洋蔥AcLOX1基因的克隆及其表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2017-06-25 00:11
本文關(guān)鍵詞:洋蔥AcLOX1基因的克隆及其表達(dá)分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:脂氧合酶(lipoxygenase,LOX)是植物十八碳酸代謝途徑的關(guān)鍵酶,與種子老化密切相關(guān)。洋蔥(Allium cepa)種子為短壽命種子。研究LOX基因與洋蔥種子發(fā)育及老化的關(guān)系具有重要的意義。本研究以洋蔥授粉后的子房和種子為材料,利用RT-PCR結(jié)合快速克隆c DNA末端(rapid-amplification of c DNA ends,RACE)技術(shù),獲得Ac LOX1(Gen Bank登錄號:KU363822)基因全長。用生物信息學(xué)方法對其基因序列特征進(jìn)行分析;利用RT-PCR和q RT-PCR分析Ac LOX1在洋蔥不同部位、種子發(fā)育過程以及種子儲存過程中的表達(dá)模式。結(jié)果表明,該基因全長為2 847 bp,包含一個(gè)2 619 bp的開放閱讀框,編碼873個(gè)氨基酸。氨基酸序列分析表明,Ac LOX1具有PLAT_LH2(polycystin-1,lipoxygenase,alpha-toxin_lipoxygenase homology)和LOX兩種結(jié)構(gòu)域;與桉樹(Eucalyptus grandis)、杏(Prunus dulcis)、葡萄(Vitis vinifera)等物種的LOX基因氨基酸序列同源性高達(dá)66%~73%。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析表明,Ac LOX1與其他物種的9-LOX聚在一起。時(shí)空表達(dá)模式表明,Ac LOX1基因在洋蔥各組織中均有表達(dá),在授粉后5~25 d隨著時(shí)間增長其表達(dá)量增加,但在授粉后25 d到成熟及儲存一年的種子中少量持續(xù)表達(dá)。本實(shí)驗(yàn)初步證實(shí)了Ac LOX1對洋蔥種子發(fā)育具有促進(jìn)作用且與種子老化相關(guān)聯(lián),為闡明洋蔥種子短壽命的作用機(jī)制提供了理論依據(jù)。
【作者單位】: 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝園林學(xué)院;北京農(nóng)林科學(xué)院蔬菜研究中心/農(nóng)業(yè)部華北地區(qū)園藝作物生物學(xué)與種質(zhì)創(chuàng)制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】: 洋蔥 種子老化 洋蔥脂氧合酶基因(AcLOX) 克隆 功能分析
【基金】:國家自然科學(xué)基金(No.31372066) 北京市自然科學(xué)基金(No.6132016) 北京市農(nóng)林科學(xué)院科技創(chuàng)新能力建設(shè)專項(xiàng)(No.KJCX2014011)
【分類號】:S633.2
【正文快照】: 北京100097洋蔥(Allium cepa)為蔥科(Alliaceae)蔥屬(Alli-um)二年生草本植物,在我國南北各地均有栽培,是我國重要的出口蔬菜之一。由于洋蔥種子為短壽命種子(屈冬玉,李樹德,2001),嚴(yán)重影響洋蔥產(chǎn)業(yè)的發(fā)展,因此研究種子老化機(jī)制對提高種子活力和實(shí)際生產(chǎn)具有重要意義。關(guān)于蔥
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本文編號:480056
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