發(fā)布時(shí)間：2017-06-25 04:14

  本文關(guān)鍵詞：PCR-SSCP技術(shù)與比較基因組學(xué)結(jié)合定位棉花Li1基因，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-單鏈構(gòu)象多態(tài)性(polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism,PCR-SSCP)作為一種能檢測基因組間DNA堿基微小差異的技術(shù)手段,具有操作簡便、快捷且靈敏度高等優(yōu)點(diǎn)。比較基因組學(xué)近年來已經(jīng)成為研究生物基因組的最主要手段之一;大量基因組序列的產(chǎn)生為通過比較基因組學(xué)開發(fā)新標(biāo)記和定位目標(biāo)基因提供了大量的DNA序列資源。本研究以李氏超短纖維突變體(Ligon lintless-1,Li1)為材料,定位Li1基因,針對PCR擴(kuò)增產(chǎn)物片段較大的樣品(400bp)進(jìn)行PCR-SSCP技術(shù)的優(yōu)化,用已發(fā)表的擬南芥(Arabidopsis thaliana)和棉花(Gossypium spp.)D基因組DNA序列為參考,探索PCR-SSCP技術(shù)與比較基因組學(xué)結(jié)合開發(fā)新標(biāo)記應(yīng)用于棉花基因定位的可能性。結(jié)果表明,電壓為150 V,膠濃度為10%,電泳溫度為4℃時(shí)電泳結(jié)果最好;上樣緩沖液與PCR擴(kuò)增目的片段比例為5∶1為最佳比例。利用上述優(yōu)化的PCR-SSCP技術(shù)將根據(jù)棉花與擬南芥同線性區(qū)段開發(fā)的分子標(biāo)記構(gòu)建了一個(gè)由28個(gè)標(biāo)記組成的長度為149.6 c M的遺傳圖,該區(qū)域包含4個(gè)功能上與Li1位點(diǎn)密切相關(guān)的基因。此外,利用D基因組序列開發(fā)的標(biāo)記構(gòu)建了一個(gè)由17個(gè)SSCP標(biāo)記和Li1位點(diǎn)組成,跨越40.3c M的遺傳圖譜,距其最近的兩端標(biāo)記W058和P095分別為0.6和0.3 c M。本研究為棉花Li1基因的精細(xì)定位及其候選基因的克隆提供了理論基礎(chǔ)。
【作者單位】： 浙江農(nóng)林大學(xué)林業(yè)與生物技術(shù)學(xué)院;浙江農(nóng)林大學(xué)農(nóng)業(yè)與食品科學(xué)學(xué)院;中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所/棉花生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 棉花 PCR-SSCP 李氏超短纖維突變體(Li) 比較基因組學(xué) 遺傳作圖
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(No.31301372) 農(nóng)業(yè)部轉(zhuǎn)基因生物新品種培育重大專項(xiàng)(No.2014ZX08005-005) 浙江省教育廳一般項(xiàng)目(No.Y201328631) 棉花生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開放項(xiàng)目(No.CB2014A06)
【分類號】：S562
【正文快照】： 花生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,安陽455000在大型真核基因組研究中,DNA標(biāo)記在遺傳圖譜構(gòu)建、基因定位和克隆,以及作物新品種標(biāo)記輔助育種中被廣泛開發(fā)和應(yīng)用(Wang et al.,2014;Roychowdhury et al.,2012)。目前用到的分子標(biāo)記技術(shù)主要有:限制性片段長度多態(tài)性(restrictionfragment l

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2 代君麗,李振岐;小麥的比較基因組學(xué)和功能基因組學(xué)[J];西北植物學(xué)報(bào);2004年05期

3 廖承紅;宿兵;;靈長類比較基因組學(xué)的研究進(jìn)展[J];動物學(xué)研究;2012年01期

4 黎裕,王天宇;玉米比較基因組學(xué)研究進(jìn)展[J];生物技術(shù)通報(bào);2004年01期

5 王源秀;徐立安;黃敏仁;許遠(yuǎn);;林木比較基因組學(xué)研究進(jìn)展[J];遺傳;2007年10期

6 ;比較基因組學(xué)揭示哺乳動物基因組脆性區(qū)域“產(chǎn)生與消亡”的過程[J];廣東農(nóng)業(yè)科學(xué);2010年12期

7 張森,李輝,顧志剛;功能基因組學(xué)研究的有力工具——比較基因組學(xué)[J];東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2005年05期

8 方榮;陳學(xué)軍;繆南生;涂偉鳳;;茄科植物比較基因組學(xué)研究進(jìn)展[J];江西農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào);2007年02期

9 王衛(wèi)鋒;;煙草基因組知識篇:6.比較基因組學(xué)[J];中國煙草科學(xué);2010年06期

10 艾華水;胡小芬;周利華;;豬Mitf基因的比較基因組學(xué)和進(jìn)化分析[J];生物技術(shù)通報(bào);2010年07期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前9條

1 時(shí)碩永;丁達(dá)夫;;Ortholog關(guān)系的判別與功能辨認(rèn)率的提高[A];中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)會第八屆會員代表大會暨全國學(xué)術(shù)會議論文摘要集[C];2001年

2 景志忠;才學(xué)鵬;李輝;;模式生物與比較基因組學(xué)研究進(jìn)展[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會2004學(xué)術(shù)年會暨第五屆全國畜牧獸醫(yī)青年科技工作者學(xué)術(shù)研討會論文集（下冊）[C];2004年

3 張勝利;周巖;;禾谷類作物比較基因組學(xué)研究[A];河南省細(xì)胞生物學(xué)學(xué)會第二屆會員代表大會暨學(xué)術(shù)研討會論文摘要集[C];2009年

4 曾昭清;余知和;;比較基因組學(xué)研究方法——真菌基因組比較分析為例[A];基因開啟未來：新時(shí)代的遺傳學(xué)與科技進(jìn)步——湖北省遺傳學(xué)會第八次代表大會暨學(xué)術(shù)討論會論文摘要匯編[C];2009年

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6 趙金榮;王曉玲;白羊年;;豆科植物比較基因組學(xué)研究進(jìn)展[A];海南生物技術(shù)研究與發(fā)展研討會論文集[C];2006年

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8 伍曉雄;楊鍔;戴漢川;唐中林;趙京楊;曾翠平;龍良啟;吳健;徐在言;李奎;;豬CTNNB1基因的克隆及在不同組織中的表達(dá)分析[A];全國動物生理生化第十次學(xué)術(shù)交流會論文摘要匯編[C];2008年

9 詹凱;徐桂云;楊寧;;鴨甲狀腺激素應(yīng)答基因(THRSPα)比較基因組學(xué)研究[A];2009中國肉鴨產(chǎn)業(yè)發(fā)展高層論壇論文集[C];2009年

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1 胡德榮;黑猩猩為何不及人聰明？[N];中國醫(yī)藥報(bào);2004年

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1 劉娜;比較基因組學(xué)平臺的設(shè)計(jì)與構(gòu)建[D];南方醫(yī)科大學(xué);2010年

2 孫晨;比較基因組學(xué)信息可視化系統(tǒng)（CGVS系統(tǒng)）開發(fā)與應(yīng)用[D];中國科學(xué)院北京基因組研究所;2013年

3 王志強(qiáng);白氏文昌魚BAC測序與比較基因組學(xué)分析[D];廣西大學(xué);2007年

4 王雪;盤基網(wǎng)柄菌的比較基因組學(xué)初步研究[D];吉林農(nóng)業(yè)大學(xué);2008年

5 胡yN瑤;比較基因組學(xué)可視化工具Geno2Cir及其在裸子植物葉綠體基因組比較的應(yīng)用[D];復(fù)旦大學(xué);2013年

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7 梁永宏;植物ACS家族的比較基因組學(xué)研究[D];陜西師范大學(xué);2012年

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