16分離株基因亞型均為B1型,其中19株為B1b型,1株為B1a型,并有1個B1b傳播鏈。江蘇省2015年CA16分離株屬于B1基因亞型,存在B1a和B1b兩個進化分支共同進化和循環(huán),其中以B1b為絕對優(yōu)勢流行株。
【作者單位】: 常州市疾病預(yù)防控制中心檢測檢驗中心;江蘇省疾病預(yù)防控制中心;
【關(guān)鍵詞】手足口病 柯薩奇病毒A組型 VP B
【基金】:國家自然科學(xué)基金青年基金(項目號:81402732),題目:重癥手足口病后遺癥隊列隨訪及其病原演變的特征性研究
【分類號】:R512.5
【正文快照】: 手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)是一種兒童常見傳染病,尤其以5歲以內(nèi)的兒童為易感群體。多種腸道病毒(Enterovirus,EV)均可引起HFMD,其中EV71和CA16是最常見的病原體[1]。2008年安徽阜陽暴發(fā)了以EV71為主要病原體的HFMD群體事件[2],同年衛(wèi)生部將HFMD納入《中華人

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