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基于稀疏類別保留投影的基因表達(dá)數(shù)據(jù)降維方法

發(fā)布時(shí)間:2017-06-26 17:13

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【摘要】:針對(duì)基因表達(dá)數(shù)據(jù)高維小樣本特性所帶來(lái)的維數(shù)災(zāi)難問(wèn)題,結(jié)合回歸和類別保留投影方法,提出一種新的基因表達(dá)數(shù)據(jù)降維方法,叫稀疏類別保留投影.相比類別保留投影,能有效避免類別保留投影在基因表達(dá)數(shù)據(jù)降維上存在的矩陣奇異和過(guò)擬合問(wèn)題.通過(guò)對(duì)真實(shí)基因表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行數(shù)據(jù)可視化和分類識(shí)別,驗(yàn)證了方法的有效性.
【作者單位】: 西安電子科技大學(xué)計(jì)算機(jī)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】基因表達(dá)數(shù)據(jù) 高維小樣本 類別保留投影 回歸
【基金】:中央高;究蒲袠I(yè)務(wù)費(fèi)專項(xiàng)資金(No.JB140310)
【分類號(hào)】:TP274
【正文快照】: 1引言基于基因表達(dá)數(shù)據(jù)[1~3]的腫瘤分類[4~6]研究對(duì)癌癥診療有著非常重要的意義.基因表達(dá)數(shù)據(jù)的高維小樣本特性,成為傳統(tǒng)模式分類研究的瓶頸.如何有效降低基因表達(dá)數(shù)據(jù)的維數(shù),成為基因表達(dá)數(shù)據(jù)分類研究的關(guān)鍵問(wèn)題之一.為克服這一問(wèn)題,已有學(xué)者嘗試開(kāi)發(fā)基因表達(dá)數(shù)據(jù)降維方法.這

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